Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472903
• Subject: XM_006517631.3
• Aligned Length: 1452
• Identities: 1107
• Gaps: 252

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCGGACAGTTTCGATCGGGCTCCAGGTGCTGGTCGGGGCCGGAGCCGGGGCCTGTTCCTGGGCCGCGGAGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGGCGGGCCTGAGGGCGGCGGGTTCCCGAACGGAGCGGGGCCTGCGGAGCGGTCGCAGCACCAGTCGCCGCCGC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CGCCGCAGCCCAAAGCCCCGGGCTTCCTGCAGCCGCCGCCGCTGCGCCAGCCCAGGACCGCCCCGCCGCCAGGG  222

Query    1  ----------ATG--TCGGACGGTTTCGATCGGGC------------------CCCAGAGCAAACGAGGCCCCT  44
                      |.|  .|.|.|||.|.||..|||.|                  ||||||.|||||||.|||||.
Sbjct  223  GCCCAGAGCGAGGCCCCCGCCGGCTCCGCGCGGCCTCCCCGGCCTGGGGCGCTCCCAGAACAAACGAAGCCCCA  296

Query   45  GAGAGCTCCACCTAGTTCACAGGATAAAATCCCACAGCAGAACTCGGAGTCAGCAATGGCTAAGCCCCAGGTGG  118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGAGCTCCACCTAGTTCACAGGATAAAATCCCACAGCAGAACTCGGAGTCAGCAATGGCTAAGCCCCAGGTGG  370

Query  119  TTGTAGCTCCTGTATTAATGTCTAAGCTGTCTGTGAATGCCCCTGAATTTTACCCTTCAGGTTATTCTTCCAGT  192
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||||.|||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|.|
Sbjct  371  TTGTGGCTCCTGTGTTAATGTCTAAGCTGTCTGCGAACGCCCCCGAATTTTACCCATCAGGTTATTCTTCTAAT  444

Query  193  TACACAGAATCCTATGAGGATGGTTGTGAGGATTATCCTACTCTATCAGAATATGTTCAGGATTTTTTGAATCA  266
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||.|||||||
Sbjct  445  TATACAGAATCCTATGAGGATGGTTGTGAGGATTACCCGACTCTCTCAGAATACGTTCAGGATTTTCTGAATCA  518

Query  267  TCTTACAGAGCAGCCTGGCAGTTTTGAAACTGAAATTGAACAGTTTGCAGAGACCCTGAATGGTTGTGTTACAA  340
            |||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||
Sbjct  519  TCTGACAGAACAGCCTGGTAGTTTTGAAACAGAAATTGAACAGTTTGCAGAAACCCTGAATGGATGGGTCACAA  592

Query  341  CAGATGATGCTTTGCAAGAACTTGTGGAACTCATCTATCAACAGGCCACATCTATCCCAAATTTCTCTTATATG  414
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  CAGATGATGCTTTGCAAGAACTTGTGGAACTTATCTACCAACAGGCCACGTCTATCCCAAATTTCTCTTACATG  666

Query  415  GGAGCTCGCCTGTGTAATTACCTGTCCCATCATCTGACAATTAGCCCACAGAGTGGCAACTTCCGCCAATTGCT  488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGAGCTCGCCTGTGTAATTACCTGTCCCATCATCTGACAATTAGTCCACAGAGTGGCAACTTCCGCCAATTGCT  740

Query  489  ACTTCAAAGATGTCGGACTGAATATGAAGTTAAAGATCAAGCTGCAAAAGGGGATGAAGTTACTCGAAAACGAT  562
            |||||||||.||..||||.||.|||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  741  ACTTCAAAGGTGCAGGACGGAGTATGAAGCTAAAGACCAAGCTGCAAAAGGGGATGAAGTGACTCGAAAACGAT  814

Query  563  TTCATGCATTTGTACTCTTTCTGGGAGAACTTTATCTTAACCTGGAGATCAAGGGAACAAATGGACAGGTTACA  636
            |||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  TTCATGCATTTGTTCTGTTTCTGGGAGAACTATATCTTAACCTGGAGATTAAAGGAACAAATGGACAAGTTACA  888

Query  637  AGAGCAGATATTCTTCAGGTTGGTCTTCGAGAATTGCTGAATGCCCTGTTTTCTAATCCTATGGATGACAATTT  710
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  AGAGCAGATATTCTTCAGGTTGGTCTTCGGGAACTGCTGAATGCTCTGTTTTCTAATCCTATGGATGACAACTT  962

Query  711  AATTTGTGCAGTAAAATTGTTAAAGTTGACAGGATCAGTTTTGGAAGATGCTTGGAAGGAAAAAGGAAAGATGG  784
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.||.|..|
Sbjct  963  AATTTGTGCAGTAAAATTGCTAAAGTTGACAGGATCAGTTTTAGAAGATACTTGGAAGGAAAAGGGGAAAACTG  1036

Query  785  ATATGGAAGAAATTATTCAGAGAATTGAAAACGTTGTCCTAGATGCAAACTGCAGTAGAGATGTAAAACAGATG  858
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATATGGAAGAAATAATTCAGAGAATTGAAAATGTTGTCCTAGATGCAAACTGCAGCAGAGATGTAAAACAGATG  1110

Query  859  CTCTTGAAGCTTGTAGAACTCCGGTCAAGTAACTGGGGCAGAGTCCATGCAACTTCAACATATAGAGAAGCAAC  932
            ||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1111  CTCTTGAAGCTTGTTGAACTTCGATCAAGTAACTGGGGTAGGGTCCATGCAACTTCAACATACAGAGAAGCTAC  1184

Query  933  ACCAGAAAATGATCCTAACTACTTTATGAATGAACCAACATTTTATACATCTGATGGTGTTCCTTTCACTGCAG  1006
            .||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCCTGAAAATGACCCTAATTACTTCATGAATGAACCAACATTTTATACATCTGATGGTGTTCCTTTCACTGCAG  1258

Query 1007  CTGATCCAGATTACCAAGAGAAATACCAAGAATTACTTGAAAGAGAGGACTTTTTTCCAGATTATGAAGAAAAT  1080
            |.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGGACCCAGATTACCAAGAAAAGTATCAAGAGTTACTTGAAAGAGAGGACTTTTTTCCAGATTATGAAGAAAAT  1332

Query 1081  GGAACAGATTTATCCGGGGCTGGTGATCCATACTTGGATGATATTGATGATGAGATGGACCCAGAGATAGAAGA  1154
            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1333  GGAACAGATTTATCAGGGGCTGGTGACCCATATTTGGATGATATCGATGATGAGATGGACCCAGAAATTGAAGA  1406

Query 1155  AGCTTATGAAAAGTTTTGTTTGGAATCAGAGCGTAAGCGAAAACAG  1200
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1407  AGCTTATGAAAAGTTTTGTTTGGAATCAGAGCGCAAGCGAAAACAG  1452