Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473387
• Subject: NM_001280542.1
• Aligned Length: 1172
• Identities: 989
• Gaps: 139

Alignment

Query    1  ATGGCGACTGTCATTCACAACCCCCTGAAAGCGCTCGGGGACCAGTTCTACAAGGAAGCCATTGAGCACTGCCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGACTGTCATTCACAACCCCCTGAAAGCGCTCGGGGACCAGTTCTACAAGGAAGCCATTGAGCACTGCCG  74

Query   75  GAGTTACAACTCACGGCTGTGTGCAGAGCGCAGCGTGCGTCTTCCCTTCCTGGACTCACAGACTGGGGTGGCCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGTTACAACTCACGGCTGTGTGCAGAGCGCAGCGTGCGTCTTCCCTTCCTGGACTCACAGACTGGGGTGGCCC  148

Query  149  AGAACAACTGCTACATCTGGATGGAGAAGAGGCACCGAGGCCCAGGCCTTGCCCCGGGCCAGCTGTATACATAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAACAACTGCTACATCTGGATGGAGAAGAGGCACCGAGGCCCAGGCCTTGCCCCGGGCCAGCTGTATACATAC  222

Query  223  CCTGCCCGCTGCTGGCGCAAGAAGAGACGACTGCACCCACCTGAAGATCCAAAACTGCGGCTGCTGGAGATAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTGCCCGCTGCTGGCGCAAGAAGAGACGATTGCACCCACCTGAAGATCCAAAACTGCGGCTGCTGGAGATAAA  296

Query  297  ACCTGAAGTGGAGCTTCCCCTGAAGAAGGATGGGTTCACCTCAGAGAGCACCACGCTGGAAGCCTTGCTCCGTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACCTGAAGTGGAGCTTCCCCTGAAGAAGGATGGGTTCACCTCAGAGAGCACCACGCTGGAAGCCTTGCTCCGTG  370

Query  371  GCGAGGGGGTTGAGAAGAAGGTGGATGCCAGGGAGGAGGAAAGCATCCAGGAAATACAGAGGGTTTTGGAAAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCGAGGGGGTTGAGAAGAAGGTGGATGCCAGGGAGGAGGAAAGCATCCAGGAAATACAGAGGGTTTTGGAAAAT  444

Query  445  GATGAAAATGTAGAAGAAGGGAATGAAGAAGAGGATTTGGAAGAGGATATTCCCAAGCGAAAGAACAGGACTAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGAAAATGTAGAAGAAGGGAATGAAGAAGAGGATTTGGAAGAGGATATTCCCAAGCGAAAGAACAGGACTAG  518

Query  519  AGGACGGGCTCACGGCTCTGCAGGGGGCAGGAGGAGGCACGACGCCGCCTCTCAGGAAGACCACGACAAACCTT  592
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGACGGGCTCGCGGCTCTGCAGGGGGCAGGAGGAGGCACGACGCCGCCTCTCAGGAAGACCACGACAAACCTT  592

Query  593  ACGTCTGTGACATCTGTGGCAAGCGCTACAAGAACCGACCGGGGCTCAGCTACCACTATGCTCACACTCACCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACGTCTGTGACATCTGTGGCAAGCGCTACAAGAACCGACCGGGGCTCAGCTACCACTATGCTCACACTCACCTG  666

Query  667  GCCAGCGAGGAGGGGGATGAAGCTCAAGACCAGGAGACTCGGTCCCCACCCAACCACAGAAATGAGAACCACAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCAGCGAGGAGGGGGATGAAGCTCAAGACCAGGAGACTCGGTCCCCACCCAACCACAGAAATGAGAACCACAG  740

Query  741  GCCCCAGAAAGGACCGGATGGAACAGTCATTCCCAATAACTACTGTGACTTCTGCTTGGGGGGCTCCAACATGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCCCAGAAAGGACCGGATGGAACAGTCATTCCCAATAACTACTGTGACTTCTGCTTGGGGGGCTCCAACATGA  814

Query  815  ACAAGAAGAGTGGGCGGCCTGAAGAGCTGGTGTCCTGCGCAGACTGTGGACGCTCTGCTCA-------------  875
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||             
Sbjct  815  ACAAGAAGAGTGGGCGGCCTGAAGAGCTGGTGTCCTGCGCAGACTGTGGACGCTCTGGTCACCCAACCTGCCTG  888

Query  876  ---TTTGGGAGGA----GAAGGCAGGAAGGAG------AAG--------GAGGCAGCGGCCGCAGCACGTACCA  928
               |||      |    |||  ||.||..|||      |||        |.|||||.|              ||
Sbjct  889  CAGTTT------ACCCTGAA--CATGACCGAGGCTGTCAAGACCTACAAGTGGCAGTG--------------CA  940

Query  929  CGGAGGACTTATTCGGT-TCC--------ACGTCAGAAAGTGA-CACGTCAACT----TTCCGC---GGCTTTG  985
            ..|||..|..||.|.|| |||        ||.|||||.|.||| .||  ||.||    |||.||   |.||.||
Sbjct  941  TAGAGTGCAAATCCTGTATCCTCTGTGGGACCTCAGAGAATGATGAC--CAGCTACTCTTCTGCGATGACTGTG  1012

Query  986  A-TGAGG-----------ACGATT------------TGGAAGAGCCTCGCTCCTGTCGAGGACGCCGCAGTGGC  1035
            | .||||           ||..||            |||..||||    |.||.|  .||||.||.|.||..||
Sbjct 1013  ACCGAGGCTATCACATGTACTGTTTAAATCCCCCGGTGGCTGAGC----CCCCAG--AAGGAAGCTGGAGCTGC  1080

Query 1036  C---------GGGGTTCGCCCACAGCAGATAAAAAG-----------GGCAGTTGC------  1071
            |         |||....||.||.||     |.||||           |||   |||      
Sbjct 1081  CACTTATGCTGGGAACTGCTCAAAG-----AGAAAGCCTCAGCCTTTGGC---TGCCAGGCC  1134