Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473439
- Subject:
- NM_001172157.1
- Aligned Length:
- 2660
- Identities:
- 1592
- Gaps:
- 832
Alignment
Query 1 ---------------------ATGAACCTCCGGTCCCTGGGGACCCACAGAGGTGTGTCTGCTGTGGCTGGTCC 53
.|||||||.|||||.|.||||||||.||||||||||||..||||||.|||.||
Sbjct 1 ATGAACCATCCTGACTACAAGCTGAACCTTCGGTCTCCGGGGACCCCCAGAGGTGTGTCCTCTGTGGTTGGCCC 74
Query 54 ACATGACATTGGTGCTTCGCCAGGTGACAAAAAGTCAAAGAACAGGTCCACACGAGGGAAGAAAAAGAGCATAT 127
...||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAGTGCTGTTGGTGCTTCGCCAGGTGACAAAAAGTCAAAGAACAAGTCCATGCGAGGGAAGAAAAAGAGCATAT 148
Query 128 TTGAAACTTACATGTCCAAGGAGGATGTTTCAGAAGGCTTGAAGAGAGGAACACTCATCCAGGGTGTATTGAGA 201
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTGAAACCTACATGTCCAAGGAGGATGTTTCAGAAGGCTTGAAGAGAGGAACACTTATCCAGGGTGTATTGAGA 222
Query 202 ATTAATCCAAAGAAGTTTCATGAAGCCTTCATTCCTTCCCCGGATGGTGATCGAGACATTTTTATTGATGGGGT 275
||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 223 ATCAACCCAAAGAAGTTTCATGAAGCCTTCATTCCTTCTCCGGATGGTGATCGGGACATTTTTATTGATGGAGT 296
Query 276 TGTTGCTCGTAATAGAGCCTTAAATGGGGATCTGGTGGTCGTGAAACTGCTTCCCGAGGAGCATTGGA------ 343
||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 297 TGTTGCTCGTAATAGAGCCTTAAATGGGGACCTTGTGGTTGTAAAACTGCTTCCTGAGGATCAGTGGAAGCCAA 370
Query 344 ------------------------------------AGGTAGTTAAACCAGAGAGCAATGACAAAGAAACAGAA 381
|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 371 GGATAACCTTGTCTCTGCCTGGAGTGCTGGGATTACAGGCAGTTAAACCAGAGAGCAATGACAAAGAAATAGAA 444
Query 382 GCTGCGTATGAATCAGATATCCCCGAGGAGCTCTGTGGACACCATCTCCCGCAACAGTCCCTGAAAAGCTATAA 455
|||.|.||||||.|.||.|||||.||.|||..|||||||||.||.|.||.|||.|||||||.||||.|||..|.
Sbjct 445 GCTACTTATGAAGCTGACATCCCTGAAGAGGGCTGTGGACATCACCCCCTGCAGCAGTCCCGGAAAGGCTGGAG 518
Query 456 TGACAGTCCTGATGTCATTGTAGAGGCTCAGTTTGATGGCAGCGACTCAGAAGATGGACATGGCATCACACAAA 529
|| ||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.||| ||
Sbjct 519 TG---GTCCTGATGTCATTATAGAGGCTCAGTTTGATGACAGCGACTCAGAAGATAGACATGGCAACAC-CA-- 586
Query 530 ATGTG--CTGGTTGATGGTGTTAAGAAACTCTCAGTTTGTGTTTCTGAGAAAGGAAGAGAGGATGGTGATGCAC 601
||| |||||||||||||||||||||.|.|||.|.|.|..|.||||.|.|||||.|||.|||..|..|.|.|
Sbjct 587 --GTGGCCTGGTTGATGGTGTTAAGAAATTGTCAATCTCTACTCCTGACAGAGGAAAAGAAGATTCTAGTACTC 658
Query 602 CGGTTACAAAAGATGAGACCACCTGCATTTCACAAGACACAAGAGCTTTATCGGAGAAATCCCTGCAAAGATCA 675
|.||||..||||||||||.||||..|||..||||.||||||||||..|||||.|||||.||.||.||.|.||||
Sbjct 659 CAGTTATGAAAGATGAGAACACCCCCATACCACAGGACACAAGAGGCTTATCAGAGAAGTCACTTCAGAAATCA 732
Query 676 GCAAAGGTGGTTTACATCTTGGAGAAAAAACATTCTCGAGCAGCAACCGGCTTCCTCAAACTCTTGGCTGATAA 749
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct 733 GCAAAGGTGGTTTACATCTTGGAGAAAAAGCATTCTCGAGCAGCAACTGGCATCCTGAAACTCTTGGCTGATAA 806
Query 750 GAACAGCGAACTGTTTAGGAAATACGCCCTGTTTTCTCCCTCAGACCACCGAGTGCCTAGAATTTATGTGCCTC 823
||||||.||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 807 GAACAGTGACCTGTTTAAGAAATACGCCCTGTTTTCTCCTTCAGACCACCGAGTACCTAGAATTTACGTACCTC 880
Query 824 TCAAGGACTGTCCCCAGGACTTTGTGGCACGGCCTAAAGATTATGCCAACACACTGTTCATCTGCCGCATTGTG 897
||||||||||||||||||||||..||.|.||.||||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||||..|.
