Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473305
- Subject:
- XM_017003527.1
- Aligned Length:
- 2736
- Identities:
- 2067
- Gaps:
- 669
Alignment
Query 1 ATGCCCGCCATGCCCTCCAGCGGCCCCGGGGACACCAGCAGCTCTGCTGCGGAGCGGGAGGAGGACCGAAAGGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGGAGAGGAGCAGGAGGAGCCGCGTGGCAAGGAGGAGCGCCAAGAGCCCAGCACCACGGCACGGAAGGTGGGGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GGCCTGGGAGGAAGCGCAAGCACCCCCCGGTGGAAAGCGGTGACACGCCAAAGGACCCTGCGGTGATCTCCAAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TCCCCATCCATGGCCCAGGACTCAGGCGCCTCAGAGCTATTACCCAATGGGGACTTGGAGAAGCGGAGTGAGCC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CCAGCCAGAGGAGGGGAGCCCTGCTGGGGGGCAGAAGGGCGGGGCCCCAGCAGAGGGAGAGGGTGCAGCTGAGA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CCCTGCCTGAAGCCTCAAGAGCAGTGGAAAATGGCTGCTGCACCCCCAAGGAGGGCCGAGGAGCCCCTGCAGAA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GCGGGCAAAGAACAGAAGGAGACCAACATCGAATCCATGAAAATGGAGGGCTCCCGGGGCCGGCTGCGGGGTGG 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 CTTGGGCTGGGAGTCCAGCCTCCGTCAGCGGCCCATGCCGAGGCTCACCTTCCAGGCGGGGGACCCCTACTACA 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TCAGCAAGCGCAAGCGGGACGAGTGGCTGGCACGCTGGAAAAGGGAGGCTGAGAAGAAAGCCAAGGTCATTGCA 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 GGAATGAATGCTGTGGAAGAAAACCAGGGGCCCGGGGAGTCTCAGAAGGTGGAGGAGGCCAGCCCTCCTGCTGT 740
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---ATGAATGCTGTGGAAGAAAACCAGGGGCCCGGGGAGTCTCAGAAGGTGGAGGAGGCCAGCCCTCCTGCTGT 71
Query 741 GCAGCAGCCCACTGACCCCGCATCCCCCACTGTGGCTACCACGCCTGAGCCCGTGGGGTCCGATGCTGGGGACA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 72 GCAGCAGCCCACTGACCCCGCATCCCCCACTGTGGCTACCACGCCTGAGCCCGTGGGGTCCGATGCTGGGGACA 145
Query 815 AGAATGCCACCAAAGCAGGCGATGACGAGCCAGAGTACGAGGACGGCCGGGGCTTTGGCATTGGGGAGCTGGTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146 AGAATGCCACCAAAGCAGGCGATGACGAGCCAGAGTACGAGGACGGCCGGGGCTTTGGCATTGGGGAGCTGGTG 219
Query 889 TGGGGGAAACTGCGGGGCTTCTCCTGGTGGCCAGGCCGCATTGTGTCTTGGTGGATGACGGGCCGGAGCCGAGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 220 TGGGGGAAACTGCGGGGCTTCTCCTGGTGGCCAGGCCGCATTGTGTCTTGGTGGATGACGGGCCGGAGCCGAGC 293
Query 963 AGCTGAAGGCACCCGCTGGGTCATGTGGTTCGGAGACGGCAAATTCTCAGTGGTGTGTGTTGAGAAGCTGATGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 AGCTGAAGGCACCCGCTGGGTCATGTGGTTCGGAGACGGCAAATTCTCAGTGGTGTGTGTTGAGAAGCTGATGC 367
