Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473323
- Subject:
- XM_011512109.3
- Aligned Length:
- 3625
- Identities:
- 2175
- Gaps:
- 1442
Alignment
Query 1 ATGCCTGTGCGCAGGGGGCATGTGGCACCACAAAATACATTTCTGGGGACCATCATTCGGAAATTTGAAGGGCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCTGTGCGCAGGGGGCATGTGGCACCACAAAATACATTTCTGGGGACCATCATTCGGAAATTTGAAGGGCA 74
Query 75 AAATAAAAAATTTATCATTGCAAATGCCAGAGTGCAGAACTGTGCCATCATTTATTGCAACGATGGGTTCTGTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAATAAAAAATTTATCATTGCAAATGCCAGAGTGCAGAACTGTGCCATCATTTATTGCAACGATGGGTTCTGTG 148
Query 149 AGATGACTGGTTTCTCCAGGCCAGATGTCATGCAAAAGCCATGCACCTGCGACTTTCTCCATGGACCCGAGACC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGATGACTGGTTTCTCCAGGCCAGATGTCATGCAAAAGCCATGCACCTGCGACTTTCTCCATGGACCCGAGACC 222
Query 223 AAGAGGCATGATATTGCCCAAATTGCCCAGGCATTGCTGGGGTCAGAAGAGAGGAAAGTGGAGGTCACCTACTA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGAGGCATGATATTGCCCAAATTGCCCAGGCATTGCTGGGGTCAGAAGAGAGGAAAGTGGAGGTCACCTACTA 296
Query 297 TCACAAAAATGGGTCCACTTTTATTTGTAACACTCACATAATTCCAGTGAAAAACCAAGAGGGCGTGGCTATGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCACAAAAATGGGTCCACTTTTATTTGTAACACTCACATAATTCCAGTGAAAAACCAAGAGGGCGTGGCTATGA 370
Query 371 TGTTCATCATTAATTTTGAATATGTGACGGATAATGAAAACGCTGCCACCCCAGAGAGGGTAAACCCAATATTA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGTTCATCATTAATTTTGAATATGTGACGGATAATGAAAACGCTGCCACCCCAGAGAGGGTAAACCCAATATTA 444
Query 445 CCAATCAAAACTGTAAACCGGAAATTTTTTGGGTTCAAATTCCCTGGTCTGAGAGTTCTCACTTACAGAAAGCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCAATCAAAACTGTAAACCGGAAATTTTTTGGGTTCAAATTCCCTGGTCTGAGAGTTCTCACTTACAGAAAGCA 518
Query 519 GTCCTTACCACAAGAAGACCCCGATGTGGTGGTCATCGATTCATCTAAACACAGTGATGATTCAGTAGCCATGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTCCTTACCACAAGAAGACCCCGATGTGGTGGTCATCGATTCATCTAAACACAGTGATGATTCAGTAGCCATGA 592
Query 593 AGCATTTTAAGTCTCCTACAAAAGAAAGCTGCAGCCCCTCTGAAGCAGATGACACAAAAGCTTTGATACAGCCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGCATTTTAAGTCTCCTACAAAAGAAAGCTGCAGCCCCTCTGAAGCAGATGACACAAAAGCTTTGATACAGCCC 666
Query 667 AGCAAATGTTCTCCCTTGGTGAATATATCCGGACCTCTTGACCATTCCTCTCCCAAAAGGCAATGGGACCGACT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGCAAATGTTCTCCCTTGGTGAATATATCCGGACCTCTTGACCATTCCTCTCCCAAAAGGCAATGGGACCGACT 740
Query 741 CTACCCTGACATGCTGCAGTCAAGTTCCCAGCTGTCCCATTCCAGATCAAGGGAAAGCTTATGTAGTATACGGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTACCCTGACATGCTGCAGTCAAGTTCCCAGCTGTCCCATTCCAGATCAAGGGAAAGCTTATGTAGTATACGGA 814
