Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472939
• Subject: XM_011529872.3
• Aligned Length: 1382
• Identities: 1196
• Gaps: 166

Alignment

Query    1  ATGGGCGGCCCGCGGGCTTGGGCGCTGCTCTGCCTCGGGCTCCTGCTCCCGGGAGGCGGCGCTGCGTGGAGCAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCGGCCCGCGGGCTTGGGCGCTGCTCTGCCTCGGGCTCCTGCTCCCGGGAGGCGGCGCTGCGTGGAGCAT  74

Query   75  CGGGGCAGCTCCGTTCTCCGGACGCAGGAACTGGTGCTCCTATGTGGTGACCCGCACCATCTCATGCCATGTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGGGCAGCTCCGTTCTCCGGACGCAGGAACTGGTGCTCCTATGTGGTGACCCGCACCATCTCATGCCATGTGC  148

Query  149  AGAATGGCACCTACCTTCAGCGAGTGCTGCAGAACTGCCCCTGGCCCATGAGCTGTCCGGGGAGCAGCTACAGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAATGGCACCTACCTTCAGCGAGTGCTGCAGAACTGCCCCTGGCCCATGAGCTGTCCGGGGAGCAGCTACAGA  222

Query  223  ACTGTGGTGAGACCCACATACAAGGTGATGTACAAGATAGTGACCGCCCGTGAGTGGAGGTGCTGCCCTGGGCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTGTGGTGAGACCCACATACAAGGTGATGTACAAGATAGTGACCGCCCGTGAGTGGAGGTGCTGCCCTGGGCA  296

Query  297  CTCAGGAGTGAGCTGCGAGGAAGTTGCAGGTTCCTCTGCCTCCTTGGAGCCCATGTGGTCGGGCAGTACCATGC  370
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCAGGAGTGAGCTGCGAGGAAGTTGCAGCTTCCTCTGCCTCCTTGGAGCCCATGTGGTCGGGCAGTACCATGC  370

Query  371  GGCGGATGGCGCTTCGGCCCACAGCCTTCTCAGGTTGTCTCAACTGCAGCAAAGTGTCAGAGCTGACAGAGCGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGCGGATGGCGCTTCGGCCCACAGCCTTCTCAGGTTGTCTCAACTGCAGCAAAGTGTCAGAGCTGACAGAGCGG  444

Query  445  CTGAAGGTGCTGGAGGCCAAGATGACCATGCTGACTGTCATAGAGCAGCCAGTACCTCCAACACCAGCTACCCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGAAGGTGCTGGAGGCCAAGATGACCATGCTGACTGTCATAGAGCAGCCAGTACCTCCAACACCAGCTACCCC  518

Query  519  TGAGGACCCTGCCCCGCTCTGGGGTCCCCCTCCTGCCCAGGGCAGCCCCGGAGATGGAGGCCTCCAG-------  585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  519  TGAGGACCCTGCCCCGCTCTGGGGTCCCCCTCCTGCCCAGGGCAGCCCCGGAGATGGAGGCCTCCAGGGGCTGC  592

Query  586  --------------------------------------------GACCAAGTCGGTGCTTGGGGGCTTCCCGGG  615
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGGAGCCATAGAGAGTGTGAGGGTCCCGCTGCTTCCCCGAAATGACCAAGTCGGTGCTTGGGGGCTTCCCGGG  666

Query  616  CCCACCGGCCCCAAGGGAGATGCCGGCAGTCGGGGCCCAATGGGGATGAGAGGCCCACCAGGTCCACAGGGCCC  689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCACCGGCCCCAAGGGAGATGCCGGCAGTCGGGGCCCAATGGGGATGAGAGGCCCACCAGGTCCACAGGGCCC  740

Query  690  CCCAGGGAGCCCTGGCCGGGCTGGAGCTGTGGGCACCCCTGGAGAGAGGGGACCTCCTGGGCCACCAGGGCCTC  763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCAGGGAGCCCTGGCCGGGCTGGAGCTGTGGGCACCCCTGGAGAGAGGGGACCTCCTGGGCCACCAGGGCCTC  814

Query  764  CTGGCCCCCCTGGGCCCCCAGCCCCTGTTGGGCCACCCCATGCCCGGATCTCCCAGCATGGAGACCCATTGCTG  837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGGCCCCCCTGGGCCCCCAGCCCCTGTTGGGCCACCCCATGCCCGGATCTCCCAGCATGGAGACCCATTGCTG  888

Query  838  TCCAACACCTTCACTGAGACCAACAACCACTGGCCCCAGGGACCCACTGGGCCTCCAGGCCCTCCAGGGCCCAT  911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCAACACCTTCACTGAGACCAACAACCACTGGCCCCAGGGACCCACTGGGCCTCCAGGCCCTCCAGGGCCCAT  962

Query  912  GGGTCCCCCTGGGCCTCCTGGCCCCACAGGTGTCCCTGGGAGTCCTGGTCACATAGGACCCCCAGGCCCCACTG  985
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGGTCCCCCTGGGCCTCCTGGCCCCACAGGTGTCCCTGGGAGTCCTGGTCACATAGGACCCCCAGGCCCCACTG  1036

Query  986  GACCCAAAGGAATCTCTGGCCACCCAGGAGAGAAGGGCGAGAGAGGACTGCGTGGGGAGCCTGGCCCCCAAGGC  1059
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GACCCAAAGGAATCTCTGGCCACCCAGGAGAGAAGGGCGAGAGAGGACTGCGTGGGGAGCCTGGCCCCCAAGGC  1110

Query 1060  TCTGCTGGGCAGCGGGGGGAACCTGGCCCTAAGGGAGACCCTGGTGAGAAGAGCCACTGGGGGGAGGGGTTGCA  1133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||.
Sbjct 1111  TCTGCTGGGCAGCGGGGGGAACCTGGCCCTAAGGGAGACCCTGGTGAGAAGAGCCACTGG-----------GCT  1173

Query 1134  CCAGCTACGCGAGGCTTTGAAGATTTTAGCTGAGAGGGTTTTAATCTTG--GAAACAATGATTGGGCTCTATGA  1205
            ||                        |||||.|.||.|.|    ||.||  |.|.||       |||||    |
Sbjct 1174  CC------------------------TAGCTTACAGAGCT----TCCTGCAGCAGCA-------GGCTC----A  1208

Query 1206  GCCAGAGCTGGGGTCTGGGGCGGGCCCTGCCGGCACAGGCACCCCCAGCCTCCTTCGGGGCAAGAGGGGCGGAC  1279
            ||..|||||    .||||       ||.|.|||    |.|||      ||||||                ||| 
Sbjct 1209  GCTGGAGCT----CCTGG-------CCAGACGG----GTCAC------CCTCCT----------------GGA-  1244

Query 1280  ATGCAACCAACTACCGGATCGTGGCCCCCAGGAGCCGGGACGAGAGAGGC  1329
                |.|||.|      ||| ||||         |.|.||.||||     
Sbjct 1245  ----AGCCATC------ATC-TGGC---------CAGAGATGAGA-----  1269