Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473153
• Subject: NM_001310589.1
• Aligned Length: 679
• Identities: 580
• Gaps: 36

Alignment

Query   1  ATGTCGGACTCTGAGGAGGAGAGTCAGGACCGGCAACTGAAAATCGTCGTGCTGGGGGACGGCGCCTCCGGGAA  74
           |||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct   1  ATGTCAGACTCTGAGGAGGAGAGCCAGGACCGGCAACTGAAAATCGTCGTGCTGGGGGACGGCACCTCGGGGAA  74

Query  75  GACCTCCTTAACTACGTGTTTTGCTCAAGAAACTTTTGGGAAACAGTACAAACAAACTATAGGACTGGATTTC-  147
           ||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||| 
Sbjct  75  GACCTCCTTAGCTACGTGTTTTGCTCAAGAGACATTTGGGAAGCAGTACAAGCAGACGATAGGACTGGATTTCT  148

Query 148  TTTTGAGAAGGATAACATTGCCAGGAAACTTGAATGTTACCCTTCAAATTTGGGATATAGGAGGGCAGACAATA  221
           |||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TTTTGAGAAGGATTACCTTACCAGGAAATTTGAATGTTACTCTTCAAGTTTGGGATATAGGAGGGCAGACAATA  222

Query 222  GGAGGCAAAATGTTGGATAAATATATCTATGGAGCACAGGGAGTCCTCTTGGTATATGATATTACAAATTATCA  295
           ||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 223  GGTGGCAAGATGTTGGATAAATACATCTATGGAGCACAGGGAATCCTCTTGGTATATGATATTACAAACTACCA  296

Query 296  AAGCTTTGAGAATTTAGAAGATTGGTATACTGTGGTGAAGAAAGTGAGCGAGGAGTCAGAAACTCAGCCACTGG  369
           |||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||.|||.||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 297  AAGCTTTGAGAATTTGGAAGATTGGTATTCTGTGGTGAAGACAGTAAGTGAAGAGTCAGAAACTCAGCCCCTGG  370

Query 370  TTGCCTTGGTAGGCAATAAAATTGATTTGGAGCATATGCGAACAATAAAACCTGAAAAACACTTACGGTTTTGC  443
           ||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 371  TTGCTTTAGTGGGCAATAAAATTGACTTGGAGCATATGCGAACAGTAAAAGCTGATAAGCACTTACGATTTTGC  444

Query 444  CAGGAAAATGGTTTTAGTAGCCACTTTGTCTCAGCCAAGACAGGAGACTCTGTCTTCCTGTGCTTTCAGAAAGT  517
           |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 445  CAGGAAAATGGTTTTAGTAGCCACTTTGTTTCAGCCAAGACAGGAGACTCTGTCTTCCTGTGTTTTCAGAAAGT  518

Query 518  TGCTGCTGAAATCCTTGGGATCAAATTAAACAAAGCAGAAATAGAACAGTCACAGAGGGTGGTGAAGGCAGATA  591
           |||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|.||.|.||||||.|
Sbjct 519  TGCAGCAGAAATCCTGGGAATCAAATTAAACAAAGCAGAAATAGAACAGTCACAGCGTATTGTCAGGGCAGAAA  592

Query 592  TTGTAAACTACAACCAGGAACCTATGTCAAGGACTGTTAACC----CTCCTAGAAGCTCT------------AT  649
           |.||.||.|   |||.||||           || .|.|||||    |.||    ||||||            .|
Sbjct 593  TAGTCAAGT---ACCCGGAA-----------GA-AGATAACCAACACCCC----AGCTCTGCTCAGAGTAGAGT  647

Query 650  GTGTGCAGTTCAG  662
           .|||.||||.|||
Sbjct 648  CTGTTCAGTACAG  660