Query 815 GAGCATCTTCGGTCCATGATATAGAAGGATTCGGCGTCCACCCCAAGAACATATTTAGAGACCGACATGCCAGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GAGCATCTTCGGTCCATGATATAGAAGGATTCGGCGTCCACCCCAAGAACATATTTAGAGACCGACATGCCAGC 888
Query 889 GAA---------------------------------------------GGGCCTTTTAATCATATCAAGTCAAG 917
||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAAGACAATGGTCGCAATGTCAAAGTTTCACGTTCCTGGATGGCAGGGGGGCCTTTTAATCATATCAAGTCAAG 962
Query 918 CCTCCTGGGATCCACATCAGATTCAAACCTCAACAAATACAGCACCATTAACAAGATTCCACAGCTCACTCTGA 991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCTCCTGGGATCCACATCAGATTCAAACCTCAACAAATACAGCACCATTAACAAGATTCCACAGCTCACTCTGA 1036
Query 992 ATTTTTCAGAGGTCAAAACTGAGAAAAAGAATTCATCACCTCCTTCTTCAGATAAAACCATTATTGCACCCAAG 1065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATTTTTCAGAGGTCAAAACTGAGAAAAAGAATTCATCACCTCCTTCTTCAGATAAAACCATTATTGCACCCAAG 1110
Query 1066 GTTAAAGATCGAACACACAATGTGACTGAGAAAGTGACCCAGGTTCTCTCTTTAGGAGCAGATGTCCTACCTGA 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTTAAAGATCGAACACACAATGTGACTGAGAAAGTGACCCAGGTTCTCTCTTTAGGAGCAGATGTCCTACCTGA 1184
Query 1140 ATACAAACTGCAGACACCACGCATCAACAAGTTTACGATATTGCACTACAGCCCTTTCAAGGCAGTCTGGGACT 1213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ATACAAACTGCAGACACCACGCATCAACAAGTTTACGATATTGCACTACAGCCCTTTCAAGGCAGTCTGGGACT 1258
Query 1214 GGCTTATCCTGCTGTTGGTCATATACACTGCTATATTTACTCCCTACTCTGCAGCCTTCCTCCTCAATGACAGA 1287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGCTTATCCTGCTGTTGGTCATATACACTGCTATATTTACTCCCTACTCTGCAGCCTTCCTCCTCAATGACAGA 1332
Query 1288 GAAGAACAGAAAAGACGAGAATGTGGCTATTCTTGTAGCCCTTTGAATGTGGTAGACTTGATTGTGGATATTAT 1361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAAGAACAGAAAAGACGAGAATGTGGCTATTCTTGTAGCCCTTTGAATGTGGTAGACTTGATTGTGGATATTAT 1406
Query 1362 GTTTATCATAGATATTTTAATAAACTTCAGAACAACATATGTAAATCAGAATGAAGAAGTGGTAAGTGATCCCG 1435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GTTTATCATAGATATTTTAATAAACTTCAGAACAACATATGTAAATCAGAATGAAGAAGTGGTAAGTGATCCCG 1480
Query 1436 CCAAAATAGCAATACACTACTTCAAAGGCTGGTTCCTGATTGACATGGTTGCAGCAATTCCTTTTGACTTGCTG 1509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCAAAATAGCAATACACTACTTCAAAGGCTGGTTCCTGATTGACATGGTTGCAGCAATTCCTTTTGACTTGCTG 1554
Query 1510 ATTTTTGGATCAGGTTCTGATGAGACAACAACATTAATTGGTCTTTTGAAGACTGCCCGACTCCTCCGTCTTGT 1583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATTTTTGGATCAGGTTCTGATGAGACAACAACATTAATTGGTCTTTTGAAGACTGCCCGACTCCTCCGTCTTGT 1628
Query 1584 GCGCGTGGCCAGGAAACTGGATCGATATTCAGAATATGGCGCTGCTGTTCTAATGCTCTTAATGTGCATCTTTG 1657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCGCGTGGCCAGGAAACTGGATCGATATTCAGAATATGGCGCTGCTGTTCTAATGCTCTTAATGTGCATCTTTG 1702
