Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473292
• Subject: NM_001144907.2
• Aligned Length: 1180
• Identities: 949
• Gaps: 203

Alignment

Query    1  ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAGGAGG----AACAGCTGAGAGGCCTTG  70
            |||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.||.|    ||||.| .||.|||.|..
Sbjct    1  ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGGGTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAAGAAGATCCAACAAC-CAGTGGCATCA  73

Query   71  GA----TTCCGACAGAC-------TCGAG--GATACAAGAGCTTAGCAGGGTGTCTTGGCCATGGTCCCCTGGT  131
            ||    ||||.|.||||       ||.||  ||||||                   ||||||            
Sbjct   74  GACTTTTTCCAAGAGACTTTCAATTCCAGCAGATACA-------------------TGGCCA------------  116

Query  132  GCTGCAACTCCTCTCC--TTCACGCTCTTGGCTGGGCTCCTTGTCCAAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAG  203
                |||...||||.|  |||   ||.||       ||.||||.||.||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  117  ----CAAGAGCTCTACAGTTC---CTTTT-------CTTCTTGGCCCAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCCTAAG  176

Query  204  TCAGGAACAATCCAGGCAAGACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAG  277
            |||||||||||||..|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  177  TCAGGAACAATCCGAGCAAGACGCAATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAG  250

Query  278  AGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAA  351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct  251  AGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAA  324

Query  352  TCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAA  425
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||                                        
Sbjct  325  TCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCC----------------------------------------  358

Query  426  GCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGC  499
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  359  -----------------------------GGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGC  403

Query  500  AGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAG  573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  404  AGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAG  477

Query  574  ATCTACCAGGAGCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTA  647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  478  ATCTACCAGGAGCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTA  551

Query  648  CCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCAGCAGCAAATCTATCAAG  721
            |||||||||||||||||||||||||||||||                                           
Sbjct  552  CCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTG-------------------------------------------  582

Query  722  AACTGACCGATTTGAAGACTGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGA  795
                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  583  --------------------------GAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGA  630

Query  796  AACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCA  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  631  AACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCA  704

Query  870  GCTCGTCGTAATCAAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCT  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  705  GCTCGTCGTAATCAAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCT  778

Query  944  GGATGGGACTTTCAGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTC  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  779  GGATGGGACTTTCAGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTC  852

Query 1018  CAGCGGTACTGGAACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTG  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  853  CAGCGGTACTGGAACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTG  926

Query 1092  GAACGACAATCGATGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAGCCTGCTTCAGAGACGAA  1161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  927  GAACGACAATCGATGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAGCCTGCTTCAGAGACGAA  996