Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473073
• Subject: NM_001347156.1
• Aligned Length: 822
• Identities: 650
• Gaps: 90

Alignment

Query   1  ATGAAGAAGACACAAACTTGGATTCTCACTTGCATTTATCTTCAGCTGCTCCTATTTAATCCTCTCGTCAAAAC  74
           ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct   1  ATGAAGAAGACACAAACTTGGATTATCACTTGCATTTATCTTCAACTGCTCCTATTTAATCCTCTTGTCAAAAC  74

Query  75  TGAAGG-GATCTGCAGGAATCGTGTGACTAATAATGTAAAAGACGTCACTAAATTGGTGGCAAATCTTCCAAAA  147
            .|||| |||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||.|.||.|||.|||||||||||||||||||.
Sbjct  75  -CAAGGAGATCTGCGGGAATCCTGTGACTGATAATGTAAAAGACATTACAAAACTGGTGGCAAATCTTCCAAAT  147

Query 148  GACTACATGATAACCCTCAAATATGTCCCCGGGATGGATGTTTTGCCAAGTCATTGTTGGATAAGCGAGATGGT  221
           |||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||.||.|.||.|||||
Sbjct 148  GACTATATGATAACCCTCAACTATGTCGCCGGGATGGATGTTTTGCCTAGTCATTGTTGGCTACGAGATATGGT  221

Query 222  AGTACAATTGTCAGACAGCTTGACTGATCTTCTGGACAAGTTTTCAAATATTTCTGAAGGCTTGAGTAATTATT  295
           |.|||||||.|||..||||||||||..|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 222  AATACAATTATCACTCAGCTTGACTACTCTTCTGGACAAGTTCTCAAATATTTCTGAAGGCTTGAGTAATTACT  295

Query 296  CCATCATAGACAAACTTGTGAATATAGTGGATGACCTTGTGGAGTGCGTGAAAGAAAACTCATCTAAGGATCTA  369
           ||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||...|||.||.||||||||.||.|.|||.||.||
Sbjct 296  CCATCATAGACAAACTTGGGAAAATAGTGGATGACCTCGTGTTATGCATGGAAGAAAACGCACCGAAGAATATA  369

Query 370  AAAAAATCATTC--AAGAGCCCAGAACCCAGGCTCTTTACTCCTGAAGAATTCTTTAGAATTTTTAATAGATCC  441
           |||.||||  ||  |||||.||||||.|.||...||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 370  AAAGAATC--TCCGAAGAGGCCAGAAACTAGATCCTTTACTCCTGAAGAATTCTTTAGTATTTTCAATAGATCC  441

Query 442  ATTGATGCCTTCAAGGACTTTGTAGTGGCATCTGAAACTAGTGATTGTGTGGTTTCTTCAACATTAAGTCCTGA  515
           |||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.||||||||.||||||.|.||||||||||||.||||.||
Sbjct 442  ATTGATGCCTTTAAGGACTTTATGGTGGCATCTGACACTAGTGACTGTGTGCTCTCTTCAACATTAGGTCCCGA  515

Query 516  GAAAGATTCCAGAGTCAGTGTCACAAAACCATTTATGTTACCCCCTGTTGCAGCCAGCTCCCTTAGGAATGACA  589
           |||||                                                                     
Sbjct 516  GAAAG---------------------------------------------------------------------  520

Query 590  GCAGTAGCAGTAATAGGAAGGCCAAAAATCCCCCTGGAGACTCCAGCCTACACTGGGCAGCCATGGCATTGCCA  663
                          ||||.|||..|||..||||||.||||||..|||||||.|||.||||||||||||||||.
Sbjct 521  ---------------GGAAAGCCGCAAAGGCCCCTGAAGACTCGGGCCTACAATGGACAGCCATGGCATTGCCG  579

Query 664  GCATTGTTTTCTCTTATAATTGGCTTTGCTTTTGGAGCCTTATACTGGAAGAAGAGACAGCCAAGTCTTACAAG  737
           ||..|..||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
Sbjct 580  GCTCTCATTTCGCTTGTAATTGGCTTTGCTTTTGGAGCCTTATACTGGAAGAAGAAACAGTCAAGTCTTACAAG  653

Query 738  GGCAGTTGAAAATATACAAATTAATGAAGAGGATAATGAGATAAGTATGTTGCAAGAGAAAGAGAGAGAGTTTC  811
           ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||
Sbjct 654  GGCAGTTGAAAATATACAGATTAATGAAGAGGATAATGAGATAAGTATGTTGCAACAGAAAGAGAGAGAATTTC  727

Query 812  AAGAAGTG  819
           ||||.|||
Sbjct 728  AAGAGGTG  735