Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472939
• Subject: XM_011529876.1
• Aligned Length: 1364
• Identities: 776
• Gaps: 550

Alignment

Query    1  ATGGGCGGCCCGCGGGCTTGGGCGCTGCTCTGCCTCGGGCTCCTGCTCCCGGGAGGCGGCGCTGCGTGGAGCAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGGGGCAGCTCCGTTCTCCGGACGCAGGAACTGGTGCTCCTATGTGGTGACCCGCACCATCTCATGCCATGTGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGAATGGCACCTACCTTCAGCGAGTGCTGCAGAACTGCCCCTGGCCCATGAGCTGTCCGGGGAGCAGCTACAGA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ACTGTGGTGAGACCCACATACAAGGTGATGTACAAGATAGTGACCGCCCGTGAGTGGAGGTGCTGCCCTGGGCA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CTCAGGAGTGAGCTGCGAGGAAGTTGCAGGTTCCTCTGCCTCCTTGGAGCCCATGTGGTCGGGCAGTACCATGC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  GGCGGATGGCGCTTCGGCCCACAGCCTTCTCAGGTTGTCTCAACTGCAGCAAAGTGTCAGAGCTGACAGAGCGG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  CTGAAGGTGCTGGAGGCCAAGATGACCATGCTGACTGTCATAGAGCAGCCAGTACCTCCAACACCAGCTACCCC  518
                  .|||||.||.||..|..|||||               |||||||             |||||      
Sbjct    1  ------ATGCTGCAGTCCCTGGAGACCA---------------AGCAGCC-------------CCAGC------  34

Query  519  TGAGGACCCTGCCCCGCTCTG--GGGTCCCCCTCCTGCCCAGGGCAGCCCCGGAGA-TG-GAG---------GC  579
               .||||||||      |||  |||        ||| |||||  ||||...|||| || |||         ||
Sbjct   35  ---AGACCCTGC------CTGGAGGG--------CTG-CCAGG--AGCCATAGAGAGTGTGAGGGTCCCGCTGC  88

Query  580  CTCC-----AGGACCAAGTCGGTGCTTGGGGGCTTCCCGGGCCCACCGGCCCCAAGGGAGATGCCGGCAGTCGG  648
            .|||     |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   89  TTCCCCGAAATGACCAAGTCGGTGCTTGGGGGCTTCCCGGGCCCACCGGCCCCAAGGGAGATGCCGGCAGTCGG  162

Query  649  GGCCCAATGGGGATGAGAGGCCCACCAGGTCCACAGGGCCCCCCAGGGAGCCCTGGCCGGGCTGGAGCTGTGGG  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  163  GGCCCAATGGGGATGAGAGGCCCACCAGGTCCACAGGGCCCCCCAGGGAGCCCTGGCCGGGCTGGAGCTGTGGG  236

Query  723  CACCCCTGGAGAGAGGGGACCTCCTGGGCCACCAGGGCCTCCTGGCCCCCCTGGGCCCCCAGCCCCTGTTGGGC  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  237  CACCCCTGGAGAGAGGGGACCTCCTGGGCCACCAGGGCCTCCTGGCCCCCCTGGGCCCCCAGCCCCTGTTGGGC  310

Query  797  CACCCCATGCCCGGATCTCCCAGCATGGAGACCCATTGCTGTCCAACACCTTCACTGAGACCAACAACCACTGG  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  311  CACCCCATGCCCGGATCTCCCAGCATGGAGACCCATTGCTGTCCAACACCTTCACTGAGACCAACAACCACTGG  384

Query  871  CCCCAGGGACCCACTGGGCCTCCAGGCCCTCCAGGGCCCATGGGTCCCCCTGGGCCTCCTGGCCCCACAGGTGT  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  385  CCCCAGGGACCCACTGGGCCTCCAGGCCCTCCAGGGCCCATGGGTCCCCCTGGGCCTCCTGGCCCCACAGGTGT  458

Query  945  CCCTGGGAGTCCTGGTCACATAGGACCCCCAGGCCCCACTGGACCCAAAGGAATCTCTGGCCACCCAGGAGAGA  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  459  CCCTGGGAGTCCTGGTCACATAGGACCCCCAGGCCCCACTGGACCCAAAGGAATCTCTGGCCACCCAGGAGAGA  532

Query 1019  AGGGCGAGAGAGGACTGCGTGGGGAGCCTGGCCCCCAAGGCTCTGCTGGGCAGCGGGGGGAACCTGGCCCTAAG  1092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  533  AGGGCGAGAGAGGACTGCGTGGGGAGCCTGGCCCCCAAGGCTCTGCTGGGCAGCGGGGGGAACCTGGCCCTAAG  606

Query 1093  GGAGACCCTGGTGAGAAGAGCCACTGGG---------GGGAGGGGT---TGCACCAGCTACGCGAGGCT---TT  1151
            ||||||||||||||||||||||||||||         ...||.|.|   ||||.||||      |||||   .|
Sbjct  607  GGAGACCCTGGTGAGAAGAGCCACTGGGCTCCTAGCTTACAGAGCTTCCTGCAGCAGC------AGGCTCAGCT  674

Query 1152  GAAGATTTTAGCTGAGA-GGGTTTTAATCTTGGAAACAATGAT-TGGGCTCTATGAGCCAGAGCTGGGGTCTGG  1223
            |.||.|..|.|| .||| ||||.....||.|||||.|.||.|| |||.|    .||.|||||||||||||||||
Sbjct  675  GGAGCTCCTGGC-CAGACGGGTCACCCTCCTGGAAGCCATCATCTGGCC----AGAACCAGAGCTGGGGTCTGG  743

Query 1224  GGCGGGCCCTGCCGGCACAGGCACCCCCAGCCTCCTTCGGGGCAAGAGGGGCGGACATGCAACCAACTACCGGA  1297
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  744  GGCGGGCCCTGCCGGCACAGGCACCCCCAGCCTCCTTCGGGGCAAGAGGGGCGGACATGCAACCAACTACCGGA  817

Query 1298  TCGTGGCCCCCAGGAGCCGGGACGAGAGAGGC  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  818  TCGTGGCCCCCAGGAGCCGGGACGAGAGAGGC  849