Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473387
• Subject: NM_001280544.1
• Aligned Length: 1244
• Identities: 1057
• Gaps: 181

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTTTTATGGCAGAATAAATGGGCGTAACTTCGCCGCATCCTCGCTGCCGGTTGCTTTCGCTGCAACACCGCT  74

Query    1  -------------------------------------------------------------------------A  1
                                                                                     |
Sbjct   75  GATGCTGTTTCTACCGAACCCACAACTGATTTTCAGTTTCCCCATTTCCAGCCGAAATCACATAACCGGGCTGA  148

Query    2  TGGCGACTG------TCA---------------TTCACA-----ACCCCCTGAAAGCGCTCGGGGACCAGTTCT  49
            ||.|..|||      |||               ||||||     |||       || |||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCCACCTGGTAAACTCAAGTTAGAGAACCTATTTCACATGTGCACC-------AG-GCTCGGGGACCAGTTCT  214

Query   50  ACAAGGAAGCCATTGAGCACTGCCGGAGTTACAACTCACGGCTGTGTGCAGAGCGCAGCGTGCGTCTTCCCTTC  123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  215  ACAAGGAAGCCATTGAGCACTGCCGGAGTTACAACTCACGGCTGTGTGCAGAGCGCAGCGTGCGTCTTCCCTTC  288

Query  124  CTGGACTCACAGACTGGGGTGGCCCAGAACAACTGCTACATCTGGATGGAGAAGAGGCACCGAGGCCCAGGCCT  197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  289  CTGGACTCACAGACTGGGGTGGCCCAGAACAACTGCTACATCTGGATGGAGAAGAGGCACCGAGGCCCAGGCCT  362

Query  198  TGCCCCGGGCCAGCTGTATACATACCCTGCCCGCTGCTGGCGCAAGAAGAGACGACTGCACCCACCTGAAGATC  271
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  363  TGCCCCGGGCCAGCTGTATACATACCCTGCCCGCTGCTGGCGCAAGAAGAGACGATTGCACCCACCTGAAGATC  436

Query  272  CAAAACTGCGGCTGCTGGAGATAAAACCTGAAGTGGAGCTTCCCCTGAAGAAGGATGGGTTCACCTCAGAGAGC  345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  437  CAAAACTGCGGCTGCTGGAGATAAAACCTGAAGTGGAGCTTCCCCTGAAGAAGGATGGGTTCACCTCAGAGAGC  510

Query  346  ACCACGCTGGAAGCCTTGCTCCGTGGCGAGGGGGTTGAGAAGAAGGTGGATGCCAGGGAGGAGGAAAGCATCCA  419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  511  ACCACGCTGGAAGCCTTGCTCCGTGGCGAGGGGGTTGAGAAGAAGGTGGATGCCAGGGAGGAGGAAAGCATCCA  584

Query  420  GGAAATACAGAGGGTTTTGGAAAATGATGAAAATGTAGAAGAAGGGAATGAAGAAGAGGATTTGGAAGAGGATA  493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  585  GGAAATACAGAGGGTTTTGGAAAATGATGAAAATGTAGAAGAAGGGAATGAAGAAGAGGATTTGGAAGAGGATA  658

Query  494  TTCCCAAGCGAAAGAACAGGACTAGAGGACGGGCTCACGGCTCTGCAGGGGGCAGGAGGAGGCACGACGCCGCC  567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659  TTCCCAAGCGAAAGAACAGGACTAGAGGACGGGCTCGCGGCTCTGCAGGGGGCAGGAGGAGGCACGACGCCGCC  732

Query  568  TCTCAGGAAGACCACGACAAACCTTACGTCTGTGACATCTGTGGCAAGCGCTACAAGAACCGACCGGGGCTCAG  641
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  733  TCTCAGGAAGACCACGACAAACCTTACGTCTGTGACATCTGTGGCAAGCGCTACAAGAACCGACCGGGGCTCAG  806

Query  642  CTACCACTATGCTCACACTCACCTGGCCAGCGAGGAGGGGGATGAAGCTCAAGACCAGGAGACTCGGTCCCCAC  715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  807  CTACCACTATGCTCACACTCACCTGGCCAGCGAGGAGGGGGATGAAGCTCAAGACCAGGAGACTCGGTCCCCAC  880

Query  716  CCAACCACAGAAATGAGAACCACAGGCCCCAGAAAGGACCGGATGGAACAGTCATTCCCAATAACTACTGTGAC  789
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  881  CCAACCACAGAAATGAGAACCACAGGCCCCAGAAAGGACCGGATGGAACAGTCATTCCCAATAACTACTGTGAC  954

Query  790  TTCTGCTTGGGGGGCTCCAACATGAACAAGAAGAGTGGGCGGCCTGAAGAGCTGGTGTCCTGCGCAGACTGTGG  863
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  TTCTGCTTGGGGGGCTCCAACATGAACAAGAAGAGTGGGCGGCCTGAAGAGCTGGTGTCCTGCGCAGACTGTGG  1028

Query  864  ACGCTCTGCTCATTTGGGAGGAGAAGGCAGGAAGGAGAAGGAGGCAGCGGCCGCAGCACGTACCACGGAGGACT  937
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029  ACGCTCTGCTCATTTGGGAGGAGAAGGCAGGAAGGAGAAGGAGGCAGCGGCCGCAGCACGTACCACGGAGGACT  1102

Query  938  TATTCGGTTCCACGTCAGAAAGTGACACGTCAACTTTCCGCGGCTTTGATGAGGACGATTTGGAAGAGCCTCGC  1011
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103  TATTCGGTTCCACGTCAGAAAGTGACACGTCAACTTTCCACGGCTTTGATGAGGACGATTTGGAAGAGCCTCGC  1176

Query 1012  TCCTGTCGAGGACGCCGCAGTGGCCGGGGTTCGCCCACAGCAGATAAAAAGGGCAGTTGC  1071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177  TCCTGTCGAGGACGCCGCAGTGGCCGGGGTTCGCCCACAGCAGATAAAAAGGGCAGTTGC  1236