Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473373
• Subject: XM_011515333.2
• Aligned Length: 2064
• Identities: 1649
• Gaps: 414

Alignment

Query    1  ATGCAGTCCCCCTGGAAAATCCTTACGGTGGCGCCTCTATTCTTGCTCCTGTCTCTTCAGTCCTCAGCCTCTCC  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGCAGTCCCCCTGGAAAATCCTTACGGTGGCGCCTCTATTCTTGCTCCTGTCTCTTCAGTCCTCGGCCTCTCC  74

Query   75  AGCCAACGATGACCAGTCCAGGCCCAGCCTCTCGAATGGGCACACCTGTGTAGGGTGTGTGCTGGTGGTGTCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCCAACGATGACCAGTCCAGGCCCAGCCTCTCGAATGGGCACACCTGTGTAGGGTGTGTGCTGGTGGTGTCTG  148

Query  149  TAATAGAACAGCTTGCTCAAGTTCACAACTCGACGGTCCAGGCCTCGATGGAGAGACTGTGCAGCTACCTGCCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAATAGAACAGCTTGCTCAAGTTCACAACTCGACGGTCCAGGCCTCGATGGAGAGACTGTGCAGCTACCTGCCT  222

Query  223  GAAAAACTGTTCTTGAAAACCACCTGCTATTTAGTCATTGACAAGTTTGGATCAGACATCATAAAACTGCTTAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAAAACTGTTCTTGAAAACCACCTGCTATTTAGTCATTGACAAGTTTGGATCAGACATCATAAAACTGCTTAG  296

Query  297  CGCAGATATGAATGCTGATGTGGTATGTCACACTCTGGAGTTTTGTAAACAGAACACTGGCCAACCATTGTGTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGCAGATATGAATGCTGATGTGGTATGTCACACTCTGGAGTTTTGTAAACAGAACACTGGCCAACCATTGTGTC  370

Query  371  ATCTCTACCCTCTTCCCAAGGAGACATGGAAATTTACACTACAGAAGGCAAGACAAATTGTCAAGAAGTCCCCG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATCTCTACCCTCTTCCCAAGGAGACATGGAAATTTACACTACAGAAGGCAAGACAAATTGTCAAGAAGTCCCCG  444

Query  445  ATTCTGAAATATTCTAGAAGTGGTTCTGACATTTGTTCACTCCCGGTTTTGGCCAAGATCTGCCAGAAAATTAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTCTGAAATATTCTAGAAGTGGTTCTGACATTTGTTCACTCCCGGTTTTGGCCAAGATCTGCCAGAAAATTAA  518

Query  519  ATTAGCTATGGAACAGTCTGTGCCATTCAAAGATGTGGATTCAGACAAATACAGCGTTTTCCCAACACTGCGGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATTAGCTATGGAACAGTCTGTGCCATTCAAAGATGTGGATTCAGACAAATACAGCGTTTTCCCAACACTGCGGG  592

Query  593  GCTATCACTGGCGGGGGAGAGACTGTAATGACAGCGACGAGTCAGTGTACCCAGGTAGAAGGCCGAACAACTGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTATCACTGGCGGGGGAGAGACTGTAATGACAGCGACGAGTCAGTGTACCCAGGTAGAAGGCCGAACAACTGG  666

Query  667  GATGTCCATCAGGATTCAAACTGTAATGGCATTTGGGGTGTCGATCCAAAAGATGGAGTTCCATATGAGAAGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATGTCCATCAGGATTCAAACTGTAATGGCATTTGGGGTGTCGATCCAAAAGATGGAGTTCCATATGAGAAGAA  740

Query  741  ATTCTGTGAAGGTTCACAGCCCAGGGGAATCATTTTGCTGGGAGACTCAGCTGGGGCTCATTTTCACATCTCTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATTCTGTGAAGGTTCACAGCCCAGGGGAATCATTTTGCTGGGAGACTCAGCTGGGGCTCATTTTCACATCTCTC  814

Query  815  CTGAATGGATCACAGCGTCGCAGATGTCTTTGAACTCTTTCATCAATCTACCAACAGCCCTTACCAACGAGCTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGAATGGATCACAGCGTCGCAGATGTCTTTGAACTCTTTCATCAATCTACCAACAGCCCTTACCAACGAGCTT  888

Query  889  GACTGGCCCCAACTCTCTGGTGCTACAGGATTTCTGGACTCCACTGTTGGAATTAAAGAAAAATCTATTTACCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACTGGCCCCAACTCTCTGGTGCTACAGGATTTCTGGACTCCACTGTTGGAATTAAAGAAAAATCTATTTACCT  962

