Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473219
• Subject: NM_172407.3
• Aligned Length: 1759
• Identities: 1458
• Gaps: 92

Alignment

Query    1  ATGGCGCAGGAGGTGTCGGAGTACCTGAGCCAGAACCCGCGGGTGGCAGCCTGGGTGGAGGCGCTGCGCTGCGA  74
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCAGGAGGTGTCCGAGTACCTGAGCCAAAACCCGCGGGTAGCCGCCTGGGTGGAGACGCTGCGCTGCGA  74

Query   75  CGGCGAGACTGACAAACACTGGCGCCACCGCCGGGATTTTTTGCTTCGCAACGCCGGGGACCTGGCCCCCGCTG  148
            .||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||.||||||  
Sbjct   75  GGGCGAGACGGACAAACACTGGCGCCACCGCCGGGAGTTTCTGCTTCGCAATGCCGGGGACCTGGTCCCCGC--  146

Query  149  GCGGCGCTGCCTCCGCTAGCACGGATGAAGCTGCCGACGCCGAGAGCGGGACCCGAAACCGGCAGCTGCAGCAG  222
                               |||.||.||..||||.|||||.||||||||..||||.|..||||||||.||||||
Sbjct  147  -------------------CACCGACGAGACTGCGGACGCGGAGAGCGGAGCCCGCACTCGGCAGCTCCAGCAG  201

Query  223  CTCATCTCCTTTTCCATGGCCTGGGCGAACCACGTCTTCCTCGGGTGCCGATACCCTCAAAAAGTTATGGATAA  296
            ||..|||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  202  CTGGTCTCCTTCTCCATGGCCTGGGCGAACCATGTCTTCCTAGGGTGCCGGTACCCTCAAAAAGTTATGGATAA  275

Query  297  AATACTTAGTATGGCTGAAGGCATCAAAGTGACAGATGCTCCAACCTATACAACAAGAGATGAACTGGTTGCCA  370
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||.|||.||||.|||||||||||||
Sbjct  276  AATTCTTAGTATGGCTGAAGGCATCAAAGTGACAGATGCTCCAATCCATACCACACGAGACGAACTGGTTGCCA  349

Query  371  AGGTGAAGAAAAGAGGGATATCGAGTAGCAATGAAGGGGTAGAAGAGCCATCCAAAAAACGAGTTATAGAAGGA  444
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||...||||||||
Sbjct  350  AGGTGAAGAAAAGAGGGATATCAAGTAGCAATGAAGGGGTAGAGGAGCCATCCAAAAAACGAGCCGTAGAAGGA  423

Query  445  AAAAACAGTTCTGCAGTTGAGCAAGATCACGCAAAAACCTCTGCCAAGACAGAACGTGCATCAGCTCAGCAGGA  518
            |||||||.||||.|||||||||.||||||.|..||||..||||||||.||.||.|||.||.||||||||||.||
Sbjct  424  AAAAACAATTCTTCAGTTGAGCGAGATCATGGGAAAAAATCTGCCAAAACGGATCGTTCAGCAGCTCAGCAAGA  497

Query  519  AAACAGTTCAACGTGTATAGGGTCGGCCATCAAATCAGAGA---GTGGGAACTCAGCTCGGAGCTCTGGCATCT  589
            |||||||||..|||..|..||||||.|||.||||||.||||   ||||||.|||||||||||      |||.||
Sbjct  498  AAACAGTTCGCCGTCCAGGGGGTCGTCCACCAAATCCGAGAGTGGTGGGACCTCAGCTCGGA------GCAGCT  565

Query  590  CCAG---------TCAGAATAGCTCTACAAGTGATGGAGATCGATCTGTTTCCAGCCAAAGCAGCAGCAGCGTT  654
            ||||         ||||.|||||.|.||||||||.|||||..|||||||.|.||||||.||||||||||   .|
Sbjct  566  CCAGTGGCTCCCATCAGGATAGCGCCACAAGTGAAGGAGACAGATCTGTGTGCAGCCAGAGCAGCAGCA---AT  636

Query  655  TCCTCTCAGGTAACAACGGCAGGATCTGGGAAAGCTTCTGAAG-CAGAAGCTCCAGATAAACACGGTTCA---T  724
            |||||||||||   |||.|||||.|||||.||.|||| ||.|| |||||||||||.||||||..||||||   |
Sbjct  637  TCCTCTCAGGT---AACCGCAGGGTCTGGAAAGGCTT-TGGAGTCAGAAGCTCCACATAAACGTGGTTCAGCGT  706

Query  725  CATTTGT---TTCCTTGCTGAAATCCAGTGTGAATAGTCACATGACCCAATCCACTGATTCTAGACAACAAAGT  795
            |||||||   ||||.||.||||.||||||.||||||||||.||||||||.|||||||||...||||||||.|||
Sbjct  707  CATTTGTTTCTTCCCTGTTGAAGTCCAGTATGAATAGTCATATGACCCAGTCCACTGATAACAGACAACAGAGT  780

Query  796  GGATCACCTAAAAAGAGTGCTTTGGAAGGCTCTTCAGCCTCAGCTTCTCAAAGCAGCTCAGAGATCGAGGTGCC  869
            ||.||||||||||||.|||||.|||||||.|||||||.||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  781  GGGTCACCTAAAAAGGGTGCTCTGGAAGGTTCTTCAGGCTCAGCCTCTCAGAGCAGCTCAGAGATTGAGGTGCC  854

