Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473453
- Subject:
- XM_006510899.4
- Aligned Length:
- 2635
- Identities:
- 1602
- Gaps:
- 866
Alignment
Query 1 ATGTCGGGACGAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTTACAGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC 74
||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCGGGCCAAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTGACTGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC 74
Query 75 GGTCTGCAAAGCCACTACTCATGAAGTAATGGGCCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA 148
.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTCTGCAAAGCCACCACTCATGAGGTGATGGGCCCCAAGAAGAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA 148
Query 149 ACGAGACCAATGTTAATATTCCTCAGATGGCCGACACTCTCTTTGAGCGGGCAACAAACAGTAGCTGGGTGGTT 222
|.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 149 ATGAGACCAATGTCAATATCCCTCAGATGGCCGACACCCTCTTTGAGCGGGCGACAAACAGTAGCTGGGTGGTG 222
Query 223 GTGTTTAAGGCTTTAGTGACAACACATCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAATATTTGGCTTC 296
||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 223 GTATTTAAAGCTTTAGTGACCACACACCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAGTATTTGGCCTC 296
Query 297 TAGAAATACACTATTCAATCTCAGCAATTTTTTGGACAAAAGTGGATCCCATGGTTATGATATGTCTACCTTCA 370
|||.|||||.|||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 297 TAGGAATACGCTATTCAATCTCAGCAACTTTCTAGATAAAAGTGGATCCCACGGTTATGATATGTCTACGTTCA 370
Query 371 TAAGGCGCTATAGTAGATATTTGAATGAAAAGGCTTTTTCTTACAGACAGATGGCCTTTGATTTTGCCAGGGTG 444
||.||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 371 TACGGCGTTACAGTAGATACTTGAATGAAAAGGCTTTCTCCTACAGACAGATGGCATTTGACTTTGCCAGAGTG 444
Query 445 AAGAAAGGGGCCGATGGTGTAATGAGGACAATGGCTCCCGAAAAGCTGCTAAAGAGTATGCCAATACTACAGGG 518
|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||.|||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 445 AAGAAAGGGGCTGACGGTGTCATGAGGACGATGGTTCCTGAAAAGCTCCTGAAGAGTATGCCAATCCTGCAGGG 518
Query 519 ACAAATTGATGCACTGCTTGAATTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACAAATGGTGTCATAAATGCAGCATTTA 592
.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 GCAGATCGATGCACTGCTGGAGTTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACCAATGGTGTCATAAATGCTGCATTTA 592
Query 593 TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTTTTTGCTTGCTACAATGATGGTGTTATTAACTTACTCGAAAAGTTT 666
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 593 TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTGTTTGCTTGCTACAATGACGGCGTCATTAACTTACTTGAAAAATTT 666
Query 667 TTTGAAATGAAGAAAGGACAATGTAAAGATGCTCTAGAAATTTACAAACGATTTCTAACTAGAATGACACGAGT 740
||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|.||
Sbjct 667 TTCGAGATGAAGAAAGGTCAATGCAAAGACGCGCTAGAAATTTACAAGCGATTTCTAACTAGAATGACGAGGGT 740
Query 741 GTCTGAATTTCTCAAGGTTG------------------------------------------CAGAGGCTCCCA 772
