Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473373
• Subject: NM_001177507.1
• Aligned Length: 1725
• Identities: 1628
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGCAGTCCCCCTGGAAAATCCTTACGGTGGCGCCTCTATTCTTGCTCCTGTCTCTTCAGTCCTCAGCCTCTCC  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGCAGTCCCCCTGGAAAATCCTTACGGTGGCGCCTCTATTCTTGCTCCTGTCTCTTCAGTCCTCGGCCTCTCC  74

Query   75  AGCCAACGATGACCAGTCCAGGCCCAGCCTCTCGAATGGGCACACCTGTGTAGGGTGTGTGCTGGTGGTGTCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct   75  AGCCAACGATGACCAGTCCAGGCCCAGCCTCTCGAATGGGCACACCTGTGTA----------------------  126

Query  149  TAATAGAACAGCTTGCTCAAGTTCACAACTCGACGGTCCAGGCCTCGATGGAGAGACTGTGCAGCTACCTGCCT  222
                                                                                      
Sbjct  127  --------------------------------------------------------------------------  126

Query  223  GAAAAACTGTTCTTGAAAACCACCTGCTATTTAGTCATTGACAAGTTTGGATCAGACATCATAAAACTGCTTAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  127  GAAAAACTGTTCTTGAAAACCACCTGCTATTTAGTCATTGACAAGTTTGGATCAGACATCATAAAACTGCTTAG  200

Query  297  CGCAGATATGAATGCTGATGTGGTATGTCACACTCTGGAGTTTTGTAAACAGAACACTGGCCAACCATTGTGTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  201  CGCAGATATGAATGCTGATGTGGTATGTCACACTCTGGAGTTTTGTAAACAGAACACTGGCCAACCATTGTGTC  274

Query  371  ATCTCTACCCTCTTCCCAAGGAGACATGGAAATTTACACTACAGAAGGCAAGACAAATTGTCAAGAAGTCCCCG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  275  ATCTCTACCCTCTTCCCAAGGAGACATGGAAATTTACACTACAGAAGGCAAGACAAATTGTCAAGAAGTCCCCG  348

Query  445  ATTCTGAAATATTCTAGAAGTGGTTCTGACATTTGTTCACTCCCGGTTTTGGCCAAGATCTGCCAGAAAATTAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  349  ATTCTGAAATATTCTAGAAGTGGTTCTGACATTTGTTCACTCCCGGTTTTGGCCAAGATCTGCCAGAAAATTAA  422

Query  519  ATTAGCTATGGAACAGTCTGTGCCATTCAAAGATGTGGATTCAGACAAATACAGCGTTTTCCCAACACTGCGGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  423  ATTAGCTATGGAACAGTCTGTGCCATTCAAAGATGTGGATTCAGACAAATACAGCGTTTTCCCAACACTGCGGG  496

Query  593  GCTATCACTGGCGGGGGAGAGACTGTAATGACAGCGACGAGTCAGTGTACCCAGGTAGAAGGCCGAACAACTGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  497  GCTATCACTGGCGGGGGAGAGACTGTAATGACAGCGACGAGTCAGTGTACCCAGGTAGAAGGCCGAACAACTGG  570

Query  667  GATGTCCATCAGGATTCAAACTGTAATGGCATTTGGGGTGTCGATCCAAAAGATGGAGTTCCATATGAGAAGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  571  GATGTCCATCAGGATTCAAACTGTAATGGCATTTGGGGTGTCGATCCAAAAGATGGAGTTCCATATGAGAAGAA  644

Query  741  ATTCTGTGAAGGTTCACAGCCCAGGGGAATCATTTTGCTGGGAGACTCAGCTGGGGCTCATTTTCACATCTCTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  ATTCTGTGAAGGTTCACAGCCCAGGGGAATCATTTTGCTGGGAGACTCAGCTGGGGCTCATTTTCACATCTCTC  718

Query  815  CTGAATGGATCACAGCGTCGCAGATGTCTTTGAACTCTTTCATCAATCTACCAACAGCCCTTACCAACGAGCTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  CTGAATGGATCACAGCGTCGCAGATGTCTTTGAACTCTTTCATCAATCTACCAACAGCCCTTACCAACGAGCTT  792