Query 1658 CCCTGATTGCTCACTGGCTGGCTTGCATTTGGTATGCGATTGGGAATGTAGAAAGGCCTTACCTGACTGACAAA 1731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCCTGATTGCTCACTGGCTGGCTTGCATTTGGTATGCGATTGGGAATGTAGAAAGGCCTTACCTGACTGACAAA 1776
Query 1732 ATCGGATGGTTGGATTCCTTAGGACAGCAAATTGGGAAACGTTACAATGACAGTGACTCAAGTTCTGGACCATC 1805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ATCGGATGGTTGGATTCCTTAGGACAGCAAATTGGGAAACGTTACAATGACAGTGACTCAAGTTCTGGACCATC 1850
Query 1806 CATTAAAGACAAATACGTCACAGCACTTTATTTTACCTTCAGCAGTTTAACCAGTGTAGGATTCGGGAATGTGT 1879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CATTAAAGACAAATACGTCACAGCACTTTATTTTACCTTCAGCAGTTTAACCAGTGTAGGATTCGGGAATGTGT 1924
Query 1880 CTCCTAACACGAATTCGGAGAAAATCTTTTCAATTTGTGTCATGTTGATTGGCTCACTAATGTATGCAAGCATT 1953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CTCCTAACACGAATTCGGAGAAAATCTTTTCAATTTGTGTCATGTTGATTGGCTCACTAATGTATGCAAGCATT 1998
Query 1954 TTTGGGAATGTATCTGCAATTATCCAAAGACTATACTCGGGAACTGCCAGGTACCACATGCAGATGCTGCGAGT 2027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TTTGGGAATGTATCTGCAATTATCCAAAGACTATACTCGGGAACTGCCAGGTACCACATGCAGATGCTGCGAGT 2072
Query 2028 AAAAGAGTTCATTCGCTTTCACCAAATCCCCAACCCTCTGAGGCAACGTCTTGAAGAATATTTCCAGCACGCAT 2101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AAAAGAGTTCATTCGCTTTCACCAAATCCCCAACCCTCTGAGGCAACGTCTTGAAGAATATTTCCAGCACGCAT 2146
Query 2102 GGACTTACACCAATGGCATTGACATGAACATGGTATGTATGTCT-----GTTTTCCAAAATG-----AAAGTGC 2165
|||||||||||||||||||||||||||||||||| .|| ||||.|||.|||| ||
Sbjct 2147 GGACTTACACCAATGGCATTGACATGAACATGGT-------CCTAAAGGGTTTCCCAGAATGCTTACAA----- 2208
Query 2166 CGCAGGCATT-------AT-------AGTGATAGC--CAAAA-TGGAA-------------------------- 2196
||||.|||| || ||..||.|| ||||| ||.||
Sbjct 2209 -GCAGACATTTGTCTACATCTCAACCAGACATTGCTGCAAAACTGCAAAGCCTTTCGGGGGGCAAGTAAAGGTT 2281
Query 2197 -------------------------------------------------------------------------- 2196
Sbjct 2282 GCCTTAGAGCTTTGGCAATGAAGTTCAAAACCACCCATGCACCTCCAGGAGACACCCTCGTTCACTGTGGGGAT 2355
Query 2197 -------------------------------------------------------------------------- 2196
Sbjct 2356 GTCCTCACTGCACTTTATTTCTTATCCAGAGGCTCCATTGAAATTCTCAAAGATGACATTGTGGTGGCTATTCT 2429
Query 2197 -------------------------------------------------------------------------- 2196
Sbjct 2430 GGGAAAAAATGATATATTTGGAGAAATGGTTCATCTTTATGCCAAACCTGGAAAGTCTAATGCAGATGTAAGAG 2503
Query 2197 -------------------------------------------------------------------------- 2196
Sbjct 2504 CCCTCACATACTGTGACTTGCATAAGATTCAGCGAGAAGACTTGTTAGAGGTTTTGGATATGTATCCTGAGTTT 2577
