Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473120
- Subject:
- NM_008922.2
- Aligned Length:
- 1531
- Identities:
- 1282
- Gaps:
- 20
Alignment
Query 1 ATGGAGTTTTCTGGAAGAAAGTGGAGGAAGCTGAGGTTGGCAGGTGACCAGAGGAATGCTTCCTACCCTCATTG 74
|||.||||.||.|||||.|...|||.|||||||.|.|||||.|||||||||||.||||||...||||||||..|
Sbjct 1 ATGCAGTTCTCAGGAAGGATCCGGAAGAAGCTGCGATTGGCGGGTGACCAGAGAAATGCTAGTTACCCTCACAG 74
Query 75 CCTTCAGTTTTACTTGCAGCCACCTTCTGAAAACATATCTTTAATAGAATTTGAAAACTTGGCTATTGATAGAG 148
|||||||||||||.|||||||.|||.|||||||||||||.||.|..||.|||||||||||||||.||||.||||
Sbjct 75 CCTTCAGTTTTACCTGCAGCCGCCTACTGAAAACATATCGTTGACGGAGTTTGAAAACTTGGCTTTTGACAGAG 148
Query 149 TTAAATTGTTAAAATCAGTTGAAAATCTTGGAGTGAGCTATGTGAAAGGAACTGAACAATACCAGAGTAAGTTG 222
||||||||.|.|||.||.||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 149 TTAAATTGCTTAAAGCAATTGAGAACCTCGGTGTGAGCTATGTGAAAGGAACCGAACAATACCAGAGTAAATTG 222
Query 223 GAGAGTGAGCTTCGGAAGCTCAAGTTTTCCTACAGAGAAAACTTAGAAGATGAATATGAACCACGAAGAAGAGA 296
|||...|||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|.||.|||||.|||||.|||||..||||.||
Sbjct 223 GAGGCCGAGATTCGAAAGCTCAAGTTTTCCTACAGAGAGAACCTGGAGGATGAGTATGAGCCACGGCGAAGGGA 296
Query 297 TCATATTTCTCATTTTATTTTGCGGCTTGCTTATTGCCAGTCTGAAGAACTTAGACGCTGGTTCATTCAACAAG 370
.||.||.||.||.|||||..|.||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 297 CCACATCTCCCACTTTATCCTACGCCTCGCGTACTGCCAGTCGGAAGATCTTAGACGATGGTTTATTCAACAAG 370
Query 371 AAATGGATCTCCTTCGATTTAGATTTAGTATTTTACCCAAGGATAAAATTCAGGATTTCTTAAAGGATAGCCAA 444
||||||||||.|||||.|||.||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||..||||||.||||||||.||.
Sbjct 371 AAATGGATCTGCTTCGGTTTCGATTCAGTATTTTACCAAAGGATAAAGTCCAGAGTTTCTTGAAGGATAGTCAT 444
Query 445 TTGCAGTTTGAGGCTATAAGTGATGAAGAGAAGACTCTTCGAGAACAGGAGATTGTTGCCTCATCACCAAGTTT 518
|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||..|.||.||.||.|||||..|
Sbjct 445 TTGCATTTTGAGGCTATCAGTGACGAGGAGAAGACCCTTCGGGAACAGGATATCATGGCGTCCTCTCCAAGCCT 518
Query 519 AAGTGGACTTAAGTTGGGGTTCGAGTCCATTTATAAGATCCCTTTTGCTGATGCTCTGGATTTGTTTCGAGGAA 592
||||||..|.|||||||.||..|||||..||||||||.||||.|||||||||||||||||..||||..||||||
Sbjct 519 AAGTGGGATCAAGTTGGAGTCAGAGTCAGTTTATAAGGTCCCCTTTGCTGATGCTCTGGACCTGTTCAGAGGAA 592
Query 593 GGAAAGTCTATTTGGAAGATGGCTTTGCTTACGTACCACTTAAGGACATTGTGGCAATCATCCTGAATGAATTT 666
||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||.||||.||.|||
Sbjct 593 GGAAAGTCTACTTGGAAGATGGCTTTGCTTATGTGCCACTTAAGGACATCGTGGCCATTATCTTGAACGAGTTT 666
Query 667 AGAGCCAAACTGTCCAAGGCTTTGGCATTAACAGCCAGGTCCTTGCCTGCTGTGCAGTCTGATGAAAGACTTCA 740
|||||||..|||||.||||||||||||.||||.||||||||..||||||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 667 AGAGCCACGCTGTCTAAGGCTTTGGCACTAACGGCCAGGTCGCTGCCTGCTGTGCAGTCCGATGAACGACTTCA 740