Query  889  GACTGGCCCCAACTCTCTGGTGCTACAGGATTTCTGGACTCCACTGTTGGAATTAAAGAAAAATCTATTTACCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  GACTGGCCCCAACTCTCTGGTGCTACAGGATTTCTGGACTCCACTGTTGGAATTAAAGAAAAATCTATTTACCT  866

Query  963  TCGCTTATGGAAAAGAAACCACTGTAATCACAGGGACTACCAGAATATTTCAAGAAATGGTGCATCTTCCCGAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  TCGCTTATGGAAAAGAAACCACTGTAATCACAGGGACTACCAGAATATTTCAAGAAATGGTGCATCTTCCCGAA  940

Query 1037  ACCTGAAGAAATTTATAGAAAGCTTGTCTAGAAACAAGGTGTTGGACTATCCCGCCATCGTTATATATGCCATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  941  ACCTGAAGAAATTTATAGAAAGCTTGTCTAGAAACAAGGTGTTGGACTATCCCGCCATCGTTATATATGCCATG  1014

Query 1111  ATTGGAAATGATGTCTGCAGTGGGAAGAGTGACCCAGTCCCAGCCATGACCACTCCTGAGAAACTCTACTCCAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  ATTGGAAATGATGTCTGCAGTGGGAAGAGTGACCCAGTCCCAGCCATGACCACTCCTGAGAAACTCTACTCCAA  1088

Query 1185  CGTCATGCAGACTCTGAAGCATCTAAATTCCCACCTGCCCAATGGCAGCCATGTTATTTTGTATGGCTTACCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  CGTCATGCAGACTCTGAAGCATCTAAATTCCCACCTGCCCAATGGCAGCCATGTTATTTTGTATGGCTTACCAG  1162

Query 1259  ATGGAACCTTTCTCTGGGATAATTTGCACAACAGATATCATCCTCTCGGCCAGCTAAATAAAGACATGACCTAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  ATGGAACCTTTCTCTGGGATAATTTGCACAACAGATATCATCCTCTCGGCCAGCTAAATAAAGACATGACCTAT  1236

Query 1333  GCGCAGTTGTACTCCTTCCTGAACTGCCTCCAGGTCAGCCCCTGCCACGGCTGGATGTCTTCCAACAAGACGTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  GCGCAGTTGTACTCCTTCCTGAACTGCCTCCAGGTCAGCCCCTGCCACGGCTGGATGTCTTCCAACAAGACGTT  1310

Query 1407  GCGGACTCTCACTTCAGAGAGAGCAGAGCAACTCTCCAACACACTGAAAAAAATTGCAGCCAGTGAGAAATTTA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  GCGGACTCTCACTTCAGAGAGAGCAGAGCAACTCTCCAACACACTGAAAAAAATTGCAGCCAGTGAGAAATTTA  1384

Query 1481  CAAACTTCAATCTTTTCTACATGGATTTTGCCTTCCATGAAATCATACAGGAGTGGCAGAAGAGAGGCGGACAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385  CAAACTTCAATCTTTTCTACATGGATTTTGCCTTCCATGAAATCATACAGGAGTGGCAGAAGAGAGGCGGACAG  1458

Query 1555  CCCTGGCAGCTCATCGAGCCCGTGGATGGATTCCACCCCAACGAGGTGGCTTTGCTGTTGTTGGCGGATCATTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459  CCCTGGCAGCTCATCGAGCCCGTGGATGGATTCCACCCCAACGAGGTGGCTTTGCTGTTGTTGGCGGATCATTT  1532

Query 1629  CTGGAAAAAGGTGCAGCTCCAGTGGCCCCAAATCCTGGGAAAGGAGAATCCGTTCAACCCCCAGATTAAACAGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1533  CTGGAAAAAGGTGCAGCTCCAGTGGCCCCAAATCCTGGGAAAGGAGAATCCGTTCAACCCCCAGATTAAACAGG  1606

Query 1703  TGTTTGGAGACCAAGGCGGGCAC  1725
            |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1607  TGTTTGGAGACCAAGGCGGGCAC  1629