Query 1037 CGCTGAGCTCGTTTTGCAGTGCGTTCCACCAGGCCACGTACAACAAGCAGCCCATGTACCGCAAAGCCATCTAC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368 CGCTGAGCTCGTTTTGCAGTGCGTTCCACCAGGCCACGTACAACAAGCAGCCCATGTACCGCAAAGCCATCTAC 441
Query 1111 GAGGTCCTGCAGGTGGCCAGCAGCCGCGCGGGGAAGCTGTTCCCGGTGTGCCACGACAGCGATGAGAGTGACAC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442 GAGGTCCTGCAGGTGGCCAGCAGCCGCGCGGGGAAGCTGTTCCCGGTGTGCCACGACAGCGATGAGAGTGACAC 515
Query 1185 TGCCAAGGCCGTGGAGGTGCAGAACAAGCCCATGATTGAATGGGCCCTGGGGGGCTTCCAGCCTTCTGGCCCTA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 TGCCAAGGCCGTGGAGGTGCAGAACAAGCCCATGATTGAATGGGCCCTGGGGGGCTTCCAGCCTTCTGGCCCTA 589
Query 1259 AGGGCCTGGAGCCACCAGAAGAAGAGAAGAATCCCTACAAAGAAGTGTACACGGACATGTGGGTGGAACCTGAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 AGGGCCTGGAGCCACCAGAAGAAGAGAAGAATCCCTACAAAGAAGTGTACACGGACATGTGGGTGGAACCTGAG 663
Query 1333 GCAGCTGCCTACGCACCACCTCCACCAGCCAAAAAGCCCCGGAAGAGCACAGCGGAGAAGCCCAAGGTCAAGGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 GCAGCTGCCTACGCACCACCTCCACCAGCCAAAAAGCCCCGGAAGAGCACAGCGGAGAAGCCCAAGGTCAAGGA 737
Query 1407 GATTATTGATGAGCGCACAAGAGAGCGGCTGGTGTACGAGGTGCGGCAGAAGTGCCGGAACATTGAGGACATCT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 GATTATTGATGAGCGCACAAGAGAGCGGCTGGTGTACGAGGTGCGGCAGAAGTGCCGGAACATTGAGGACATCT 811
Query 1481 GCATCTCCTGTGGGAGCCTCAATGTTACCCTGGAACACCCCCTCTTCGTTGGAGGAATGTGCCAAAACTGCAAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 GCATCTCCTGTGGGAGCCTCAATGTTACCCTGGAACACCCCCTCTTCGTTGGAGGAATGTGCCAAAACTGCAAG 885
Query 1555 AACTGCTTTCTGGAGTGTGCGTACCAGTACGACGACGACGGCTACCAGTCCTACTGCACCATCTGCTGTGGGGG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 AACTGCTTTCTGGAGTGTGCGTACCAGTACGACGACGACGGCTACCAGTCCTACTGCACCATCTGCTGTGGGGG 959
Query 1629 CCGTGAGGTGCTCATGTGCGGAAACAACAACTGCTGCAGGTGCTTTTGCGTGGAGTGTGTGGACCTCTTGGTGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 CCGTGAGGTGCTCATGTGCGGAAACAACAACTGCTGCAGGTGCTTTTGCGTGGAGTGTGTGGACCTCTTGGTGG 1033
Query 1703 GGCCGGGGGCTGCCCAGGCAGCCATTAAGGAAGACCCCTGGAACTGCTACATGTGCGGGCACAAGGGTACCTAC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 GGCCGGGGGCTGCCCAGGCAGCCATTAAGGAAGACCCCTGGAACTGCTACATGTGCGGGCACAAGGGTACCTAC 1107
Query 1777 GGGCTGCTGCGGCGGCGAGAGGACTGGCCCTCCCGGCTCCAGATGTTCTTCGCTAATAACCACGACCAGGAATT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 GGGCTGCTGCGGCGGCGAGAGGACTGGCCCTCCCGGCTCCAGATGTTCTTCGCTAATAACCACGACCAGGAATT 1181
Query 1851 TGACCCTCCAAAGGTTTACCCACCTGTCCCAGCTGAGAAGAGGAAGCCCATCCGGGTGCTGTCTCTCTTTGATG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 TGACCCTCCAAAGGTTTACCCACCTGTCCCAGCTGAGAAGAGGAAGCCCATCCGGGTGCTGTCTCTCTTTGATG 1255