Query 2197 -------------------------------------------------------------------------- 2196
Sbjct 2578 TCTGATCACTTTCTAACAAACCTAGAGTTGACTTTCAACCTAAGGCATGAGAGCGCAAAGGCTGATCTCCTACG 2651
Query 2197 -------------------------------------------------------------------------- 2196
Sbjct 2652 ATCACAATCCATGAATGATTCAGAAGGAGACAACTGTAAACTAAGAAGAAGGAAATTGTCATTTGAAAGTGAAG 2725
Query 2197 -------------------------------------------------------------------------- 2196
Sbjct 2726 GAGAGAAAGAAAACAGTACAAATGATCCTGAAGACTCTGCAGATACCATAAGACATTATCAGAGTTCCAAGAGA 2799
Query 2197 -------------------------------------------------------------------------- 2196
Sbjct 2800 CACTTTGAAGAGAAAAAAAGCAGATCCTCATCTTTCATCTCCTCCATTGATGATGAACAAAAGCCGCTCTTCTC 2873
Query 2197 -------------------------------------------------------------------------- 2196
Sbjct 2874 AGGAATAGTAGACTCTTCTCCAGGAATAGGGAAAGCATCTGGGCTCGATTTTGAAGAAACAGTGCCCACCTCAG 2947
Query 2197 -------------------------------------------------------------------------- 2196
Sbjct 2948 GAAGAATGCACATAGATAAAAGAAGTCACTCTTGCAAAGATATCACTGACATGCGAAGCTGGGAACGAGAAAAT 3021
Query 2197 -------------------------------------------------------------------------- 2196
Sbjct 3022 GCACATCCCCAGCCTGAAGACTCCAGTCCATCTGCACTTCAGCGAGCTGCCTGGGGTATCTCTGAAACCGAAAG 3095
Query 2197 -------------------------------------------------------------------------- 2196
Sbjct 3096 CGACCTCACCTACGGGGAAGTGGAACAAAGATTAGATCTGCTCCAGGAGCAACTTAACAGGCTTGAATCCCAAA 3169
Query 2197 -------------------------------------------------------------------------- 2196
Sbjct 3170 TGACCACTGACATCCAGACCATCTTACAGTTGCTGCAGAAACAAACCACTGTGGTCCCCCCAGCCTACAGTATG 3243
Query 2197 -------------------------------------------------------------------------- 2196
Sbjct 3244 GTAACAGCAGGATCAGAATATCAGAGACCCATCATCCAGCTGATGAGAACCAGTCAACCGGAAGCATCCATCAA 3317
Query 2197 -------------------------------------------------------------------------- 2196
Sbjct 3318 AACTGACCGAAGTTTCAGCCCTTCCTCACAATGTCCTGAATTTCTAGACCTTGAAAAATCTAAACTTAAATCCA 3391
Query 2197 -------------------------------------------------------------------------- 2196
Sbjct 3392 AAGAATCCCTTTCAAGTGGGGTGCATCTGAACACAGCTTCAGAAGACAACTTGACTTCACTTTTAAAACAAGAC 3465
Query 2197 -------------------------------------------------------------------------- 2196
Sbjct 3466 AGTGATCTCTCTTTAGAGCTTCACCTGCGGCAAAGAAAAACTTACGTTCATCCAATTAGGCATCCTTCTTTGCC 3539
Query 2197 ------------------------------------------------------------------------- 2196
Sbjct 3540 AGATTCATCCCTAAGCACTGTAGGAATCGTGGGTCTTCATAGGCATGTTTCTGATCCTGGTCTTCCAGGGAAA 3612
