Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473000
- Subject:
- XM_006499615.3
- Aligned Length:
- 1426
- Identities:
- 1227
- Gaps:
- 41
Alignment
Query 1 ATGAGTGACGGAAACCCAGAGCTCCTGTCAACCAGCCAGACCTACAACGGCCAGAGCGAGAACAACGAAGACTA 74
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||.||||||..|||||||||||
Sbjct 1 ATGAGTGACGGAAATCCAGAGCTCCTGTCAACCAGCCAGACCTATAACAGCCAGGGCGAGAGTAACGAAGACTA 74
Query 75 TGAGATCCCCCCGATAACACCTCCCAACCTCCCGGAGCCATCCCTCCTGCACCTGGGGGACCACGAAGCCAGCT 148
||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct 75 TGAGATTCCTCCTATAACGCCTCCCAATCTCCCTGAGCCATCCCTCCTGCACCTGGGGGATCACGAAGCCGGCT 148
Query 149 ACCACTCGCTGTGCCACGGCCTCACCCCCAACGGTCTGCTCCCTGCCTACTCCTATCAGGCCATGGACCTCCCA 222
|||||||||||||.||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.
Sbjct 149 ACCACTCGCTGTGTCACGGCCTTGCGCCCAACGGTCTGCTCCCTGCCTACTCGTACCAAGCAATGGATCTCCCT 222
Query 223 GCCATCATGGTGTCCAACATGCTAGCACAGGACAGCCACCTGCTGTCGGGCCAGCTGCCCACGATCCAGGAGAT 296
|||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 GCCATCATGGTGTCCAACATGCTGGCCCAGGACGGCCATCTGCTGTCAGGCCAGCTGCCCACGATCCAGGAAAT 296
Query 297 GGTCCACTCGGAAGTGGCTGCCTATGACTCGGGCCGGCCCGGGCCCCTGCTGGGTCGCCCGGCAATGCTGGCCA 370
||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 297 GGTCCACTCGGAGGTGGCGGCATATGACTCAGGCCGGCCAGGGCCCCTGCTGGGCCGCCCGGCGATGCTGGCCA 370
Query 371 GCCACATGAGTGCCCTCAGCCAGTCCCAGCTCATCTCGCAGATGGGCATCCGGAGCAGCATCGCCCACAGCTCC 444
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||..||||.||.|||.|||||
Sbjct 371 GCCACATGAGTGCCCTCAGCCAGTCTCAGCTCATCTCCCAGATGGGTATCCGGAGTGGCATTGCTCACGGCTCC 444
Query 445 CCATCACCGCCGGGGAGCAAGTCAGCGACCCCCTCTCCCTCCAGCTCCACTCAGGAAGAGGAGTCGGAAGTGCA 518
||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||.|..||
Sbjct 445 CCATCACCTCCAGGGAGCAAGTCAGCGACCCCCTCTCCATCCAGTTCCACACAGGAGGAGGAATCAGATGCCCA 518
Query 519 TTTCAAGATCTCGGGAGAAAAGAGACCTTCAGCCGACCCAGGAAAAAAGGCCAAGAACCCGAAGAAGAAGAAAA 592
||||||||||||||||||.||||||||.||||..||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 519 TTTCAAGATCTCGGGAGAGAAGAGACCCTCAGTGGACCCAGGCAAAAAGGCCAAGAATCCAAAGAAGAAGAAGA 592
Query 593 AGAAGGACCCCAATGAGCCGCAGAAGCCTGTGTCGGCCTACGCACTCTTCTTCAGAGACACTCAGGCCGCCATC 666
|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 593 AGAAGGACCCCAATGAGCCACAGAAGCCAGTGTCGGCCTACGCTCTCTTCTTCAGAGACACTCAGGCTGCCATC 666
Query 667 AAGGGTCAGAACCCCAGTGCCACTTTCGGTGACGTGTCCAAAATCGTGGCCTCCATGTGGGACAGCCTGGGAGA 740
|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGGGGCAGAATCCCAGTGCCACCTTTGGAGATGTGTCCAAAATAGTGGCGTCCATGTGGGACAGCCTGGGAGA 740
Query 741 GGAACAGAAGCAGGCCTACAAGAGGAAGACAGAAGCAGCAAAGAAGGAATATCTGAAGGCCCTGGCAGCCTACC 814
.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||.||||.||||||.
