Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473272
• Subject: XM_006532452.2
• Aligned Length: 1672
• Identities: 1400
• Gaps: 74

Alignment

Query    1  ATGAAACTC------TGGGTGTCTGCATTGCTGATGGCCTGGTTTGGTGTCCTGAGCTGTGTGCAGGCCGAATT  68
            |||||.|||      |.|||||..|..|||||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGAAGCTCCAGGTGTTGGTGTTGGTGTTGCTGATGTCCTGGTTCGGTGTCCTGAGCTGGGTGCAGGCAGAATT  74

Query   69  CTTCACCTCTATTGGGCACATGACTGACCTGATTTATGCAGAGAAAGAGCTGGTGCAGTCTCTGAAAGAGTACA  142
            |||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct   75  CTTCACCTCCATTGGGCACATGACCGATCTGATTTACGCAGAGAAGGACCTGGTACAGTCTCTGAAGGAGTACA  148

Query  143  TCCTTGTGGAGGAAGCCAAGCTTTCCAAGATTAAGAGCTGGGCCAACAAAATGGAAGCCTTGACTAGCAAGTCA  216
            ||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||.|||.|||||||||.||||.||||..|||
Sbjct  149  TCCTTGTGGAGGAAGCCAAGCTCGCCAAGATTAAGAGCTGGGCCAGCAAGATGGAAGCCCTGACCAGCAGATCA  222

Query  217  GCTGCTGATGCTGAGGGCTACCTGGCTCACCCTGTGAATGCCTACAAACTGGTGAAGCGGCTAAACACAGACTG  290
            |||||.||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct  223  GCTGCCGACCCCGAGGGCTACCTGGCTCATCCTGTGAATGCCTACAAGCTGGTGAAGCGGTTGAACACAGACTG  296

Query  291  GCCTGCGCTGGAGGACCTTGTCCTGCAGGACTCAGCTGCAGGTTTTATCGCCAACCTCTCTGTGCAGCGGCAGT  364
            ||||||.||||.||||||||||||.|||||..|..|.|||||||||.||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  297  GCCTGCACTGGGGGACCTTGTCCTTCAGGATGCTTCGGCAGGTTTTGTCGCTAACCTCTCAGTTCAGCGGCAAT  370

Query  365  TCTTCCCCACTGATGAGGACGAGATAGGAGCTGCCAAAGCCCTGATGAGACTTCAGGACACATACAGGCTGGAC  438
            |||||||||||||||||||||||...||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||..|||||.
Sbjct  371  TCTTCCCCACTGATGAGGACGAGTCTGGAGCTGCCAGAGCCCTGATGAGACTTCAGGACACGTACAAACTGGAT  444

Query  439  CCAGGCACAATTTCCAGAGGGGAACTTCCAGGAACCAAGTACCAGGCAATGCTGAGTGTGGATGACTGCTTTGG  512
            ||.|.|||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  CCGGACACGATTTCCAGAGGGGAACTTCCAGGCACAAAGTACCAGGCCATGCTGAGTGTGGACGACTGCTTTGG  518

Query  513  GATGGGCCGCTCGGCCTACAATGAAGGGGACTATTATCATACGGTGTTGTGGATGGAGCAGGTGCTAAAGCAGC  586
            |.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  519  GCTGGGCCGCTCAGCTTACAATGAAGGAGACTATTACCATACTGTGCTGTGGATGGAGCAGGTACTGAAGCAGC  592

Query  587  TTGATGCCGGGGAGGAGGCCACCACAACCAAGTCACAGGTGCTGGACTACCTCAGCTATGCTGTCTTCCAGTTG  660
            |.|||||.||||||||||||||....||||||||.|.|||||||||||||||.|||||||||||||||||..||
Sbjct  593  TCGATGCTGGGGAGGAGGCCACTGTTACCAAGTCCCTGGTGCTGGACTACCTGAGCTATGCTGTCTTCCAACTG  666

Query  661  GGTGATCTGCACCGTGCCCTGGAGCTCACCCGCCGCCTGCTCTCCCTTGACCCAAGCCACGAACGAGCTGGAGG  734
            |||||.|||||||||||..||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTGACCTGCACCGTGCTGTGGAACTCACCCGCCGCCTGCTCTCTCTTGACCCAAGCCACGAACGAGCTGGAGG  740

Query  735  GAATCTGCGGTACTTTGAGCAGTTATTGGAGGAAGAGAGAGAAAAAACGTTAACAAATCAGACAGAAGCTGAGC  808
            ||||||||||||||||||.|.|||.||.||||||||.||||..|||.|..|..|||||||||||||.||.|..|
Sbjct  741  GAATCTGCGGTACTTTGAACGGTTGTTAGAGGAAGAAAGAGGGAAATCACTGTCAAATCAGACAGACGCCGGAC  814

