Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473292
• Subject: NM_001144895.2
• Aligned Length: 1212
• Identities: 842
• Gaps: 327

Alignment

Query    1  ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAGGAGGAACAGCTGAGAGGCCTTGGATT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAGGAGGAACAGCTGAGAGGCCTTGGATT  74

Query   75  CCGACAGACTCGAGGATACAAGAGCTTAGCAGGGTGTCTTGGCCATGGTCCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGACAGACTCGAGGATACAAGAGCTTAGCAGGGTGTCTTGGCCATGGTCCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCT  148

Query  149  TCACGCTCTTGGCTGGGCTCCTTGTCCAAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCACGCTCTTGGCTGGGCTCCTTGTCCAAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAA  222

Query  223  GACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGA  296

Query  297  GATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCT  370

Query  371  ACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAG  444

Query  445  GAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCT  518
            |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct  445  GAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTG-----------------------------------------------  471

Query  519  GACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACGG  592
                                                                                      
Sbjct  472  --------------------------------------------------------------------------  471

Query  593  AGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTG  666
                                                                                      
Sbjct  472  --------------------------------------------------------------------------  471

Query  667  AAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCAGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTTGAAGAC  740
                                                                                      
Sbjct  472  --------------------------------------------------------------------------  471

Query  741  TGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTA  814
                   |||||||||||||.||.|||||||..|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  472  -------GAACGCCTGTGCCACCCCTGTCCCTGGGAATGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTA  538

Query  815  ACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAACT  888
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  539  ACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCATCACCGCCTGCAAAGAAGTGGGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAAGT  612

Query  889  GCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTCAGACCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct  613  GCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGTCTTCCAGAAGTAACCGCTTCACCTGGATGGGACTTTCAGATCT  686

Query  963  AAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGAACAGTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||.|||.|||.||||||||.|
Sbjct  687  AAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTTGCCCAGCTTCAAGCAGTATTGGAACAGAG  760

Query 1037  GAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGATGTGAC  1110
            ||||.||||||||....|||.|.||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||.|...||||.|.
Sbjct  761  GAGAGCCCAACAACGTTGGGGAGGAAGACTGCGCGGAATTTAGTGGCAATGGCTGGAACGACGACAAATGTAAT  834

Query 1111  GTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAG---CCTGCTTCAGAGACGAA--------------------  1161
            .|||.|||.|.||||||||||||||||.||||||   ||||||.|||.||.|||                    
Sbjct  835  CTTGCCAAATTCTGGATCTGCAAAAAGTCCGCAGCCTCCTGCTCCAGGGATGAAGAACAGTTTCTTTCTCCAGC  908

Query 1162  ----------------------------  1161
                                        
Sbjct  909  CCCTGCCACCCCAAACCCCCCTCCTGCG  936