Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473342
- Subject:
- XM_011238864.2
- Aligned Length:
- 1286
- Identities:
- 994
- Gaps:
- 142
Alignment
Query 1 ATGGAGCCGCTGAAGGTGGAAAAGTTCGCAACCGCCAACAGGGGAAACGGGCTGCGCGCCGTGACCCCGCTGCG 74
||||||.|.||||||||||||||||||.|.||.||||||.||||||||||||||||.||.|||.|.||.|||||
Sbjct 1 ATGGAGGCACTGAAGGTGGAAAAGTTCACGACTGCCAACCGGGGAAACGGGCTGCGTGCTGTGGCTCCACTGCG 74
Query 75 CCCCGGAGAGCTACTCTTCCGCTCGGATCCCTTGGCGTACACGGTGTGCAAGGGGAGTCGTGGCGTCGTCTGCG 148
||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 75 CCCCGGGGAGCTGCTCTTCCGCTCCGACCCCTTGGCTTACACTGTGTGCAAGGGGAGTCGTGGCGTAGTCTGTG 148
Query 149 ACCGCTGCCTTCTCGGGAAGGAAAAGCTGATGCGATGCTCTCAGTGCCGCGTCGCCAAATACTGTAGTGCTAAG 222
|.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||..|.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 149 ATCGCTGCCTACTGGGGAAGGAGAAGCTGATGCGTTGTTCTCAATGCCGAATTGCCAAATACTGCAGTGCCAAG 222
Query 223 TGTCAGAAAAAAGCTTGGCCAGACCACAAGCGGGAATGCAAATGCCTTAAAAGCTGCAAACCCAGATATCCTCC 296
||||||||||||||.|||||.|||||||..||||||||||..||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 223 TGTCAGAAAAAAGCCTGGCCGGACCACAGACGGGAATGCAGTTGTCTTAAAAGCTGCAAGCCCAGATATCCGCC 296
Query 297 AGACTCCGTTCGACTTCTTGGCAGAGTTGTCTTCAAACTTATGGATGGAGCACCTTCAGAATCAGAGAAGCTTT 370
.||||||||..|||||||.|||||.|||.||.||||.||.|||||||.|...||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 297 CGACTCCGTGAGACTTCTGGGCAGGGTTATCGTCAAGCTGATGGATGAAAAGCCCTCAGAGTCAGAGAAACTTT 370
Query 371 ACTCATTTTATGATCTGGAGTCAAATATTAACAAACTGACTGAAGATAGGAAAGAGGGCCTCAGGCAACTCGTA 444
|.||||||||||||||||||||.|||||||.||||||.||||||||||.||||||||||||.||||||||.|.|
Sbjct 371 ATTCATTTTATGATCTGGAGTCCAATATTAGCAAACTCACTGAAGATAAGAAAGAGGGCCTGAGGCAACTTGCA 444
Query 445 ATGACATTTCAACATTTCATGAGAGAAGAAATACAGGATGCCTCTCAGCTGCCACCTGCCTTTGACCTTTTTGA 518
|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||.|.||||||||||||||
Sbjct 445 ATGACTTTTCAACATTTCATGAGAGAGGAGATCCAGGATGCGTCTCAGCTGCCGCCTTCTTTTGACCTTTTTGA 518
Query 519 AGCCTTTGCAAAAGTGATCTGCAACTCTTTCACCATCTGTAATGCGGAGATGCAGGAAGTTGGTGTTGGCCTAT 592
||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|
Sbjct 519 AGCCTTTGCAAAAGTGATCTGCAATTCGTTCACTATCTGCAACGCGGAGATGCAGGAGGTCGGCGTTGGCCTGT 592
Query 593 ATCCCAGTATCTCTTTGCTCAATCACAGCTGTGACCCCAACTGTTCGATTGTGTTCAATGGGCCCCACCTCTTA 666
|.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 593 ACCCCAGTATGTCTTTGCTGAATCACAGCTGTGACCCCAACTGCTCCATCGTATTCAACGGGCCCCACCTCTTA 666
Query 667 CTGCGAGCAGTCCGAGACATCGAGGTGGGAGAGGAGCTCACCATCTGCTACCTGGATATGCTGATGACCAGTGA 740
|||||.|||||.||.||.||.||.|..|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 667 CTGCGTGCAGTGCGGGAAATTGAAGCAGGAGAGGAGCTCACCATCTGCTACCTGGACATGCTGATGACCAGCGA 740
Query 741 GGAGCGCCGGAAGCAGCTGAGGGACCAGTACTGCTTTGAATGTGACTGTTTCCGTTGCCAAACCCAGGACAAGG 814
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGAACGCCGGAAGCAGCTGAGGGACCAGTACTGCTTTGAGTGTGACTGCATCCGATGCCAAACCCAGGACAAGG 814
Query 815 ATGCTGATATGCTAACTGGTGATGAGCAAGTATGGAAGGAAGTTCAAGAATCCCTGAAAAAAATTGAAGAACTG 888
|||||||.||||||||.|||||.||||||.||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 815 ATGCTGACATGCTAACGGGTGACGAGCAAATATGGAAGGAGGTTCAAGAGTCGCTGAAGAAAATCGAAGAGCTG 888
Query 889 AAGGCACACTGGAAGTGGGAGCAGGTTCTGGCCATGTGCCAGGCGATCATAAGCAGCAATTCTGAACGGCTTCC 962
|||||.||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||.|||||||||..|.||||||||
Sbjct 889 AAGGCGCACTGGAAGTGGGAGCAGGTTCTGGCGCTGTGCCAGGCGATCATAAACAGCAATTCCAACCGGCTTCC 962
Query 963 CGATATCAACATCTACCAGCTGAAGGTGCTCGACTGCGCCATGGATGCCTGCATCAACCTCGGCCTGTTGGAGG 1036
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||..||.||||||
Sbjct 963 CGACATCAACATCTACCAGCTGAAGGTGCTCGACTGTGCCATGGATGCCTGCATCAACCTGGGGATGCTGGAGG 1036
Query 1037 AAGCCTTGTTCTATGGTACTCGGACCATGGAGCCATACAGGATTTTTTTCCCAGGAAGCCATCCCGTCAGAGGG 1110
|.||.||||||||.|..|..||.|||||||||||.|||.|||||||||||||.||| ||.||
Sbjct 1037 AGGCGTTGTTCTACGCCATGCGCACCATGGAGCCGTACCGGATTTTTTTCCCTGGA-----------CAAAG-- 1097
Query 1111 GTTCAAGTG--ATGAAAGTTGGCAAACTGCAGCTACATCAAGGCATGTTTCCCCAAGCAATGAAGAATCTGAGA 1182
|||.| ||..|.|||| |.|.|||| |.|||..|||.|| ||
Sbjct 1098 ----AAGAGAAATCGAGGTTG-------------AGAACAAG-----------CCAGCGGTGAGGA---TG--- 1137
Query 1183 CTGGCTTTTGATATTATGAGAGTGACACATGGCAGAGAACACAGCCTGATTGAAGATTTGATTCTACTTTTAGA 1256
||.||||||
Sbjct 1138 ---------------------------CAGGGCAGA-------------------------------------- 1146
Query 1257 AGAATGCGACGCCAACATCAGAGCATCC 1284
Sbjct 1147 ---------------------------- 1146