Query 741 GCCTCTGCTCAATCACCTCAGTCATTCCTACACTGGCCAAGATTACAGTACCCAGGGAAATGTTGGGAAGATTT 814
||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||...||....||.|||||||
Sbjct 741 GCCTCTGCTCAACCACCTCAGTCATTCTTACACTGGTCAAGATTATAGTACCCAGAAGAACACCGGCAAGATTT 814
Query 815 CTTTAGATCAGATTGATTTGCTTTCTACCAAATCCTTCCCACCTTGCATGCGTCATTTACATAAAGCCTTGCGG 888
|.||||||||||||||||.|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||..|.||.||.||..||.||
Sbjct 815 CCTTAGATCAGATTGATTCGCTGTCTACAAAATCCTTCCCACCTTGCATGCGTCAGCTGCACAAGGCGCTGAGG 888
Query 889 GAAAATCACCATCTTCGTCATGGAGGCCGAATGCAGTATGGCCTATTTCTGAAGGGCATTGGTTTAACTTTGGA 962
||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||..||||..||||
Sbjct 889 GAGAACCACCATCTCCGTCACGGAGGCCGGATGCAGTACGGCCTGTTCCTCAAGGGCATTGGGCTAACGCTGGA 962
Query 963 ACAGGCATTGCAGTTCTGGAAGCAAGAATTTATCAAAGGAAAGATGGATCCAGACAAGTTTGATAAAGGTTACT 1036
.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCAGGCATTGCAGTTCTGGAAGCAGGAGTTTATCAGAGGAAAGATGGACCCAGACAAGTTTGATAAAGGTTACT 1036
Query 1037 CTTACAACATCCGTCACAGCTTTGGAAAGGAAGGCAAGAGGACAGACTATACACCTTTCAGTTGCCTGAAGATT 1110
|||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
Sbjct 1037 CTTACAATATCCGGCATAGCTTCGGAAAGGAAGGCAAGAGGACAGACTATACGCCTTTCAGTTGCATGAAGATT 1110
Query 1111 ATTCTGTCCAATCCACCAAGCCAAGGGGATTATCATGGGTGCCCATTCCGTCACAGTGATCCAGAGCTGCTGAA 1184
||.|||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1111 ATCCTGACCAACCCACCAGGCCAAGGGGATTATCATGGGTGCCCCTTCCGTCACAGTGATGCAGAGCTGCTGAA 1184
Query 1185 GCAAAAGTTGCAGTCATACAAGATCTCT-CCTGGAGGGATAAGCCAGATTTTGGATTTAGTAAAGGGGACACAT 1257
|||.|||.|||||||.|||||||||.|| |||.| |||||.|||||||||||||||||.||||||||||..|||
Sbjct 1185 GCAGAAGATGCAGTCCTACAAGATCCCTGCCTCG-GGGATCAGCCAGATTTTGGATTTGGTAAAGGGGAATCAT 1257
Query 1258 TACCAGGTAGCCTGTCAAAAATACTTTGAGATGATACACAATGTGGATGATTGTGGCTTTTCTTTGAATCATCC 1331
|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||.|||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 TACCAAGTAGCCTGTCAGAAGTACTTCGAGATGACACATAATGTGGACGATTGTGGCTTTTCTTTGAATCATCC 1331
Query 1332 TAATCAGTTCTTTTGTGAGAGCCAACGTATTCTAAATGGTGGTAAAGACATAAAGAAGGAACCTATC---CAAC 1402
.|||||||||||||.|||||||||.||.||.||||.||||||.|||||.||.||||||||| ||| ||.|
Sbjct 1332 AAATCAGTTCTTTTTTGAGAGCCAGCGCATCCTAACTGGTGGCAAAGATATCAAGAAGGAA---ATCAGTCAGC 1402
Query 1403 CAGAAACTCCTCAACCCAAACCAAGTGTCCAGAAAACCAAGGATGCATCATCTGCTCTGGCCTCTTTAAATTCC 1476
|||||||.|||||.|.||||||.||...||||||.||||.||||||..|||||||.||||||||..||.|.|||
Sbjct 1403 CAGAAACACCTCAGCACAAACCTAGCACCCAGAAGACCAGGGATGCTGCATCTGCGCTGGCCTCCCTAGACTCC 1476
Query 1477 TCTCTGGAAATGGATATGGAAGGACTAGAAGATTACTTTAGTGAAGATTCT 1527
||.|||||||||||..||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 1477 TCCCTGGAAATGGACCTGGAGGGGCTGGAAGAGTACTTT------------ 1515