Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473448
• Subject: XM_017022369.1
• Aligned Length: 1344
• Identities: 1249
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  ATGGCTGGTCCCTTCTCCCGTCTGCTGTCCGCCCGCCCGGGACTCAGGCTCCTGGCTTTGGCCGGAGCGGGGTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGGTCCCTTCTCCCGTCTGCTGTCCGCCCGCCCGGGACTCAGGCTCCTGGCTTTGGCCGGAGCGGGGTC  74

Query   75  TCTAGCCGCTGGGTTTCTGCTCCGACCGGAACCTGTACGAGCTGCCAGTGAACGACGGAGGCTGTATCCCCCG-  147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct   75  TCTAGCCGCTGGGTTTCTGCTCCGACCGGAACCTGTACGAGCTGCCAGTGAACGACGGAGGCTGTATCCCCCGA  148

Query  148  --------------------------------------------------------------------------  147
                                                                                      
Sbjct  149  GCCAGACATGGCCAACTGGACAGCTCCCAGGTAACTGCACTAGGTCTAGGCGTCTGTGCCCTCCCTCCATGGTT  222

Query  148  ------------------AGCGCTGAGTACCCAGACCTCCGAAAGCACAACAACTGCATGGCCAGTCACCTGAC  203
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTGGGTACCCCCTCCCCAGCGCTGAGTACCCAGACCTCCGAAAGCACAACAACTGCATGGCCAGTCACCTGAC  296

Query  204  CCCAGCAGTCTATGCACGGCTCTGCGACAAGACCACACCCACTGGTTGGACGCTAGATCAGTGTATCCAGACTG  277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCAGCAGTCTATGCACGGCTCTGCGACAAGACCACACCCACTGGTTGGACGCTAGATCAGTGTATCCAGACTG  370

Query  278  GCGTGGACAACCCTGGCCACCCCTTCATCAAGACTGTGGGCATGGTGGCTGGAGATGAGGAGACCTATGAGGTA  351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCGTGGACAACCCTGGCCACCCCTTCATCAAGACTGTGGGCATGGTGGCTGGAGATGAGGAGACCTATGAGGTA  444

Query  352  TTTGCTGACCTGTTTGACCCTGTGATCCAAGAGCGACACAATGGATATGACCCCCGGACAATGAAGCACACCAC  425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTGCTGACCTGTTTGACCCTGTGATCCAAGAGCGACACAATGGATATGACCCCCGGACAATGAAGCACACCAC  518

Query  426  GGATCTAGATGCCAGTAAAATCCGTTCTGGCTACTTTGATGAGAGGTATGTATTGTCCTCTAGAGTCAGAACTG  499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGATCTAGATGCCAGTAAAATCCGTTCTGGCTACTTTGATGAGAGGTATGTATTGTCCTCTAGAGTCAGAACTG  592

Query  500  GCCGAAGCATCCGAGGACTCAGTCTGCCTCCAGCTTGCACTCGAGCAGAGCGACGAGAGGTGGAACGTGTTGTG  573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCCGAAGCATCCGAGGACTCAGTCTGCCTCCAGCTTGCACTCGAGCAGAGCGACGAGAGGTGGAACGTGTTGTG  666

Query  574  GTGGATGCACTGAGTGGCCTGAAGGGTGACCTGGCTGGACGTTACTATAGGCTCAGTGAGATGACAGAGGCTGA  647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGGATGCACTGAGTGGCCTGAAGGGTGACCTGGCTGGACGTTACTATAGGCTCAGTGAGATGACAGAGGCTGA  740

Query  648  ACAGCAGCAGCTTATTGATGACCACTTTCTGTTTGATAAGCCTGTGTCCCCGTTGCTGACTGCAGCAGGAATGG  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACAGCAGCAGCTTATTGATGACCACTTTCTGTTTGATAAGCCTGTGTCCCCGTTGCTGACTGCAGCAGGAATGG  814

Query  722  CTCGAGACTGGCCAGATGCTCGTGGAATTTGGCACAACAATGAGAAGAGCTTCCTGATCTGGGTGAATGAGGAG  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCGAGACTGGCCAGATGCTCGTGGAATTTGGCACAACAATGAGAAGAGCTTCCTGATCTGGGTGAATGAGGAG  888

Query  796  GATCATACACGGGTGATCTCCATGGAGAAGGGTGGTAACATGAAGAGAGTGTTTGAAAGATTCTGCCGAGGCCT  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATCATACACGGGTGATCTCCATGGAGAAGGGTGGTAACATGAAGAGAGTGTTTGAAAGATTCTGCCGAGGCCT  962

Query  870  CAAAGAGGTGGAGAGACTTATCCAAGAACGTGGCTGGGAGTTCATGTGGAATGAGCGTTTGGGATACATCTTGA  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAAGAGGTGGAGAGACTTATCCAAGAACGTGGCTGGGAGTTCATGTGGAATGAGCGTTTGGGATACATCTTGA  1036

Query  944  CCTGTCCATCTAACCTGGGCACTGGACTTCGGGCAGGAGTGCACATCAAACTGCCCCTGCTAAGCAAAGATAGC  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTGTCCATCTAACCTGGGCACTGGACTTCGGGCAGGAGTGCACATCAAACTGCCCCTGCTAAGCAAAGATAGC  1110

Query 1018  CGCTTCCCAAAGATCCTGGAGAACCTAAGACTCCAAAAACGTGGTACTGGAGGAGTGGACACTGCTGCTACAGG  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111  CGCTTCCCAAAGATCCTGGAGAACCTAAGACTCCAAAAGCGTGGTACTGGAGGAGTGGACACTGCTGCCACAGG  1184

Query 1092  CGGTGTCTTTGATATTTCTAATTTGGACCGACTAGGCAAATCAGAGGTGGAGCTGGTGCAACTGGTCATCGATG  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGGTGTCTTTGATATTTCTAATTTGGACCGACTAGGCAAATCAGAGGTGGAGCTGGTGCAACTGGTCATCGATG  1258

Query 1166  GAGTAAACTATTTGATTGATTGTGAACGGCGTCTGGAGAGAGGCCAGGATATCCGCATCCCCACACCTGTCATC  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAGTAAACTATTTGATTGATTGTGAACGGCGTCTGGAGAGAGGCCAGGATATCCGCATCCCCACACCTGTCATC  1332

Query 1240  CACACCAAGCAT  1251
            ||||||||||||
Sbjct 1333  CACACCAAGCAT  1344