Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472981
• Subject: XM_017317292.1
• Aligned Length: 1038
• Identities: 865
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  ATGGAGCAGTATACAGCAAACAGCAATAGTTCGACAGAGCAGATTGTTGTCCAGGCAGGACAGATTCAGCAG--  72
            ||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||  
Sbjct    1  ATGGAGCAGTATACGACAAACAGCAATAGTTCCACAGAGCAGATCGTGGTGCAGGCCGGCCAGATTCAGCAGCA  74

Query   73  --------------------------------------------------------------------------  72
                                                                                      
Sbjct   75  GCAGCAGGGTGGTGTCACTGCTGTCCAGCTGCAGACTGAGGCCCAGGTGGCATCCGCCTCAGGCCAGCAAGTCC  148

Query   73  --------CAGGTCCAAGGGCAGCCATTAATGGTGCAGGTCAGTGGAGGCCAGCTAATCACATCAACTGGCCAA  138
                    ||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct  149  AGACCCTCCAGGTCCAGGGGCAGCCGTTAATGGTGCAAGTCAGTGGAGGCCAGCTTATTACATCAACAGGCCAA  222

Query  139  CCCATCATGGTCCAGGCTGTCCCTGGTGGGCAAGGTCAAACCATCATGCAAGTACCTGTTTCTGGAACACAGGG  212
            |||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  223  CCCATCATGGTACAGGCTGTGCCTGGTGGACAAGGCCAAACCATCATGCAAGTACCTGTGTCTGGAACACAAGG  296

Query  213  TTTGCAGCAAATACAGTTGGTCCCACCTGGACAGATCCAGATCCAGGGTGGACAGGCTGTGCAGGTGCAGGGCC  286
            |||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  TTTACAGCAGATACAGTTGGTGCCTCCTGGACAGATCCAGATTCAGGGTGGGCAGGCTGTGCAGGTGCAAGGCC  370

Query  287  AGCAGGGCCAGACCCAGCAGATCATCATCCAGCAGCCCCAGACGGCTGTCACTGCTGGCCAGACTCAGACACAG  360
            |||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  AGCAGGGTCAAACCCAGCAGATCATCATCCAACAGCCACAGACTGCAGTCACTGCTGGCCAGACTCAGACACAA  444

Query  361  CAGCAGATTGCTGTCCAGGGACAGCAAGTGGCACAGACTGCTGAAGGGCAGACCATCGTCTATCAACCAGTTAA  434
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct  445  CAACAGATTGCTGTCCAGGGACAGCAAGTGGCCCAGACTGCTGAAGGACAGACTATTGTCTACCAACCAGTTAA  518

Query  435  TGCAGATGGCACCATTCTCCAGCAAGTTACAGTCCCTGTTTCAGGCATGATCACTATCCCAGCAGCCAGTTTGG  508
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCAGATGGCACAATTCTCCAGCAAGTTACAGTCCCTGTTTCAGGCATGATCACCATCCCAGCAGCCAGTTTGG  592

Query  509  CAGGAGCACAGATTGTTCAAACAGGAGCCAATACCAACACAACCAGCAGTGGGCAAGGGACTGTCACTGTGACA  582
            ||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  593  CAGGGGCACAGATCGTTCAGACAGGAGCCAATACCAACACAACCAGCAGTGGACAAGGGACGGTCACTGTGACA  666

Query  583  CTACCAGTGGCAGGCAATGTGGTCAATTCAGGAGGGATGGTCATGATGGTTCCTGGGGCTGGCTCTGTGCCTGC  656
            ||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGCCTGTGGCAGGGAATGTGGTCAACTCAGGAGGAATGGTCATGATGGTACCAGGAGCTGGCTCTGTGCCTGC  740

Query  657  TATCCAAAGAATCCCTCTACCTGGAGCAGAGATGCTTGAAGAAGAGCCTCTCTACGTGAATGCCAAACAATACA  730
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||..
Sbjct  741  TATCCAAAGAATCCCTTTACCTGGAGCAGAGATGCTGGAAGAAGAGCCCCTGTATGTGAATGCCAAACAGTATC  814

Query  731  ACCGTATTCTTAAGAGGAGGCAAGCCCGAGCTAAACTAGAGGCAGAAGGGAAAATTCCAAAGGAGAGAAGGAAA  804
            ||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||..||||||||
Sbjct  815  ACCGCATCCTTAAGAGGAGACAAGCACGGGCTAAGCTAGAGGCAGAAGGGAAAATCCCAAAGGAACGAAGGAAA  888

Query  805  TACCTGCATGAGTCTCGGCACCGTCATGCCATGGCACGGAAGCGTGGTGAAGGTGGACGATTTTTCTCTCCAAA  878
            |||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct  889  TACCTCCATGAGTCTCGGCATCGGCACGCCATGGCACGGAAGCGTGGGGAAGGGGGCCGCTTCTTCTCTCCAAA  962

Query  879  GGAAAAGGATAGTCCCCATATGCAGGATCCAAACCAAGCCGATGAAGAAGCAATGACACAGATCATCCGAGTGT  952
            .||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  963  AGAAAAGGACAGTCCTCACATGCAGGATCCAAACCAAGCTGACGAAGAAGCCATGACACAGATCATCCGAGTTT  1036

Query  953  CC  954
            ||
Sbjct 1037  CC  1038