Sbjct 741 AGAGCAGAAACAGGCGTATAAGAGGAAGACTGAAGCTGCCAAGAAGGAGTACCTGAAAGCCTTGGCGGCCTACA 814
Query 815 GGGCTAGCCTCGTCTCCAAGAGCTCCCCAGATCAAGGTGAGACCAAGAGCACTCAGGCAAACCCACCAGCCAAA 888
|.|||||||||||.|||||||||.||||.||.|||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GAGCTAGCCTCGTGTCCAAGAGCCCCCCGGACCAAGGTGAGGCCAAGAACACTCAGGCAAACCCACCAGCCAAA 888
Query 889 ATGCTCCCACCCAAGCAGCCCATGTATGCCATGCCAGGCCTGGCCTCCTTCCTGACGCCGTCGGACCTGCAGGC 962
|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 889 ATGCTTCCACCCAAGCAGCCCATGTACGCCATGCCCGGCCTGGCTTCCTTCCTGACGCCCTCCGACCTGCAGGC 962
Query 963 CTTCCGCAGTGGGGCCTCCCCTGCCAGCCTCGCCCGGACGCTGGGCTCCAAGTCTCTGCTGCCAGGCCTCAGTG 1036
||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||||.|.||||||||.||||||||..
Sbjct 963 CTTCCGCAGTGGAGCCTCTCCCGCCAGCCTTGCCAGGACGCTGGGCTCCAAGGCCCTGCTGCCGGGCCTCAGCA 1036
Query 1037 CGTCCCCGCCGCCGCCACCCTCCTTCCCGCTCAGCCCCACACTGCACCAGCAGCTGTCACTGCCCCCTCACGCC 1110
|.| |||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.|||||.
Sbjct 1037 CAT---CGCCGCCACCACCCTCCTTCCCTCTCAGCCCCTCACTGCACCAGCAGCTGCCACTGCCCCCCCACGCG 1107
Query 1111 CAGGGCGCCCTCCTCAGTCCACCTGTTAGCATGTCCCCAGCCCCCCAGCCCCCTGTCCTGCCCACCCCCATGGC 1184
||||||.|.||||||||.||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..||.|||||||
Sbjct 1108 CAGGGCACTCTCCTCAGCCCGCCTCTCAGCATGTCCCCAGCCCCGCAGCCTCCTGTCCTGCCTGCCTCCATGGC 1181
Query 1185 ACTCCAGGTGCAGCTGGCGATGAGCCCCTCACCTCCAGGGCCACAGGACTTCCCGCACATCTCTGAGTTCCCCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||
Sbjct 1182 ACTCCAGGTGCAGCTGGCGATGAGCCCCTCACCTCCAGGGCCACAGGACTTCCCACACATCTCTGATTTCTCCA 1255
Query 1259 GCAGCTCGGGATCCTGCTCACCTGGCCCATCCAACCCCACCAGCAGCGGGGACTGGGACAGCAGCTACCCCAGT 1332
|..||||.||.|||.||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||..|.||.|||||||||
Sbjct 1256 GTGGCTCTGGCTCCCGCTCACCTGGCCCATCCAACCCTTCCAGCAGCGGAGACTGGGATGGGAGTTACCCCAGT 1329
Query 1333 GGGGAGTGTGGCATCAGCACCTGCAGCCTGCTCCCCAGGGA-CAAATCGCTCTACCTCACC------------- 1392
||||||.|||||.||.||||||||||.|| ||.|..|||.| |..|.||| |.|| ||||
Sbjct 1330 GGGGAGCGTGGCCTCGGCACCTGCAGACT-CTGCAGAGGCAGCCCACCGC-CCAC--CACCAGCCCAAAGAACC 1399
Query 1393 -------------------- 1392
Sbjct 1400 TGCAGGAACCTTCTGCCCGC 1419