Sbjct 881 TCAAGGACTGTCCCCAGGACTTCATGACCCGACCTAAAGACTTTGCCAACACGCTGTTCATCTGCCGCATCATA 954
Query 898 GACTGGAAGGAGGACTGCAATTTTGCCCTGGGGCAGCTGGCTAAGAGTCTTGGGCAGGCTGGTGAAATTGAGCC 971
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 955 GACTGGAAGGAGGACTGTAATTTTGCCCTGGGGCAACTGGCTAAGAGTCTTGGGCAGGCTGGTGAAATCGAGCC 1028
Query 972 TGAAACAGAAGGAATACTAACAGAGTATGGCGTGGATTTCTCTGATTTCTCTTCAGAAGTTCTAGAATGTCTTC 1045
||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1029 TGAAACAGAAGGGATACTGACAGAATATGGTGTGGACTTCTCTGATTTCTCTTCAGAAGTTCTTGAATGTCTCC 1102
Query 1046 CTCAAGGCCTGCCATGGACAATTCCACCAGAGGAGTTCAGCAAGAGAAGGGATTTAAGAAAAGACTGTATCTTC 1119
|||||.|||||||.||||||||.|||||.||.|||.|..||||||||||.||..||||.|||||||||||||||
Sbjct 1103 CTCAAAGCCTGCCCTGGACAATCCCACCTGATGAGGTGGGCAAGAGAAGAGACCTAAGGAAAGACTGTATCTTC 1176
Query 1120 ACCATTGACCCATCAACCGCCCGAGACCTCGATGATGCCCTCTCCTGCAAGCCACTCGCTGACGGCAACTTCAA 1193
||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||.||||||.||..|||.||||.||||.||||.|
Sbjct 1177 ACCATTGATCCATCAACTGCTCGCGACCTTGATGATGCCCTCGCCTGCAGGCGGCTCACTGATGGCACCTTCGA 1250
Query 1194 AGTGGGAGTTCACATTGCTGACGTGAGTTACTTTGTTCCGGAGGGATCTGATCTGGATAAAGTGGCTGCCGAGA 1267
||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||...|.||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1251 AGTGGGCGTCCACATCGCCGATGTGAGTTACTTTGTTCCTGAGGGATCCTCTTTGGATAAAGTAGCTGCTGAGA 1324
Query 1268 GGGCTACAAGCGTCTACTTGGTTCAAAAGGTGGTCCCCATGCTTCCCAGGCTGCTGTGTGAGGAGCTGTGCAGC 1341
|.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 1325 GAGCCACAAGTGTCTACTTGGTCCAGAAGGTGGTCCCCATGCTTCCCAGGCTTCTGTGTGAGGAACTCTGCAGC 1398
Query 1342 CTCAACCCCATGTCCGACAAGCTGACCTTCTCTGTGATCTGGACACTGACTCCAGAGGGCAAGATCCTTGATGA 1415
||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||..|||||.||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1399 CTCAACCCCATGACTGACAAGCTGACCTTCTCTGTGATCTGGAAGCTGACCCCTGAAGGCAAGATCCTTGAAGA 1472
Query 1416 ATGGTTTGGCCGGACCATCATCCGCTCCTGCACCAAACTTAGCTACGAGCATGCACAGAGCATGATTGAAAGCC 1489
.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||..|
Sbjct 1473 GTGGTTTGGCCGCACTATCATCCGTTCTTGCACCAAACTGAGCTACGACCATGCCCAGAGCATGATCGAAAATC 1546
Query 1490 CAACTGAGAAAATCCCTGCGAAAGAGCTGCCCCCCATTTCCCCAGAGCATAGCAGCGAGGAGGTACACCAGGCC 1563
||||||||||.|||||||.|.|||||||.|||||.|||||.||||||||.|||..|||||||||.||||||||.