|||||||||.||||||||.| ||.|||||||||
Sbjct 741 GTCTGAATTCCTCAAGGTCGCCGAGCAAGTTGGTATTGATAAAGGTGACATTCCCGACCTCACACAGGCTCCCA 814
Query 773 GCAGTCTTATGGAGACGCTTGAACAGCATCTAAATACATTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAA------ATCT 840
||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 815 GCAGTCTTATGGAGACCCTTGAACAACATCTAAATACCCTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAATGAAGGATCT 888
Query 841 GGTGCTCCCTCTCCATTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACGTCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAAC 914
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGTGCTCCCTCTCCACTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACATCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAAC 962
Query 915 TATTGACACATCCCCACCGGTTGATTTATTTGCAACTGCATCTGCGGCTGTCCCAGTCAGCACTTCTAAACCAT 988
|||.|||||||||||.||.|||||..||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||.||.||||.||||
Sbjct 963 TATCGACACATCCCCGCCAGTTGACATATTTGCAACAGCATCCGCGGCTGCCCCAGTCAGCTCTGCTAAGCCAT 1036
Query 989 CTAGTGATCTCCTGGACCTCCAGCCAGACTTTTCCTCTGGA---------GGGGCAGCAGCA------------ 1041
|.||.||||||||.||.||.|||||.||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 1037 CAAGCGATCTCCTTGATCTTCAGCCCGACTT---CTCTGGAGCAGCTGCGGGGGCAGCAGCACCTGTAGTGCCT 1107
Query 1042 ---------------------------------------------------GCCGCA----------------- 1047
||.|||
Sbjct 1108 CCTTCTGGGGGTGCGACCGCCTGGGGAGACCTTTTGGGAGAGGATTCCTTGGCTGCACTTTCCTCTGTTCCCTG 1181
Query 1048 -------------------------GCACCAG------------------------------------------ 1054
|||||||
Sbjct 1182 TGAAGCACCGATTTCAGACCCATTTGCACCAGAGCCTTCCCCTCCTACTACAACCACTGAGCCTGCTTCAGCCT 1255
Query 1055 ----------CACCAC---------------------------------------------------------- 1060
||||||
Sbjct 1256 CTGCCTCGACCACCACAGCTGTGACGGCTGTCACTACGGAAGTGGATCTCTTTGGAGATGCCTTTGCAGCTTCT 1329
Query 1061 -------------------------------------CACCACCT----------------------------- 1068
|||||.||
Sbjct 1330 CCTGGGGAGGCCCCTGCAGCATCCGAAGGGGCTACCGCACCAGCTACCCCGGCCCCAGTGGCTGCAGCTCTTGA 1403
Query 1069 ------------------------------------------------------------GCTGGA-------- 1074
||||||
Sbjct 1404 TGCATGCTCAGGAAATGACCCTTTTGCCCCATCTGAAGGTAGCGCAGAGGCTGCACCTGAGCTGGACCTCTTTG 1477
Query 1075 -------------------------------------------------------------------------- 1074
Sbjct 1478 CAATGAAGCCACCTGAGACCAGCGCTCCTGTAGTTACCCCTACAGCTAGCACAGCCCCTCCAGTTCCCGCAACT 1551
Query 1075 ---------------------------GGAGCCACTGC------------------------------------ 1085
|.|||||||||
Sbjct 1552 GCTCCTTCTCCTGCTCCCACGGCTGTGGCAGCCACTGCTGCCACCACCACCGCCGCCGCTGCAGCTACCACCAC 1625
Query 1086 -------------------------------------------------------------------------- 1085
Sbjct 1626 TGCCACCACCTCTGCTGCTGCTGCCACCACCGCCGCTGCTCCTCCTGCTCTAGATATCTTTGGTGATTTGTTTG 1699
Query 1086 ---------------------------------------------------------------------ATG-- 1088
