Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473453
- Subject:
- XM_030244156.1
- Aligned Length:
- 2697
- Identities:
- 1602
- Gaps:
- 927
Alignment
Query 1 ATGTCGGGACGAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTTACAGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC 74
||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCGGGCCAAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTGACTGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC 74
Query 75 GGTCTGCAAAGCCACTACTCATGAAGTAATGGGCCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA 148
.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTCTGCAAAGCCACCACTCATGAGGTGATGGGCCCCAAGAAGAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA 148
Query 149 ACGAGACCAATGTTAATATTCCTCAGATGGCCGACACTCTCTTTGAGCGGGCAACAAACAGTAGCTGGGTGGTT 222
|.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 149 ATGAGACCAATGTCAATATCCCTCAGATGGCCGACACCCTCTTTGAGCGGGCGACAAACAGTAGCTGGGTGGTG 222
Query 223 GTGTTTAAGGCTTTAGTGACAACACATCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAATATTTGGCTTC 296
||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 223 GTATTTAAAGCTTTAGTGACCACACACCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAGTATTTGGCCTC 296
Query 297 TAGAAATACACTATTCAATCTCAGCAATTTTTTGGACAAAAGTGGATCCCATGGTTATGATATGTCTACCTTCA 370
|||.|||||.|||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 297 TAGGAATACGCTATTCAATCTCAGCAACTTTCTAGATAAAAGTGGATCCCACGGTTATGATATGTCTACGTTCA 370
Query 371 TAAGGCGCTATAGTAGATATTTGAATGAAAAGGCTTTTTCTTACAGACAGATGGCCTTTGATTTTGCCAGGGTG 444
||.||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 371 TACGGCGTTACAGTAGATACTTGAATGAAAAGGCTTTCTCCTACAGACAGATGGCATTTGACTTTGCCAGAGTG 444
Query 445 AAGAAAGGGGCCGATGGTGTAATGAGGACAATGGCTCCCGAAAAGCTGCTAAAGAGTATGCCAATACTACAGGG 518
|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||.|||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 445 AAGAAAGGGGCTGACGGTGTCATGAGGACGATGGTTCCTGAAAAGCTCCTGAAGAGTATGCCAATCCTGCAGGG 518
Query 519 ACAAATTGATGCACTGCTTGAATTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACAAATGGTGTCATAAATGCAGCATTTA 592
.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 GCAGATCGATGCACTGCTGGAGTTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACCAATGGTGTCATAAATGCTGCATTTA 592
Query 593 TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTTTTTGCTTGCTACAATGATGGTGTTATTAACTTACTCGAAAAGTTT 666
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 593 TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTGTTTGCTTGCTACAATGACGGCGTCATTAACTTACTTGAAAAATTT 666
Query 667 TTTGAAATGAAGAAAGGACAATGTAAAGATGCTCTAGAAATTTACAAACGATTTCTAACTAGAATGACACGAGT 740
||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|.||
Sbjct 667 TTCGAGATGAAGAAAGGTCAATGCAAAGACGCGCTAGAAATTTACAAGCGATTTCTAACTAGAATGACGAGGGT 740
Query 741 GTCTGAATTTCTCAAGGTTG------------------------------------------CAGAGGCTCCCA 772
|||||||||.||||||||.| ||.|||||||||