Query 1925 GAATCGCTACAGGGCTCCTGGTGCTGAAGGACTTGGGCATTCAGGTGGACCGCTACATTGCCTCGGAGGTGTGT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 GAATCGCTACAGGGCTCCTGGTGCTGAAGGACTTGGGCATTCAGGTGGACCGCTACATTGCCTCGGAGGTGTGT 1329
Query 1999 GAGGACTCCATCACGGTGGGCATGGTGCGGCACCAGGGGAAGATCATGTACGTCGGGGACGTCCGCAGCGTCAC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 GAGGACTCCATCACGGTGGGCATGGTGCGGCACCAGGGGAAGATCATGTACGTCGGGGACGTCCGCAGCGTCAC 1403
Query 2073 ACAGAAGCATATCCAGGAGTGGGGCCCATTCGATCTGGTGATTGGGGGCAGTCCCTGCAATGACCTCTCCATCG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404 ACAGAAGCATATCCAGGAGTGGGGCCCATTCGATCTGGTGATTGGGGGCAGTCCCTGCAATGACCTCTCCATCG 1477
Query 2147 TCAACCCTGCTCGCAAGGGCCTCTACGAGGGCACTGGCCGGCTCTTCTTTGAGTTCTACCGCCTCCTGCATGAT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 TCAACCCTGCTCGCAAGGGCCTCTACGAGGGCACTGGCCGGCTCTTCTTTGAGTTCTACCGCCTCCTGCATGAT 1551
Query 2221 GCGCGGCCCAAGGAGGGAGATGATCGCCCCTTCTTCTGGCTCTTTGAGAATGTGGTGGCCATGGGCGTTAGTGA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 GCGCGGCCCAAGGAGGGAGATGATCGCCCCTTCTTCTGGCTCTTTGAGAATGTGGTGGCCATGGGCGTTAGTGA 1625
Query 2295 CAAGAGGGACATCTCGCGATTTCTCGAGTCCAACCCTGTGATGATTGATGCCAAAGAAGTGTCAGCTGCACACA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 CAAGAGGGACATCTCGCGATTTCTCGAGTCCAACCCTGTGATGATTGATGCCAAAGAAGTGTCAGCTGCACACA 1699
Query 2369 GGGCCCGCTACTTCTGGGGTAACCTTCCCGGTATGAACAGGCCGTTGGCATCCACTGTGAATGATAAGCTGGAG 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700 GGGCCCGCTACTTCTGGGGTAACCTTCCCGGTATGAACAGGCCGTTGGCATCCACTGTGAATGATAAGCTGGAG 1773
Query 2443 CTGCAGGAGTGTCTGGAGCATGGCAGGATAGCCAAGTTCAGCAAAGTGAGGACCATTACTACGAGGTCAAACTC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 CTGCAGGAGTGTCTGGAGCATGGCAGGATAGCCAAGTTCAGCAAAGTGAGGACCATTACTACGAGGTCAAACTC 1847
Query 2517 CATAAAGCAGGGCAAAGACCAGCATTTTCCTGTCTTCATGAATGAGAAAGAGGACATCTTATGGTGCACTGAAA 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 CATAAAGCAGGGCAAAGACCAGCATTTTCCTGTCTTCATGAATGAGAAAGAGGACATCTTATGGTGCACTGAAA 1921
Query 2591 TGGAAAGGGTATTTGGTTTCCCAGTCCACTATACTGACGTCTCCAACATGAGCCGCTTGGCGAGGCAGAGACTG 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 TGGAAAGGGTATTTGGTTTCCCAGTCCACTATACTGACGTCTCCAACATGAGCCGCTTGGCGAGGCAGAGACTG 1995
Query 2665 CTGGGCCGGTCATGGAGCGTGCCAGTCATCCGCCACCTCTTCGCTCCGCTGAAGGAGTATTTTGCGTGTGTG 2736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 CTGGGCCGGTCATGGAGCGTGCCAGTCATCCGCCACCTCTTCGCTCCGCTGAAGGAGTATTTTGCGTGTGTG 2067