Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473291
• Subject: XM_006723408.3
• Aligned Length: 1194
• Identities: 1138
• Gaps: 45

Alignment

Query    1  ATGGCCACGGTCATCCCCAGCCCCCT---GAGCCTAGGCGAGGACTTCTACCGCGAGGCCATCGAGCACTGCCG  71
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Sbjct    1  ATGGCCACCGCCATTCAGAACCCGCTCAAGTCCCTAGGCGAGGACTTCTACCGCGAGGCCATCGAGCACTGCCG  74

Query   72  CAGTTACAACGCGCGCCTGTGCGCCGAGCGCAGCCTGCGACTGCCCTTCCTCGACTCGCAGACCGGCGTGGCCC  145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGTTACAACGCGCGCCTGTGCGCCGAGCGCAGCCTGCGACTGCCCTTCCTCGACTCGCAGACCGGCGTGGCCC  148

Query  146  AGAACAACTGCTACATCTGGATGGAGAAGACCCACCGCGGGCCGGGTTTGGCCCCGGGACAGATTTACACGTAC  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAACAACTGCTACATCTGGATGGAGAAGACCCACCGCGGGCCGGGTTTGGCCCCGGGACAGATTTACACGTAC  222

Query  220  CCCGCCCGCTGTTGGAGGAAGAAACGGAGACTCAACATCCTGGAGGACCCCAGACTCAGGCCCTGCGAGTACAA  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCGCCCGCTGTTGGAGGAAGAAACGGAGACTCAACATCCTGGAGGACCCCAGACTCAGGCCCTGCGAGTACAA  296

Query  294  GATCGACTGTGAAGCACCCCTGAAGAAGGAGGGTGGCCTCCCGGAAGGGCCGGTCCTCGAGGCTCTACTGTGTG  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCGACTGTGAAGCACCCCTGAAGAAGGAGGGTGGCCTCCCGGAAGGGCCGGTCCTCGAGGCTCTACTGTGTG  370

Query  368  CAGAGACGGGGGAGAAGAAGATTGAGCTGAAGGAGGAGGAGACCATTATGGACTGTCAGAAACAGCAGTTGCTG  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||
Sbjct  371  CAGAGACGGGGGAGAAGAAGATTGAGCTGAAGGAGGAGGAGACCATTATGGACTGT------CAGCAGTTGCTG  438

Query  442  GAGTTTCCGCATGACCTCGAGGTGGAAGACTTGGAGGATGACATTCCCAGGAGGAAGAACAGGGCCAAAGGAAA  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  GAGTTTCCGCATGACCTCGAGGTGGAAGACTTGGAGGATGACATTCCCAGGAGGAAGAACAGGGCCAAAGGAAA  512

Query  516  GGCATATGGCATCGGGGGTCTCCGGAAACGCCAGGACACCGCTTCCCTGGAGGACCGAGACAAGCCGTATGTCT  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  513  GGCATATGGCATCGGGGGTCTCCGGAAACGCCAGGACACCGCTTCCCTGGAGGACCGAGACAAGCCGTATGTCT  586

Query  590  GTGATATCTGTGGGAAACGGTATAAGAACCGGCCGGGGCTCAGCTACCACTACACCCACACCCACCTGGCCGAG  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  GTGATATCTGTGGGAAACGGTATAAGAACCGGCCGGGGCTCAGCTACCACTACACCCACACCCACCTGGCCGAG  660

Query  664  GAGGAGGGGGAGGAGAACGCCGAACGCCACGCCCTGCCCTTCCACCGGAAAAACAACCATAAACAGTTTTACAA  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  GAGGAGGGGGAGGAGAACGCCGAACGCCACGCCCTGCCCTTCCACCGGAAAAACAACCATAAACAGTTTTACAA  734

Query  738  AGAATTGGCCTGGGTCCCTGAGGCACAAAGGAAACACACAGCCAAGAAGGTGCC------CACGGTCATCCCCA  805
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Sbjct  735  AGAATTGGCCTGGGTCCCTGAGGCACAAAGGAAACACACAGCCAAGAAGGCGCCCGACGGCACTGTCATCCCCA  808

Query  806  ACGGCTACTGTGACTTCTGCCTGGGGGGCTCCAAGAAGACGGGGTGTCCCGAGGACCTCATCTCCTGTGCGGAC  879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  ACGGCTACTGTGACTTCTGCCTGGGGGGCTCCAAGAAGACGGGGTGTCCCGAGGACCTCATCTCCTGTGCGGAC  882

Query  880  TGTGGGCGATCAGGACACCCCTCGTGTTTACAATTCACGGTGAACATGACGGCAGCCGTGCGGACCTACCGCTG  953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  TGTGGGCGATCAGGACACCCCTCGTGTTTACAATTCACGGTGAACATGACGGCAGCCGTGCGGACCTACCGCTG  956

Query  954  GCAGTGCATCGAGTGCAAATCCTGCAGCCTGTGCGGAACCTCCGAGAACGAC----------------------  1005
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Sbjct  957  GCAGTGCATCGAGTGCAAATCCTGCAGCCTGTGCGGAACCTCCGAGAACGACGGTGCCAGCTGGGCGGGTCTCA  1030

Query 1006  --------GACCAGCTGCTGTTTTGTGATGACTGCGATCGGGGTTACCACATGTACTGCCTGAGTCCCCCCATG  1071
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  CCCCCCAGGACCAGCTGCTGTTTTGTGATGACTGCGATCGGGGTTACCACATGTACTGCCTGAGTCCCCCCATG  1104

Query 1072  GCGGAGCCCCCGGAAGGGAGCTGGAGCTGTCACCTCTGTCTCCGGCACCTGAAGGAAAAGGCTTCTGCTTACAT  1145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105  GCGGAGCCCCCGGAAGGGAGCTGGAGCTGTCACCTCTGTCTCCGGCACCTGAAGGAAAAGGCTTCTGCTTACAT  1178

Query 1146  CACCCTCACC  1155
            ||||||||||
Sbjct 1179  CACCCTCACC  1188