Query  963  TCGCTTATGGAAAAGAAACCACTGTAATCACAGGGACTACCAGAATATTTCAAGAAATGGTGCATCTTCCCGAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCGCTTATGGAAAAGAAACCACTGTAATCACAGGGACTACCAGAATATTTCAAGAAATGGTGCATCTTCCCGAA  1036

Query 1037  ACCTGAAGAAATTTATAGAAAGCTTGTCTAGAAACAAGGTGTTGGACTATCCCGCCATCGTTATATATGCCATG  1110
            |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct 1037  ACCTGAAGAAATTTATAGAAA-----------------------------------------------------  1057

Query 1111  ATTGGAAATGATGTCTGCAGTGGGAAGAGTGACCCAGTCCCAGCCATGACCACTCCTGAGAAACTCTACTCCAA  1184
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058  ----------------------GGAAGAGTGACCCAGTCCCAGCCATGACCACTCCTGAGAAACTCTACTCCAA  1109

Query 1185  CGTCATGCAGACTCTGAAGCATCTAAATTCCCACCTGCCCAATGGCAGCCATGTTATTTTGTATGGCTTACCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  CGTCATGCAGACTCTGAAGCATCTAAATTCCCACCTGCCCAATGGCAGCCATGTTATTTTGTATGGCTTACCAG  1183

Query 1259  ATGGAACCTTTCTCTGGGATAATTTGCACAACAGATATCATCCTCTCGGCCAGCTAAATAAAGACATGACCTAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  ATGGAACCTTTCTCTGGGATAATTTGCACAACAGATATCATCCTCTCGGCCAGCTAAATAAAGACATGACCTAT  1257

Query 1333  GCGCAGTTGTACTCCTTCCTGAACTGCCTCCAGGTCAGCCCCTGCCACGGCTGGATGTCTTCCAACAAGACGTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  GCGCAGTTGTACTCCTTCCTGAACTGCCTCCAGGTCAGCCCCTGCCACGGCTGGATGTCTTCCAACAAGACGTT  1331

Query 1407  GCGGACTCTCACTTCAGAGAGAGCAGAGCAACTCTCCAACACACTGAAAAAAATTGCAGCCAGTGAGAAATTTA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  GCGGACTCTCACTTCAGAGAGAGCAGAGCAACTCTCCAACACACTGAAAAAAATTGCAGCCAGTGAGAAATTTA  1405

Query 1481  CAAACTTCAATCTTTTCTACATGGATTTTGCCTTCCATGAAATCATACAGGAGTGGCAGAAGAGAGGCGGACAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  CAAACTTCAATCTTTTCTACATGGATTTTGCCTTCCATGAAATCATACAGGAGTGGCAGAAGAGAGGCGGACAG  1479

Query 1555  CCCTGGCAGCTCATCGAGCCCGTGGATGGATTCCACCCCAACGAG-----------------------------  1599
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                             
Sbjct 1480  CCCTGGCAGCTCATCGAGCCCGTGGATGGATTCCACCCCAACGAGAGAAAGAGCATCCTCCTCAAAGGCATATT  1553

Query 1600  --------------------------------------------------------------------------  1599
                                                                                      
Sbjct 1554  AATGACAAGCCAGACACTGGACAACCAAGAATGGACCCAGCTAACATCATGGATAAAGGGAAACCTGACATGCG  1627

Query 1600  ----------------GTGGCTTTGCTGTTGTTGGCGGATCATTTCTGGAAAAAGGTGCAGCTCCAGTGGCCCC  1657
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628  ACAGCAGAACCAGAGAGTGGCTTTGCTGTTGTTGGCGGATCATTTCTGGAAAAAGGTGCAGCTCCAGTGGCCCC  1701

Query 1658  AAATCCTGGGAAAGGAGAATCCGTTCAACCCCCAGATTAAACAGGTGTTTGGAGACCAAGGCGGGCAC------  1725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct 1702  AAATCCTGGGAAAGGAGAATCCGTTCAACCCCCAGATTAAACAGGTGTTTGGAGACCAAGGCGGGCACTGAGCC  1775

Query 1726  --------------------------------------------------------------------------  1725
                                                                                      
Sbjct 1776  TCTCAGGAGCATGCACCCCTGGGGAGCACAGGGAGGCAGAGGCTTGGGTAAACTCATTCCACAAACCCTATGGG  1849

Query 1726  --------------------------------------------------------------------------  1725
                                                                                      
Sbjct 1850  GGCTGCCACGTCACAGGCCCAAAGGACTCTTCTTCAGCAGCATCTTTGCAAAATGTCTTTCTCTCAATGAAGAG  1923

Query 1726  ------------------------------------------------------------------  1725
                                                                              
Sbjct 1924  CATATCTGGACGACTGTGCAATGCTGTGTGCTCCCGGGATCAGTAACCCTTCCGCTGTTCCTGAAA  1989