Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472903
• Subject: XM_006517633.3
• Aligned Length: 1200
• Identities: 734
• Gaps: 411

Alignment

Query    1  ATGTCGGACGGTTTCGATCGGGCCCCAGAGCAAACGAGGCCCCTGAGAGCTCCACCTAGTTCACAGGATAAAAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCCACAGCAGAACTCGGAGTCAGCAATGGCTAAGCCCCAGGTGGTTGTAGCTCCTGTATTAATGTCTAAGCTGT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTGTGAATGCCCCTGAATTTTACCCTTCAGGTTATTCTTCCAGTTACACAGAATCCTATGAGGATGGTTGTGAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GATTATCCTACTCTATCAGAATATGTTCAGGATTTTTTGAATCATCTTACAGAGCAGCCTGGCAGTTTTGAAAC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TGAAATTGAACAGTTTGCAGAGACCCTGAATGGTTGTGTTACAACAGATGATGCTTTGCAAGAACTTGTGGAAC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TCATCTATCAACAGGCCACATCTATCCCAAATTTCTCTTATATGGGAGCTCGCCTGTGTAATTACCTGTCCCAT  444
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------ATGGGAGCTCGCCTGTGTAATTACCTGTCCCAT  33

Query  445  CATCTGACAATTAGCCCACAGAGTGGCAACTTCCGCCAATTGCTACTTCAAAGATGTCGGACTGAATATGAAGT  518
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||.||.|||||||.
Sbjct   34  CATCTGACAATTAGTCCACAGAGTGGCAACTTCCGCCAATTGCTACTTCAAAGGTGCAGGACGGAGTATGAAGC  107

Query  519  TAAAGATCAAGCTGCAAAAGGGGATGAAGTTACTCGAAAACGATTTCATGCATTTGTACTCTTTCTGGGAGAAC  592
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  108  TAAAGACCAAGCTGCAAAAGGGGATGAAGTGACTCGAAAACGATTTCATGCATTTGTTCTGTTTCTGGGAGAAC  181

Query  593  TTTATCTTAACCTGGAGATCAAGGGAACAAATGGACAGGTTACAAGAGCAGATATTCTTCAGGTTGGTCTTCGA  666
            |.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  182  TATATCTTAACCTGGAGATTAAAGGAACAAATGGACAAGTTACAAGAGCAGATATTCTTCAGGTTGGTCTTCGG  255

Query  667  GAATTGCTGAATGCCCTGTTTTCTAATCCTATGGATGACAATTTAATTTGTGCAGTAAAATTGTTAAAGTTGAC  740
            |||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  256  GAACTGCTGAATGCTCTGTTTTCTAATCCTATGGATGACAACTTAATTTGTGCAGTAAAATTGCTAAAGTTGAC  329

Query  741  AGGATCAGTTTTGGAAGATGCTTGGAAGGAAAAAGGAAAGATGGATATGGAAGAAATTATTCAGAGAATTGAAA  814
            ||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.||.|..||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  330  AGGATCAGTTTTAGAAGATACTTGGAAGGAAAAGGGGAAAACTGATATGGAAGAAATAATTCAGAGAATTGAAA  403

Query  815  ACGTTGTCCTAGATGCAAACTGCAGTAGAGATGTAAAACAGATGCTCTTGAAGCTTGTAGAACTCCGGTCAAGT  888
            |.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct  404  ATGTTGTCCTAGATGCAAACTGCAGCAGAGATGTAAAACAGATGCTCTTGAAGCTTGTTGAACTTCGATCAAGT  477

Query  889  AACTGGGGCAGAGTCCATGCAACTTCAACATATAGAGAAGCAACACCAGAAAATGATCCTAACTACTTTATGAA  962
            ||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  478  AACTGGGGTAGGGTCCATGCAACTTCAACATACAGAGAAGCTACCCCTGAAAATGACCCTAATTACTTCATGAA  551

Query  963  TGAACCAACATTTTATACATCTGATGGTGTTCCTTTCACTGCAGCTGATCCAGATTACCAAGAGAAATACCAAG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct  552  TGAACCAACATTTTATACATCTGATGGTGTTCCTTTCACTGCAGCGGACCCAGATTACCAAGAAAAGTATCAAG  625

Query 1037  AATTACTTGAAAGAGAGGACTTTTTTCCAGATTATGAAGAAAATGGAACAGATTTATCCGGGGCTGGTGATCCA  1110
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  626  AGTTACTTGAAAGAGAGGACTTTTTTCCAGATTATGAAGAAAATGGAACAGATTTATCAGGGGCTGGTGACCCA  699

Query 1111  TACTTGGATGATATTGATGATGAGATGGACCCAGAGATAGAAGAAGCTTATGAAAAGTTTTGTTTGGAATCAGA  1184
            ||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  700  TATTTGGATGATATCGATGATGAGATGGACCCAGAAATTGAAGAAGCTTATGAAAAGTTTTGTTTGGAATCAGA  773

Query 1185  GCGTAAGCGAAAACAG  1200
            |||.||||||||||||
Sbjct  774  GCGCAAGCGAAAACAG  789