Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473459
• Subject: XM_011529034.3
• Aligned Length: 688
• Identities: 551
• Gaps: 131

Alignment

Query   1  ATGGACTCCGCCGGCCAAGATATCAACCTGAATTCTCCTAACAAAGGTCTGCTGTCTGACTCCATGACGGATGT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGACTCCGCCGGCCAAGATATCAACCTGAATTCTCCTAACAAAGGTCTGCTGTCTGACTCCATGACGGATGT  74

Query  75  TCCTGTCGACACAGGTGTGGCTGCCCGGACTCCTGCTGTTGAGGGTCTGACAGAGGCTGAGGAGGAGGAGCTCA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TCCTGTCGACACAGGTGTGGCTGCCCGGACTCCTGCTGTTGAGGGTCTGACAGAGGCTGAGGAGGAGGAGCTCA  148

Query 149  GGGCTGAGCTTACCAAGGTGGAAGAGGAAATTGTCACTCTGCGCCAGGTCCTGGCAGCCAAGGAGAGGCACTGT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GGGCTGAGCTTACCAAGGTGGAAGAGGAAATTGTCACTCTGCGCCAGGTCCTGGCAGCCAAGGAGAGGCACTGT  222

Query 223  GGAGAGCTCAAGAGGAGGCTGGGCCTCTCCACCCTGGGGGAGCTGAAACAGAACCTGTCCAGGAGCTGGCATGA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GGAGAGCTCAAGAGGAGGCTGGGCCTCTCCACCCTGGGGGAGCTGAAACAGAACCTGTCCAGGAGCTGGCATGA  296

Query 297  CGTGCAGGTCTCTAGCGCCTATGTGAAAACTTCTGAGAAACTTGGAGAGTGGAATGAGAAAGTGACCCAGTCAG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CGTGCAGGTCTCTAGCGCCTATGTGAAAACTTCTGAGAAACTTGGAGAGTGGAATGAGAAAGTGACCCAGTCAG  370

Query 371  ACCTCTACAAGAAGACTCAGGAAACTCTTTCACAGGCAGGACAGAAGACTTCAGCTGCCCTGTCCACAGTGGGC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ACCTCTACAAGAAGACTCAGGAAACTCTTTCACAGGCAGGACAGAAGACTTCAGCTGCCCTGTCCACAGTGGGC  444

Query 445  TCTGCCATCAGCAGGAAGCTTGGAGA------------------------------------------------  470
           ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct 445  TCTGCCATCAGCAGGAAGCTTGGAGACATGAGGGCTCATCCATTTTCACACTCCTTTAGCAGCTACTCCATCCG  518

Query 471  ---------------------CATGAGGAACTCTGCGACCTTCAAGTCGTTTGAGGACCGAGTTGGGACCATAA  523
                                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CCACTCAATAAGTATGCCAGCCATGAGGAACTCTGCGACCTTCAAGTCGTTTGAGGACCGAGTTGGGACCATAA  592

Query 524  AG-TCTAAGGTTGTGGGTGACAGAGAGAACGGCAGTGACAACCTCCCTTCCTCAGCGGGGAGTGGTGACAAGCC  596
           || |||                       |..|.|||||.||.|  |||         |||        ||   
Sbjct 593  AGTTCT-----------------------CTCCTGTGACGACAT--CTT---------GGA--------AA---  621

Query 597  CCTGTCGGATCCCGCACCTTTC  618
                   ||||.|        
Sbjct 622  --------ATCCTG--------  627