Sbjct 741 GTCTGAATTCCTCAAGGTCGCCGAGCAAGTTGGTATTGATAAAGGTGACATTCCCGACCTCACACAGGCTCCCA 814
Query 773 GCAGTCTTATGGAGACGCTTGAACAGCATCTAAATACATTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAAATCTGGTGCT 846
||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCAGTCTTATGGAGACCCTTGAACAACATCTAAATACCCTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAAATCTGGTGCT 888
Query 847 CCCTCTCCATTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACGTCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAACTATTGA 920
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 889 CCCTCTCCACTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACATCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAACTATCGA 962
Query 921 CACATCCCCACCGGTTGATTTATTTGCAACTGCATCTGCGGCTGTCCCAGTCAGCACTTCTAAACCATCTAGTG 994
|||||||||.||.|||||..||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||.||.||||.|||||.||.|
Sbjct 963 CACATCCCCGCCAGTTGACATATTTGCAACAGCATCCGCGGCTGCCCCAGTCAGCTCTGCTAAGCCATCAAGCG 1036
Query 995 ATCTCCTGGACCTCCAGCCAGACTTTTCCTCTGGA---------GGGGCAGCAGCA------------------ 1041
|||||||.||.||.|||||.||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 1037 ATCTCCTTGATCTTCAGCCCGACTT---CTCTGGAGCAGCTGCGGGGGCAGCAGCACCTGTAGTGCCTCCTTCT 1107
Query 1042 ------------------------------GCCGCA-------------------------------------- 1047
||.|||
Sbjct 1108 GGGGGTGCGACCGCCTGGGGAGATTCCTTGGCTGCACTTTCCTCTGTTCCCTGTGAAGCACCGATTTCAGACCC 1181
Query 1048 ----GCACCAG----------------------------------------------------CACCAC----- 1060
||||||| ||||||
Sbjct 1182 ATTTGCACCAGAGCCTTCCCCTCCTACTACAACCACTGAGCCTGCTTCAGCCTCTGCCTCGACCACCACAGCTG 1255
Query 1061 -------------------------------------------------------------------------- 1060
Sbjct 1256 TGACGGCTGTCACTACGGAAGTGGATCTCTTTGGAGATGCCTTTGCAGCTTCTCCTGGGGAGGCCCCTGCAGCA 1329
Query 1061 ----------------CACCACCT-------------------------------------------------- 1068
|||||.||
Sbjct 1330 TCCGAAGGGGCTACCGCACCAGCTACCCCGGCCCCAGTGGCTGCAGCTCTTGATGCATGCTCAGGAAATGACCC 1403
Query 1069 ---------------------------------------GCTGGA----------------------------- 1074
||||||
Sbjct 1404 TTTTGCCCCATCTGAAGGTAGCGCAGAGGCTGCACCTGAGCTGGACCTCTTTGCAATGAAGCCACCTGAGACCA 1477
Query 1075 -------------------------------------------------------------------------- 1074
Sbjct 1478 GCGCTCCTGTAGTTACCCCTACAGCTAGCACAGCCCCTCCAGTTCCCGCAACTGCTCCTTCTCCTGCTCCCACG 1551
Query 1075 ------GGAGCCACTGC--------------------------------------------------------- 1085
|.|||||||||
Sbjct 1552 GCTGTGGCAGCCACTGCTGCCACCACCACCGCCGCCGCTGCAGCTACCACCACTGCCACCACCTCTGCTGCTGC 1625
Query 1086 -------------------------------------------------------------------------- 1085
Sbjct 1626 TGCCACCACCGCCGCTGCTCCTCCTGCTCTAGATATCTTTGGTGATTTGTTTGATTCTGCTCCTGAAGTTGCTG 1699
Query 1086 -------------------------------------------------------------------------- 1085
Sbjct 1700 CAGCACCTAAGCCAGACGCGGCTCCTAGCATAGACCTGTTTGGCACAGATGCTTTCTCCTCCCCGCCACGAGGG 1773
