Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472884
• Subject: XM_006529810.3
• Aligned Length: 1184
• Identities: 974
• Gaps: 82

Alignment

Query    1  ATGGACCTCTTCGGGGACCTGCCGGAGCCCGAGCGCTCGCCGCGCCCGGCTGCCGGGAAAGAAGCTCAGAAAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||..||||||||||.|||||.|||..|.|
Sbjct    1  ATGGACCTCTTCGGGGACCTGCCGGAGCCCGAGCGCGCGCCGCGGCCATCTGCCGGGAAGGAAGCACAGGGACG  74

Query   75  ACCCCTGCTCTTTGATGACCTCCCTCCGGCCAGCAGTACTGACTCAGGATCAGGGGGACCTTTGCTTTTTGATG  148
            ||||.||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct   75  ACCCGTGCTCTTTGAGGACCTGCCCCCGGCCAGCAGTACTGACTCAGGCTCTGGGGGACCTTTACTCTTTGATG  148

Query  149  ATCTCCCACCCGCTAGCAGTGGCGATTCAGGTTCTCTTGCCACATCAATATCCCAGATGGTAAAGACTGAAGGG  222
            ||||.||.||.|||..|||||||.|||||||||||||||||||||||...||||||.||||.||||||||||||
Sbjct  149  ATCTTCCGCCTGCTGCCAGTGGCAATTCAGGTTCTCTTGCCACATCAGGTTCCCAGGTGGTGAAGACTGAAGGG  222

Query  223  AAAGGAGCAAAGAGAAAAACCTCCGAGGAAGAGAAGAATGGCAGTGAAGAGCTTGTGGAAAAGAAAGTTTGTAA  296
            ||||||||||||||.|||.||.|.|||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGGAGCAAAGAGGAAAGCCCCTGAGGAGGAGAAGAATGGCGGTGAAGAGCTTGTGGAAAAGAAAGTTTGTAA  296

Query  297  AGCCTCTTCGGTGATCTTTGGTCTGAAGGGCTATGTGGCTGAGCGGAAGGGTGAGAGGGAGGAGATGCAGGATG  370
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCCTCTTCGGTGATCTTTGGTCTGAAAGGCTATGTGGCAGAGCGGAAGGGTGAGAGGGAGGAGATGCAGGATG  370

Query  371  CCCACGTCATCCTGAACGACATCACCGAGGAGTGTAGGCCCCCATCGTCCCTCATTACTCGGGTTTCATATTTT  444
            ||||.||||||||||||||.|||||..|||||||||..||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  CCCATGTCATCCTGAACGATATCACTCAGGAGTGTAATCCTCCATCATCTCTCATTACTCGGGTTTCATACTTT  444

Query  445  GCTGTTTTTGATGGACATGGAGGAATTCGAGCCTCAAAATTTGCTGCACAGAATTTGCATCAAAACTTAATCAG  518
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  445  GCTGTGTTTGATGGACATGGAGGAATACGAGCCTCGAAATTTGCTGCACAGAATTTGCACCAGAACTTAATCAG  518

Query  519  AAAATTTCCTAAAGGAGATGTAATCAGTGTAGAGAAAACCGTGAAGAGATGCCTTTTGGACACTTTCAAGCATA  592
            .||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||..|.||.|||||.|||||.|
Sbjct  519  GAAATTTCCTAAAGGAGATATAATCAGTGTGGAGAAGACTGTAAAGAGGTGTCTGCTAGATACTTTTAAGCACA  592

Query  593  CTGATGAAGAGTTCCTTAAACAAGCTTCCAGCCAGAAGCCTGCCTGGAAAGATGGGTCCACTGCCACGTGTGTT  666
            |.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  CCGATGAAGAGTTCCTGAAACAGGCTTCAAGCCAGAAGCCTGCCTGGAAAGACGGGTCCACTGCCACGTGTGTC  666

Query  667  CTGGCTGTAGACAACATTCTTTATATTGCCAACCTCGGAGATAGTCGGGCAATCTTGTGTCGTTATAATGAGGA  740
            ||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct  667  CTGGCTGTGGACAACATCCTGTATATCGCCAACCTTGGAGATAGTCGGGCAATCCTGTGTCGATATAATGAGGA  740

Query  741  GAGTCAAAAACATGCAGCCTTAAGCCTCAGCAAAGAGCATAATCCAACTCAGTATGAAGAGCGGATGAGGATAC  814
            .|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  741  AAGTCAGAAGCACGCAGCCTTAAGCCTCAGCAAAGAGCACAACCCAACTCAGTATGAAGAGCGCATGAGGATAC  814

Query  815  AGAAGGCTGGAGGAAACGTCAGGGATGGGCGTGTTTTGGGCGTGCTAGAGGTGTCACGCTCCATTGGGGACGGG  888
            ||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||
Sbjct  815  AGAAAGCTGGAGGGAATGTCAGAGATGGGCGTGTCTTGGGCGTGCTGGAGGTATCGCGTTCCATTGGAGATGGG  888

Query  889  CAGTACAAGCGCTGCGGTGTCACCTCTGTGCCCGACATCAGACGCTGCCAGCTGACCCCCAATGACAGGTTCAT  962
            ||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGTACAAGCGCTGTGGGGTCACATCTGTGCCTGATATCAGACGCTGCCAGCTGACCCCCAATGACAGGTTCAT  962

Query  963  TTTGTTGGCCTGTGATGGGCTCTTCAAGGTCTTTACCCCAGAAGAAGCCGTGAACTTCATCTTGTCCTGTCTCG  1036
            ||||.||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  963  TTTGCTGGCTTGCGACGGGCTTTTCAAGGTCTTTACCCCAGAAGAAGCTGTGAACTTCATCTTGTCCTGCCTTG  1036

Query 1037  AGGATGAAAAGATCCAGACCCGGGAAGG--------GAAGTCCGCAGCCGACGCCCGCTACGAAGCAGCCTGCA  1102
            ||       ||   |..||||...|.||        |||||        ||                       
Sbjct 1037  AG-------AG---CTTACCCCTCATGGTCTTTGGTGAAGT--------GA-----------------------  1069

Query 1103  ACAGGCTGGCCAACAAGGCGGTGCAGCGGGGCTCGGCCGACAACGTCACTGTGATGGTGGTGCGGATAGGGCAC  1176
                |||||  ||..|||...|||..|..||.||.|||     |.|||.|||                      
Sbjct 1070  ----GCTGG--AAAGAGGTCATGCTTCTCGGGTCTGCC-----CTTCATTGT----------------------  1110