Query  809  TAGCAACCCCAGAAGGCATCTATGAGAGGCCTGTGGACTACCTGCCTGAGAGGGATGTTTACGAGAGCCTCTGT  882
            |.||.||||..|||..|.|.||.||||||||...||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  815  TGGCCACCCAGGAAAACTTGTACGAGAGGCCCACGGACTACCTGCCTGAGAGGGATGTGTACGAGAGCCTGTGT  888

Query  883  CGTGGGGAGGGTGTCAAACTGACACCCCGTAGACAGAAGAGGCTTTTCTGTAGGTACCACCATGGCAACAGGGC  956
            ||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||.|||||.|||||.|.
Sbjct  889  CGAGGGGAGGGCGTGAAACTGACACCCCGGAGGCAGAAGAAGCTTTTCTGTAGGTACCATCATGGAAACAGAGT  962

Query  957  CCCACAGCTGCTCATTGCCCCCTTCAAAGAGGAGGACGAGTGGGACAGCCCGCACATCGTCAGGTACTACGATG  1030
            .||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  GCCACAGCTCCTCATCGCCCCCTTCAAAGAGGAAGACGAGTGGGACAGCCCACACATCGTCAGGTACTATGATG  1036

Query 1031  TCATGTCTGATGAGGAAATCGAGAGGATCAAGGAGATCGCAAAACCTAAACTTGCACGAGCCACCGTTCGTGAT  1104
            |.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037  TGATGTCCGACGAAGAAATCGAGAGGATCAAGGAGATTGCTAAGCCCAAACTTGCACGAGCCACTGTGCGTGAC  1110

Query 1105  CCCAAGACAGGAGTCCTCACTGTCGCCAGCTACCGGGTTTCCAAAAGCTCCTGGCTAGAGGAAGATGATGACCC  1178
            |||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1111  CCCAAGACAGGTGTCCTCACTGTTGCCAGCTACAGAGTTTCCAAAAGCTCCTGGCTAGAGGAGGATGACGACCC  1184

Query 1179  TGTTGTGGCCCGAGTAAATCGTCGGATGCAGCATATCACAGGGTTAACAGTAAAGACTGCAGAATTGTTACAGG  1252
            ||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||.||||.||.|||||||||||..|.||.||||
Sbjct 1185  TGTTGTGGCCCGGGTCAACCGGCGGATGCAACATATCACCGGGCTAACGGTGAAGACTGCAGAGCTATTGCAGG  1258

Query 1253  TTGCAAATTATGGAGTGGGAGGACAGTATGAACCGCACTTCGACTTCTCTAGGCGACCTTTTGACAGCGGCCTC  1326
            |.|||||.||.|||.||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1259  TCGCAAACTACGGAATGGGGGGACAGTACGAACCACACTTTGACTTCTCAAGGCGACCCTTTGACAGCGGCCTC  1332

Query 1327  AAAACAGAGGGGAATAGGTTAGCGACGTTTCTT-----------------------------------------  1359
            |||||.|||||.|||||||||||||||||||||                                         
Sbjct 1333  AAAACGGAGGGCAATAGGTTAGCGACGTTTCTTAACTATAGCGATGAGCAAGATGCTTTCAAGCGTTTAGGGAC  1406

Query 1360  -------------------------AACTACATGAGTGATGTAGAAGCTGGTGGTGCCACCGTCTTCCCTGATC  1408
                                     |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||..
Sbjct 1407  TGGGAACCGTGTGGCCACGTTTCTAAACTACATGAGCGATGTCGAAGCTGGTGGTGCCACCGTCTTTCCTGACT  1480

Query 1409  TGGGGGCTGCAATTTGGCCTAAGAAGGGTACAGCTGTGTTCTGGTACAACC-TCTTGCGGAGCGGGGAAGGTGA  1481
            ||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||| |||| ||.||.|||||||||||
Sbjct 1481  TGGGAGCTGCTATTTGGCCCAAGAAGGGCACAGCTGTATTCTGGTACAACCTTCTT-CGCAGTGGGGAAGGTGA  1553

Query 1482  CTACCGAACAAGACATGCTGCCTGCCCTGTGCTTGTGGGCTGCAAGTGGGTCTCCAATAAGTGGTTCCATGAAC  1555
            .||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1554  TTATCGGACGAGACATGCAGCCTGCCCTGTGCTTGTGGGCTGCAAGTGGGTCTCCAACAAGTGGTTCCATGAGC  1627

Query 1556  GAGGACAGGAGTTCTTGAGACCTTGTGGATCAACAGAAGTTGAC  1599
            ||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||.
Sbjct 1628  GAGGACAGGAGTTCTTAAGACCTTGTGGAACAACGGAAGTTGAT  1671