Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472981
• Subject: XM_006523793.1
• Aligned Length: 1035
• Identities: 865
• Gaps: 81

Alignment

Query    1  ATGGAGCAGTATACAGCAAACAGCAATAGTTCGACAGAGCAGATTGTTGTCCAGGCAGGACAGATTCAGCAG--  72
            ||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||  
Sbjct    1  ATGGAGCAGTATACGACAAACAGCAATAGTTCCACAGAGCAGATCGTGGTGCAGGCCGGCCAGATTCAGCAGCA  74

Query   73  --------------------------------------------------------------------------  72
                                                                                      
Sbjct   75  GCAGGGTGGTGTCACTGCTGTCCAGCTGCAGACTGAGGCCCAGGTGGCATCCGCCTCAGGCCAGCAAGTCCAGA  148

Query   73  -----CAGGTCCAAGGGCAGCCATTAATGGTGCAGGTCAGTGGAGGCCAGCTAATCACATCAACTGGCCAACCC  141
                 ||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct  149  CCCTCCAGGTCCAGGGGCAGCCGTTAATGGTGCAAGTCAGTGGAGGCCAGCTTATTACATCAACAGGCCAACCC  222

Query  142  ATCATGGTCCAGGCTGTCCCTGGTGGGCAAGGTCAAACCATCATGCAAGTACCTGTTTCTGGAACACAGGGTTT  215
            ||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  223  ATCATGGTACAGGCTGTGCCTGGTGGACAAGGCCAAACCATCATGCAAGTACCTGTGTCTGGAACACAAGGTTT  296

Query  216  GCAGCAAATACAGTTGGTCCCACCTGGACAGATCCAGATCCAGGGTGGACAGGCTGTGCAGGTGCAGGGCCAGC  289
            .|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  ACAGCAGATACAGTTGGTGCCTCCTGGACAGATCCAGATTCAGGGTGGGCAGGCTGTGCAGGTGCAAGGCCAGC  370

Query  290  AGGGCCAGACCCAGCAGATCATCATCCAGCAGCCCCAGACGGCTGTCACTGCTGGCCAGACTCAGACACAGCAG  363
            ||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  371  AGGGTCAAACCCAGCAGATCATCATCCAACAGCCACAGACTGCAGTCACTGCTGGCCAGACTCAGACACAACAA  444

Query  364  CAGATTGCTGTCCAGGGACAGCAAGTGGCACAGACTGCTGAAGGGCAGACCATCGTCTATCAACCAGTTAATGC  437
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  445  CAGATTGCTGTCCAGGGACAGCAAGTGGCCCAGACTGCTGAAGGACAGACTATTGTCTACCAACCAGTTAATGC  518

Query  438  AGATGGCACCATTCTCCAGCAAGTTACAGTCCCTGTTTCAGGCATGATCACTATCCCAGCAGCCAGTTTGGCAG  511
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGATGGCACAATTCTCCAGCAAGTTACAGTCCCTGTTTCAGGCATGATCACCATCCCAGCAGCCAGTTTGGCAG  592

Query  512  GAGCACAGATTGTTCAAACAGGAGCCAATACCAACACAACCAGCAGTGGGCAAGGGACTGTCACTGTGACACTA  585
            |.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  593  GGGCACAGATCGTTCAGACAGGAGCCAATACCAACACAACCAGCAGTGGACAAGGGACGGTCACTGTGACACTG  666

Query  586  CCAGTGGCAGGCAATGTGGTCAATTCAGGAGGGATGGTCATGATGGTTCCTGGGGCTGGCTCTGTGCCTGCTAT  659
            ||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCTGTGGCAGGGAATGTGGTCAACTCAGGAGGAATGGTCATGATGGTACCAGGAGCTGGCTCTGTGCCTGCTAT  740

Query  660  CCAAAGAATCCCTCTACCTGGAGCAGAGATGCTTGAAGAAGAGCCTCTCTACGTGAATGCCAAACAATACAACC  733
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||..|||
Sbjct  741  CCAAAGAATCCCTTTACCTGGAGCAGAGATGCTGGAAGAAGAGCCCCTGTATGTGAATGCCAAACAGTATCACC  814

Query  734  GTATTCTTAAGAGGAGGCAAGCCCGAGCTAAACTAGAGGCAGAAGGGAAAATTCCAAAGGAGAGAAGGAAATAC  807
            |.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||
Sbjct  815  GCATCCTTAAGAGGAGACAAGCACGGGCTAAGCTAGAGGCAGAAGGGAAAATCCCAAAGGAACGAAGGAAATAC  888

Query  808  CTGCATGAGTCTCGGCACCGTCATGCCATGGCACGGAAGCGTGGTGAAGGTGGACGATTTTTCTCTCCAAAGGA  881
            ||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct  889  CTCCATGAGTCTCGGCATCGGCACGCCATGGCACGGAAGCGTGGGGAAGGGGGCCGCTTCTTCTCTCCAAAAGA  962

Query  882  AAAGGATAGTCCCCATATGCAGGATCCAAACCAAGCCGATGAAGAAGCAATGACACAGATCATCCGAGTGTCC  954
            ||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  963  AAAGGACAGTCCTCACATGCAGGATCCAAACCAAGCTGACGAAGAAGCCATGACACAGATCATCCGAGTTTCC  1035