Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472884
• Subject: XM_006529812.3
• Aligned Length: 1176
• Identities: 980
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  ATGGACCTCTTCGGGGACCTGCCGGAGCCCGAGCGCTCGCCGCGCCCGGCTGCCGGGAAAGAAGCTCAGAAAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||..||||||                   
Sbjct    1  ATGGACCTCTTCGGGGACCTGCCGGAGCCCGAGCGCGCGCCGCGGCCATCTGCCG-------------------  55

Query   75  ACCCCTGCTCTTTGATGACCTCCCTCCGGCCAGCAGTACTGACTCAGGATCAGGGGGACCTTTGCTTTTTGATG  148
                  |||||                                         |||||||||||.||.|||||||
Sbjct   56  ------GCTCT-----------------------------------------GGGGGACCTTTACTCTTTGATG  82

Query  149  ATCTCCCACCCGCTAGCAGTGGCGATTCAGGTTCTCTTGCCACATCAATATCCCAGATGGTAAAGACTGAAGGG  222
            ||||.||.||.|||..|||||||.||||||||                  ||||||.||||.||||||||||||
Sbjct   83  ATCTTCCGCCTGCTGCCAGTGGCAATTCAGGT------------------TCCCAGGTGGTGAAGACTGAAGGG  138

Query  223  AAAGGAGCAAAGAGAAAAACCTCCGAGGAAGAGAAGAATGGCAGTGAAGAGCTTGTGGAAAAGAAAGTTTGTAA  296
            ||||||||||||||.|||.||.|.|||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  139  AAAGGAGCAAAGAGGAAAGCCCCTGAGGAGGAGAAGAATGGCGGTGAAGAGCTTGTGGAAAAGAAAGTTTGTAA  212

Query  297  AGCCTCTTCGGTGATCTTTGGTCTGAAGGGCTATGTGGCTGAGCGGAAGGGTGAGAGGGAGGAGATGCAGGATG  370
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  213  AGCCTCTTCGGTGATCTTTGGTCTGAAAGGCTATGTGGCAGAGCGGAAGGGTGAGAGGGAGGAGATGCAGGATG  286

Query  371  CCCACGTCATCCTGAACGACATCACCGAGGAGTGTAGGCCCCCATCGTCCCTCATTACTCGGGTTTCATATTTT  444
            ||||.||||||||||||||.|||||..|||||||||..||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  287  CCCATGTCATCCTGAACGATATCACTCAGGAGTGTAATCCTCCATCATCTCTCATTACTCGGGTTTCATACTTT  360

Query  445  GCTGTTTTTGATGGACATGGAGGAATTCGAGCCTCAAAATTTGCTGCACAGAATTTGCATCAAAACTTAATCAG  518
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  361  GCTGTGTTTGATGGACATGGAGGAATACGAGCCTCGAAATTTGCTGCACAGAATTTGCACCAGAACTTAATCAG  434

Query  519  AAAATTTCCTAAAGGAGATGTAATCAGTGTAGAGAAAACCGTGAAGAGATGCCTTTTGGACACTTTCAAGCATA  592
            .||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||..|.||.|||||.|||||.|
Sbjct  435  GAAATTTCCTAAAGGAGATATAATCAGTGTGGAGAAGACTGTAAAGAGGTGTCTGCTAGATACTTTTAAGCACA  508

Query  593  CTGATGAAGAGTTCCTTAAACAAGCTTCCAGCCAGAAGCCTGCCTGGAAAGATGGGTCCACTGCCACGTGTGTT  666
            |.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  509  CCGATGAAGAGTTCCTGAAACAGGCTTCAAGCCAGAAGCCTGCCTGGAAAGACGGGTCCACTGCCACGTGTGTC  582

Query  667  CTGGCTGTAGACAACATTCTTTATATTGCCAACCTCGGAGATAGTCGGGCAATCTTGTGTCGTTATAATGAGGA  740
            ||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct  583  CTGGCTGTGGACAACATCCTGTATATCGCCAACCTTGGAGATAGTCGGGCAATCCTGTGTCGATATAATGAGGA  656

Query  741  GAGTCAAAAACATGCAGCCTTAAGCCTCAGCAAAGAGCATAATCCAACTCAGTATGAAGAGCGGATGAGGATAC  814
            .|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  657  AAGTCAGAAGCACGCAGCCTTAAGCCTCAGCAAAGAGCACAACCCAACTCAGTATGAAGAGCGCATGAGGATAC  730

Query  815  AGAAGGCTGGAGGAAACGTCAGGGATGGGCGTGTTTTGGGCGTGCTAGAGGTGTCACGCTCCATTGGGGACGGG  888
            ||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||
Sbjct  731  AGAAAGCTGGAGGGAATGTCAGAGATGGGCGTGTCTTGGGCGTGCTGGAGGTATCGCGTTCCATTGGAGATGGG  804

Query  889  CAGTACAAGCGCTGCGGTGTCACCTCTGTGCCCGACATCAGACGCTGCCAGCTGACCCCCAATGACAGGTTCAT  962
            ||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  805  CAGTACAAGCGCTGTGGGGTCACATCTGTGCCTGATATCAGACGCTGCCAGCTGACCCCCAATGACAGGTTCAT  878

Query  963  TTTGTTGGCCTGTGATGGGCTCTTCAAGGTCTTTACCCCAGAAGAAGCCGTGAACTTCATCTTGTCCTGTCTCG  1036
            ||||.||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  879  TTTGCTGGCTTGCGACGGGCTTTTCAAGGTCTTTACCCCAGAAGAAGCTGTGAACTTCATCTTGTCCTGCCTTG  952

Query 1037  AGGATGAAAAGATCCAGACCCGGGAAGGGAAGTCCGCAGCCGACGCCCGCTACGAAGCAGCCTGCAACAGGCTG  1110
            |||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||.|..||.||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  953  AGGATGACAAGATCCAGACCCGGGAAGGGAAGCCTGCTGTTGATGCCCGCTATGAAGCTGCATGCAACAGGCTG  1026

Query 1111  GCCAACAAGGCGGTGCAGCGGGGCTCGGCCGACAACGTCACTGTGATGGTGGTGCGGATAGGGCAC  1176
            |||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct 1027  GCCAACAAGGCAGTGCAGCGGGGCTCAGCAGACAACGTGACGGTGATGGTGGTGAGGATAGGACAC  1092