Query  870  CTTGTTGGGCTCCTCAGGAAGCTCAGAGGTAGAATTGCCACTATTGTCTTCCAAACCTAGTTCAGAGACAGCTT  943
            |||||||||||||||.|||||..||||.|||||.||||||.||.||||||..||..||||||||||||||||||
Sbjct  855  CTTGTTGGGCTCCTCTGGAAGTGCAGAAGTAGAGTTGCCATTACTGTCTTGTAAGTCTAGTTCAGAGACAGCTT  928

Query  944  CAAGTGGGTTAACTTCCAAAACTAGTTCAGAGGCAAGTGTTTCATCATCAGTTGCTAAAAACAGTTCCTCATCA  1017
            |.|||||||||||.||.|||.|||||||||||||||...||||||||||||||.|.|||||||||||.||.|||
Sbjct  929  CCAGTGGGTTAACATCTAAATCTAGTTCAGAGGCAAACATTTCATCATCAGTTTCAAAAAACAGTTCATCGTCA  1002

Query 1018  GGCACATCCTTACTGACTCCCAAGAGCAGCTCTTCAACAAATACATCGCTGCTAACTTCCAAGAGCACTTCCCA  1091
            ||||..||.|||||.||.|||.|||||||   |||.||||||.||||||||||.||.|||||.|||||..|.||
Sbjct 1003  GGCAGCTCTTTACTAACCCCCCAGAGCAG---TTCCACAAATCCATCGCTGCTGACATCCAAAAGCACGGCTCA  1073

Query 1092  GGTAGCTGCATCACTACTAGCTTCCAAGAGCAGCTCCCAGACCAGTGGATCTCTGGTTTCCAAAAGCACTTCCT  1165
            |||||||||.|||||.|||||..||||               .||||                  ||.||||||
Sbjct 1074  GGTAGCTGCTTCACTGCTAGCGACCAA---------------AAGTG------------------GCGCTTCCT  1114

Query 1166  TAGCAAGTGTGTCCCAGTTGGCTTCTAAGAGTAGTTCTCAGACTAGCACCTCACAGTTGCCTTCTAAAAGTACT  1239
            |||.|||.|||||.|||.|.|||.|.||||||.|||||||||.||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1115  TAGGAAGCGTGTCTCAGCTAGCTGCCAAGAGTGGTTCTCAGAGTAGCACTTCACAGTTGCCTTCGAAAAGTACC  1188

Query 1240  TCACAGTCAAGTGAGAGTTCTGTCAAATTCTCTT---GCAAGTTAACCAATGAAGATGTGAAACAGAAGCAACC  1310
            ||.|||.|.|||||||||||||||||.||..|||   |.|||||||||||||||||..|.||||||||||||||
Sbjct 1189  TCCCAGGCCAGTGAGAGTTCTGTCAAGTTTGCTTGTCGGAAGTTAACCAATGAAGACATAAAACAGAAGCAACC  1262

Query 1311  TTTTTTCAATAGACTATATAAAACGGTGGCATGGAAGTTGGTAGCTGTTGGTGGCTTTAGTCCCAATGTGAATC  1384
            |||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||.||||||||
Sbjct 1263  TTTCTTCAATAGACTGTATAAGACGGTGGCGTGGAAGTTAGTAGCAGTTGGTGGCTTCAGCCCCACTGTGAATC  1336

Query 1385  ATGGAGAGCTCCTAAATGCAGCTATTGAGGCTCTGAAAGCAACACTGGATGTATTTTTTGTCCCACTAAAAGAA  1458
            |.||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1337  ACGGAGAGCTGCTGAACGCGGCTATTGAGGCTCTGAAAGCAACACTGGATGTGTTTTTTGTCCCACTGAAAGAA  1410

Query 1459  TTGGCAGATCTGCCTCAAAATAAGAGCTCTCAAGAAAGTATTGTTTGTGAATTGAGGTGCAAGTCTGTGTATTT  1532
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1411  CTGGCAGATCTGCCTCAAAATAAGAGCTCTCAAGAAAGTATTGTCTGTGAATTGAGGTGTAAGTCGGTATATTT  1484

Query 1533  GGGCACTGGCTGTGGAAAAAGCAAAGAAAATGCAAAAGCAGTTGCATCAAGAGAAGCATTGAAGTTATTTCTCA  1606
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1485  GGGCACTGGCTGTGGAAAAAGCAAAGAAAACGCAAAAGCCGTCGCATCGAGAGAAGCACTGAAGTTATTTCTCA  1558

Query 1607  AGAAAAAGGTGGTGGTAAAAATATGTAAAAGGAAATACAGAGGCAGTGAAATAGAAGATCTAGTACTCCTTGAT  1680
            ||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||.|||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1559  AGAAGAAGGTGGTGGTGAAGATCTGTAAGAGGAAGTACCGAGGCAGCGAGATCGAGGATCTAGTACTCCTGGAT  1632

Query 1681  GAAGAATCGAGGCCTGTAAACTTACCTCCAGCACTAAAACATCCTCAAGAATTACTA  1737
            ||||||.|.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1633  GAAGAAGCAAGACCCGTAAACTTACCTCCAGCACTGAAACATCCTCAAGAATTACTG  1689