Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473410
• Subject: NM_013785.2
• Aligned Length: 1323
• Identities: 1189
• Gaps: 24

Alignment

Query    1  ATGTGTGTTTGTCAAACCATGGAAGTGGGGCAGTATGGCAAGAATGCAAGTCGGGCTGGAGACCGGGGAGTCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGTGTGTTTGTCAAACCATGGAAGTGGGGCAGTATGGCAAGAACGCAAGTCGGGCCGGAGACCGAGGAGTCCT  74

Query   75  CCTGGAGCCCTTCATCCACCAAGTAGGCGGACACAGCAGCATGATGCGTTACGACGATCACACTGTGTGCAAGC  148
            ||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct   75  CCTGGAGCCCTTCATCCATCAGGTGGGCGGGCACAGCAGCATGATGCGGTACGACGACCACACTGTGTGCAAAC  148

Query  149  CCCTCATCTCCCGGGAACAGCGCTTTTACGAGTCCCTCCCTCCCGAAATGAAGGAGTTCACCCCTGAATACAAA  222
            |.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||
Sbjct  149  CTCTCATCTCCCGGGAACAGCGCTTCTACGAGTCACTCCCTCCCGAAATGAAGGAATTCACCCCAGAGTACAAA  222

Query  223  GGCGTGGTATCTGTCTGTTTTGAGGGGGACAGTGATGGTTACATCAACTTAGTGGCCTATCCTTATGTGGAAAG  296
            ||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  223  GGCGTGGTTTCTGTCTGTTTTGAGGGAGACAGTGATGGTTACATCAACTTGGTAGCCTATCCTTATGTGGAGAG  296

Query  297  TGAGACTGTGGAACAGGATGACACAACAGAACGGGAGCAACCTCGGCGCAAACACTCCCGCCGGAGCCTGCACC  370
            |||.|||||.||.||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  TGAAACTGTAGAGCAAGATGACACACCAGAGCGGGAGCAACCTCGGCGCAAACACTCCCGCCGGAGCCTGCATC  370

Query  371  GGTCAGGCAGTGGCAGTGACCACAAGGAGGAGAAAGCCAGCCTGTCCCTTGAGACCTCTGAGAGCTCACAGGAG  444
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  GGTCTGGCAGTGGTAGTGACCACAAGGAGGAGAAAGCCAGCCTGTCCTTTGAGACCTCTGAGAGCTCCCAGGAG  444

Query  445  GCAAAGAGTCCGAAGGTGGAGCTGCACAGCCACTCAGAGGTCCCTTTCCAGATGCTAGATGGCAACAGTGGCTT  518
            |||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||.||.||..|
Sbjct  445  GCAAAGAGTCCAAAGGTGGAACTGCACAGCCACTCAGATGTCCCTTTCCAGATGCTAGACAGCAATAGCGGTCT  518

Query  519  GAGTTCTGAGAAGATCAGCCACAACCCCTGGAGCCTGCGTTGTCACAAGCAGCAGCTGAGCCGCATGCGCTCCG  592
            |||.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAGCTCCGAGAAGATCAGCTACAACCCCTGGAGCCTGCGCTGCCACAAGCAGCAGCTGAGCCGCATGCGCTCCG  592

Query  593  AGTCCAAGGACCGAAAGCTCTACAAGTTCCTCCTGCTTGAGAACGTGGTGCACCACTTCAAGTACCCCTGCGTG  666
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  AGTCCAAGGACCGAAAACTCTACAAGTTCCTCCTGCTTGAGAACGTGGTACACCACTTCAAGTACCCCTGTGTG  666

Query  667  TTGGACCTGAAGATGGGCACGCGGCAGCATGGCGATGACGCGTCAGCTGAGAAGGCAGCCCGGCAGATGCGGAA  740
            .|||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||.||||
Sbjct  667  CTGGACTTGAAGATGGGTACCCGGCAGCATGGCGATGATGCTTCAGCTGAAAAGGCTGCCCGGCAGATGAGGAA  740

Query  741  ATGCGAGCAGAGCACATCAGCCACGCTGGGCGTCAGGGTCTGCGGCATGCAGGTGTACCAGCTGGACACAGGGC  814
            .||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  741  GTGTGAGCAGAGCACGTCGGCCACGCTGGGGGTCAGGGTCTGTGGCATGCAGGTGTACCAGCTGGACACAGGTC  814

Query  815  ATTACCTCTGCAGGAACAAGTACTATGGCCGTGGGCTCTCCATTGAAGGCTTCCGCAATGCCCTCTATCAATAT  888
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct  815  ATTACCTCTGCAGGAATAAGTACTATGGCCGTGGACTCTCCATCGAGGGCTTCCGCAATGCGCTCTATCAGTAC  888

Query  889  CTGCACAATGGCCTGGACCTGCGACGTGACCTGTTTGAGCCTATCCTGAGCAAACTGCGGGGCCTGAAAGCTGT  962
            ||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  889  CTGCACAATGGCTTGGACCTTCGACGTGACCTTTTTGAGCCAATCCTGAGCAAACTGCGGGGCCTCAAAGCCGT  962

Query  963  GCTGGAGCGGCAGGCCTCTTACCGCTTCTACTCCAGTTCCCTGCTTGTCATCTATGATGGCAAGGAGTGCCGGG  1036
            .|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct  963  ACTGGAGCGGCAGGCCTCCTACCGCTTCTACTCCAGCTCCCTGCTTGTCATCTATGATGGCAAGGAGT------  1030

Query 1037  CTGAGTCCTGCCTGGACCGCCGGTCTGAGATGCGTCTCAAGCACCTGGACATGGTGCTCCCTGAGGTGGCGTCA  1110
                              |||||||||||.|.||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.|..||
Sbjct 1031  ------------------GCCGGTCTGAGCTACGTCTCAAGCACGTGGACATGGGGCTCCCTGAGGTGCCACCA  1086

Query 1111  TCCTGTGGCCCCAGCACCAGCCCCAGCAACACCAGCCCCGAGGCGGGTCCCTCCTCTCAGCCCAAGGTGGATGT  1184
            .|||||||||||||||||||.||.||||.||||||.|..|||||.||.|||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 1087  CCCTGTGGCCCCAGCACCAGTCCTAGCAGCACCAGTCTTGAGGCTGGCCCCTCTTCTCCGCCCAAGGTGGATGT  1160

Query 1185  CCGCATGATTGACTTTGCACACAGCACATTCAAGGGCTTCCGGGATGACCCCACCGTGCATGATGGGCCAGACA  1258
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 1161  TCGCATGATTGACTTTGCACACAGCACATTCAAGGGCTTCCGGGATGACCCCACTGTTCACGATGGGCCAGACA  1234

Query 1259  GAGGCTACGTGTTTGGCCTGGAGAACCTCATCAGCATCATGGAACAGATGAGGGACGAGAACCAG  1323
            |||||||.|||||||||.|||||||.||.||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||
Sbjct 1235  GAGGCTATGTGTTTGGCTTGGAGAATCTTATCAGCATCATGGAGCAGATGCGGGATGAGAACCAG  1299