Sbjct 1547 CAACTGAGAAGATCCCTGAGGAAGAGCTTCCCCCAATTTCTCCAGAGCACAGCGTCGAGGAGGTGCACCAGGCA 1620
Query 1564 GTCTTGAATCTCCACGGAATTGCCAAGCAGTTACGCCAGCAGCGCTTTGTGGACGGCGCACTTCGTTTGGATCA 1637
|||.||||.||.|||.|.|||||.|||||..|.||||..|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1621 GTCCTGAACCTGCACAGCATTGCAAAGCAACTCCGCCGCCAGCGCTTTGTAGATGGCGCACTCCGTTTAGATCA 1694
Query 1638 GCTAAAGCTTGCTTTCACTCTGGACCACGAGACCGGATTGCCTCAAGGATGTCATATCTATGAGTACCGCGAGA 1711
|||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 1695 GCTGAAGCTTGCTTTTACTCTGGACCATGAGACTGGACTGCCTCAAGGATGTCACATCTATGAGTACCGAGACA 1768
Query 1712 GCAACAA------------------------------------------------------------------- 1718
|||||||
Sbjct 1769 GCAACAAGCTTGTAGAGGAGTTCATGCTCCTGGCCAACATGGCGGTGGCCCACAAGATCTTCCGCACCTTCCCT 1842
Query 1719 ------GCCCTGCTGCGCCGGCACCCCCCGCCCCAAACAAGGATGCTCAGTGACCTGGTGGAATTCTGCGACCA 1786
|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|.|||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1843 GAGCAGGCCCTGCTGCGCCGGCATCCCCCACCACAGACGAAGATGCTCAGTGACCTGGTGGAGTTCTGTGACCA 1916
Query 1787 GATGGGGCTGCCCGTGGACTTCAGCTCCGCAGGAGCCCTCAATAAAAGCC------------------------ 1836
|||||||||||||.||||..|||||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1917 GATGGGGCTGCCCATGGATGTCAGCTCTGCAGGGGCCCTAAATAAAAGCCTGACTAAGACATTTGGAGATGACA 1990
Query 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Sbjct 1991 AGTACTCTCTGGCCCGGAAGGAGGTGCTCACCAACATGTACTCCCGGCCCATGCAGATGGCACTGTACTTCTGC 2064
Query 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Sbjct 2065 TCTGGGATGCTGCAGGACCAGGAGCAGTTCCGGCATTATGCTCTCAACGTTCCCCTCTACACACACTTCACCTC 2138
Query 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Sbjct 2139 TCCCATCCGCCGCTTTGCTGACGTCATAGTGCACCGCCTCCTGGCTGCTGCTCTGGGCTACAGTGAACAGCCAG 2212
Query 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Sbjct 2213 ATGTGGAGCCTGATACCCTACAGAAGCAAGCTGACCACTGCAATGACCGTCGCATGGCTTCCAAACGTGTGCAG 2286
Query 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Sbjct 2287 GAGCTCAGCATCGGCCTCTTCTTCGCAGTTCTAGTAAAGGAGAGTGGCCCCCTGGAGTCCGAAGCCATGGTGAT 2360
Query 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Sbjct 2361 GGGTGTCCTGAACCAAGCTTTCGACGTGCTGGTGCTGCGCTTTGGGGTGCAGAAGCGCATCTACTGCAATGCAC 2434
Query 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Sbjct 2435 TGGCCCTGCGATCCTACAGCTTCCAGAAGGTGGGGAAGAAGCCAGAGCTCACTCTTGTTTGGGAGCCTGATGAC 2508
Query 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Sbjct 2509 CTTGAAGAGGAGCCAACACAGCAGGTCATCACCATCTTCAGCCTGGTGGATGTGGTCCTGCAGGCAGAGGCCAC 2582
Query 1837 ---------------------------------------------------------------------- 1836
Sbjct 2583 AGCCCTCAAGTACAGTGCTATCCTGAAGCGACCAGGCCTGGAGAAGGCGTCTGATGAGGAGCCTGAGGAC 2652
