Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000473153
Subject:
XM_006503651.3
Aligned Length:
674
Identities:
571
Gaps:
47

Alignment

Query   1  ATGTCGGACTCTGAGGAGGAGAGTCAGGACCGG---------CAACTGAAAATCGTCGTGCTGGGGGACGGCGC  65
           |||.|||..|||                 ||||         ||.|||    |||             |.|| .
Sbjct   1  ATGCCGGCTTCT-----------------CCGGGCGCCCTCACACCTG----TCG-------------CAGC-A  39

Query  66  CTCC--GGGAAGACCTCCTTAACTACGTGTTTTGCTCAAGAAACTTTTGGGAAACAGTACAAACAAACTATAGG  137
           ||||  |||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct  40  CTCCTGGGGAAGACCTCCTTAGCTACGTGTTTTGCTCAAGAGACATTTGGGAAGCAGTACAAGCAGACGATAGG  113

Query 138  ACTGGATTTC-TTTTGAGAAGGATAACATTGCCAGGAAACTTGAATGTTACCCTTCAAATTTGGGATATAGGAG  210
           |||||||||| |||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct 114  ACTGGATTTCTTTTTGAGAAGGATTACCTTACCAGGAAATTTGAATGTTACTCTTCAAGTTTGGGATATAGGAG  187

Query 211  GGCAGACAATAGGAGGCAAAATGTTGGATAAATATATCTATGGAGCACAGGGAGTCCTCTTGGTATATGATATT  284
           |||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 188  GGCAGACAATAGGTGGCAAGATGTTGGATAAATACATCTATGGAGCACAGGGAATCCTCTTGGTATATGATATT  261

Query 285  ACAAATTATCAAAGCTTTGAGAATTTAGAAGATTGGTATACTGTGGTGAAGAAAGTGAGCGAGGAGTCAGAAAC  358
           |||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||.|||.||.||.|||||||||||
Sbjct 262  ACAAACTACCAAAGCTTTGAGAATTTGGAAGATTGGTATTCTGTGGTGAAGACAGTAAGTGAAGAGTCAGAAAC  335

Query 359  TCAGCCACTGGTTGCCTTGGTAGGCAATAAAATTGATTTGGAGCATATGCGAACAATAAAACCTGAAAAACACT  432
           ||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.||||.||.||||
Sbjct 336  TCAGCCCCTGGTTGCTTTAGTGGGCAATAAAATTGACTTGGAGCATATGCGAACAGTAAAAGCTGATAAGCACT  409

Query 433  TACGGTTTTGCCAGGAAAATGGTTTTAGTAGCCACTTTGTCTCAGCCAAGACAGGAGACTCTGTCTTCCTGTGC  506
           ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 410  TACGATTTTGCCAGGAAAATGGTTTTAGTAGCCACTTTGTTTCAGCCAAGACAGGAGACTCTGTCTTCCTGTGT  483

Query 507  TTTCAGAAAGTTGCTGCTGAAATCCTTGGGATCAAATTAAACAAAGCAGAAATAGAACAGTCACAGAGGGTGGT  580
           ||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 484  TTTCAGAAAGTTGCAGCAGAAATCCTGGGAATCAAATTAAACAAAGCAGAAATAGAACAGTCACAGAGAGTGGT  557

Query 581  GAAGGCAGATATTGTAAACTACAACCAGGAACCTATGTCAAGGACTGTTAACCCTCCTAGAAGCTCTATGTGTG  654
           ||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||.|||||||||||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct 558  GAAGGCAGATATTGTAAACTACAACCAGGAGCCCTTGTCAAGAACTGTTAACCCTCCTCGGAGCTCCATGTGTG  631

Query 655  CAGTTCAG  662
           ||||.|||
Sbjct 632  CAGTGCAG  639