Query 1086 -------------------------------------------------------------------------- 1085
Sbjct 1774 GCCTCTCCGGTGCCTGAGAGTTCTCTCACTGCTGACCTCTTATCTGTGGACGCATTTGCAGCGCCGTCTCCTGC 1847
Query 1086 --------------------------------------------------ATGGGGA----------------- 1092
.||||||
Sbjct 1848 ATCCACTGCCTCTCCTGCAAAGGCGGAGTCCTCGGGTGTCATAGACCTTTTTGGGGATGCGTTTGGAAGTGGTG 1921
Query 1093 -----------------------------------------------------------------GGATTTGGG 1101
|||||||||
Sbjct 1922 CTTCTGAAACCCAGCCAGCACCACAGGCTGTTTCTAGTTCATCAGCATCGGCAGATCTACTAGCTGGATTTGGG 1995
Query 1102 GGTTCTTTCATGGCGCCTTCCCCATCTCCAGTGACTCCAGCTCAGAATAACCTGCTACAGCCCAATTTTGAGGC 1175
||||||||||||||.|||||..||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.|||||
Sbjct 1996 GGTTCTTTCATGGCCCCTTCTACAACGCCAGTGACTCCAGCTCAGAATAACCTGCTGCAACCCAGTTTCGAGGC 2069
Query 1176 AGCTTTTGGGACAACGCCTTCAACTTCCAGCAGCAGCTCCTTTGATCCATCAGTGTTTGATGGTCTAGGTGATC 1249
|||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct 2070 AGCTTTTGGAACGACGCCTTCGACTTCAAGCAGCAGCTCTTTTGACCCATCAGTGTTTGATGGTTTAGGCGATC 2143
Query 1250 TTTTGATGCCAACCATGGCACCAGCTGGGCAGCCTGCACCTGTCTCAATGGTACCACCCAGTCCTGCAATGGCA 1323
||.||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2144 TTCTGATGCCAACCATGGCACCATCCGGGCAGCCTGCCCCTGTCTCAATGGTCCCACCCAGTCCTGCAATGGCA 2217
Query 1324 GCCAGCAAAGCCCTTGGAAGTGATCTTGATTCATCTCTTGCCAGCTTAGTAGGCAATCTTGGAATTTCTGGTAC 1397
||||||||||.|||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2218 GCCAGCAAAGGCCTCGGAAGTGACCTTGACTCGTCTCTGGCCAGTTTAGTAGGCAATCTTGGGATTTCTGGTAC 2291
Query 1398 CACAACAAAAAAGGGAGATCTTCAGTGGAATGCTGGAGAGAAAAAGTTGACTGGTGGAGCCAACTGGCAGCCTA 1471
||||.||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 2292 CACATCAAAAAAGGGAGATCTCCAGTGGAATGCTGGGGAGAAAAAGCTGACTGGTGGAGCCAACTGGCAACCGA 2365
Query 1472 AAGTAGCTCCAGCAACCTGGTCAGCAGGCGTTCCACCAAGTGCACCTTTGCAAGGAGCTGTACCTCCAACCAGT 1545
||||..|||||||.||.||||||||.||.|||||.|| ||||||..||||.||.||||||||.
Sbjct 2366 AAGTCACTCCAGCCACATGGTCAGCGGGTGTTCCCCC------------GCAAGGCACTGTTCCACCAACCAGC 2427
Query 1546 TCAGTTCCTCCTGTTGCCGGGGCCCCATCGGTTGGACAACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCCTCCTGCTGGGAC 1619
|||||.|||||.|.||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 2428 TCAGTCCCTCCGGGTGCCGGGGCCCCGTCCGTTGGGCAACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCCTCCTTCAGGGAC 2501
Query 1620 AGGCATGCCCATGATGCCTCAGCAGCCGGTCATGTTTGCACAGCCCATGATGAGGCCCCCCTTTGGAGCTGCCG 1693
|||||||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 2502 AGGCATGACCATGATGTCTCAGCAGCCAGTCATGTTTGCACAGCCCATGATGAGGCCACCCTTTGGAGCTGCAG 2575
Query 1694 CTGTACCTGGCACGCAGCTTTCTCCAAGCCCTACACCTGCCAGTCAGAGTCCCAAGAAACCTCCAGCAAAGGAC 1767
||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2576 CTGTGCCCGGCACACAGCTTTCTCCAAGCCCTACACCTGCCACTCAGAGTCCCAAGAAACCTCCAGCCAAGGAC 2649
Query 1768 CCATTAGCGGATCTTAAC--------------- 1785
||.|||||||||||||||
Sbjct 2650 CCGTTAGCGGATCTTAACATCAAGGATTTCTTG 2682