|||
Sbjct 1700 ATTCTGCTCCTGAAGTTGCTGCAGCACCTAAGCCAGACGCGGCTCCTAGCATAGACCTGTTTGGCACAGATGCT 1773
Query 1089 -------------------------------------------------------------------------- 1088
Sbjct 1774 TTCTCCTCCCCGCCACGAGGGGCCTCTCCGGTGCCTGAGAGTTCTCTCACTGCTGACCTCTTATCTGTGGACGC 1847
Query 1089 -------------------------------------------------------------------------G 1089
|
Sbjct 1848 ATTTGCAGCGCCGTCTCCTGCATCCACTGCCTCTCCTGCAAAGGCGGAGTCCTCGGGTGTCATAGACCTTTTTG 1921
Query 1090 GGAGGATTTGGGGGTTCTTTCATGGCGCCTTCCCCATCTCCAGTGACTCCAGCTCAGAATAACCTGCTACAGCC 1163
|| |||||||||||||||||||||||.|||||..||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1922 GG-GGATTTGGGGGTTCTTTCATGGCCCCTTCTACAACGCCAGTGACTCCAGCTCAGAATAACCTGCTGCAACC 1994
Query 1164 CAATTTTGAGGCAGCTTTTGGGACAACGCCTTCAACTTCCAGCAGCAGCTCCTTTGATCCATCAGTGTTTGATG 1237
||.|||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1995 CAGTTTCGAGGCAGCTTTTGGAACGACGCCTTCGACTTCAAGCAGCAGCTCTTTTGACCCATCAGTGTTTGATG 2068
Query 1238 GTCTAGGTGATCTTTTGATGCCAACCATGGCACCAGCTGGGCAGCCTGCACCTGTCTCAATGGTACCACCCAGT 1311
||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2069 GTTTAGGCGATCTTCTGATGCCAACCATGGCACCATCCGGGCAGCCTGCCCCTGTCTCAATGGTCCCACCCAGT 2142
Query 1312 CCTGCAATGGCAGCCAGCAAAGCCCTTGGAAGTGATCTTGATTCATCTCTTGCCAGCTTAGTAGGCAATCTTGG 1385
||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2143 CCTGCAATGGCAGCCAGCAAAGGCCTCGGAAGTGACCTTGACTCGTCTCTGGCCAGTTTAGTAGGCAATCTTGG 2216
Query 1386 AATTTCTGGTACCACAACAAAAAAGGGAGATCTTCAGTGGAATGCTGGAGAGAAAAAGTTGACTGGTGGAGCCA 1459
.|||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2217 GATTTCTGGTACCACATCAAAAAAGGGAGATCTCCAGTGGAATGCTGGGGAGAAAAAGCTGACTGGTGGAGCCA 2290
Query 1460 ACTGGCAGCCTAAAGTAGCTCCAGCAACCTGGTCAGCAGGCGTTCCACCAAGTGCACCTTTGCAAGGAGCTGTA 1533
|||||||.||.|||||..|||||||.||.||||||||.||.|||||.|| ||||||..||||.
Sbjct 2291 ACTGGCAACCGAAAGTCACTCCAGCCACATGGTCAGCGGGTGTTCCCCC------------GCAAGGCACTGTT 2352
Query 1534 CCTCCAACCAGTTCAGTTCCTCCTGTTGCCGGGGCCCCATCGGTTGGACAACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCC 1607
||.||||||||.|||||.|||||.|.||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2353 CCACCAACCAGCTCAGTCCCTCCGGGTGCCGGGGCCCCGTCCGTTGGGCAACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCC 2426
Query 1608 TCCTGCTGGGACAGGCATGCCCATGATGCCTCAGCAGCCGGTCATGTTTGCACAGCCCATGATGAGGCCCCCCT 1681
||||.|.||||||||||||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2427 TCCTTCAGGGACAGGCATGACCATGATGTCTCAGCAGCCAGTCATGTTTGCACAGCCCATGATGAGGCCACCCT 2500
Query 1682 TTGGAGCTGCCGCTGTACCTGGCACGCAGCTTTCTCCAAGCCCTACACCTGCCAGTCAGAGTCCCAAGAAACCT 1755
||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2501 TTGGAGCTGCAGCTGTGCCCGGCACACAGCTTTCTCCAAGCCCTACACCTGCCACTCAGAGTCCCAAGAAACCT 2574
Query 1756 CCAGCAAAGGACCCATTAGCGGATCTTAAC--------------- 1785
|||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2575 CCAGCCAAGGACCCGTTAGCGGATCTTAACATCAAGGATTTCTTG 2619