Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473540
• Subject: NM_009316.1
• Aligned Length: 1818
• Identities: 1598
• Gaps: 81

Alignment

Query    1  ATGTCTACAGCCTCTGCCGCCTCCTCCTCCTCCTCGTCTTCGGCCGGTGAGATGATCGAAGCCCCTTCCCAGGT  74
            |||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct    1  ATGTCGACAGCCTCCGCCGCCTCGTCCTCCTCCTCGTCTTCTGCCAGTGAGATGATCGAAGCGCCGTCGCAGGT  74

Query   75  CCTCAACTTTGAAGAGATCGACTACAAGGAGATCGAGGTGGAAGAGGTTGTTGGAAGAGGAGCCTTTGGAGTTG  148
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct   75  CCTGAACTTCGAAGAGATCGACTACAAGGAGATCGAGGTGGAAGAGGTTGTCGGAAGAGGAGCTTTTGGAGTAG  148

Query  149  TTTGCAAAGCTAAGTGGAGAGCAAAAGATGTTGCTATTAAACAAATAGAAAGTGAATCTGAGAGGAAAGCGTTT  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct  149  TTTGCAAAGCTAAGTGGAGAGCAAAAGATGTCGCTATTAAACAGATAGAAAGTGAGTCTGAGAGGAAGGCTTTC  222

Query  223  ATTGTAGAGCTTCGGCAGTTATCCCGTGTGAACCATCCTAATATTGTAAAGCTTTATGGAGCCTGCTTGAATCC  296
            |||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|.||||||||||||.|||||||
Sbjct  223  ATTGTGGAGCTCCGGCAGTTGTCACGTGTGAACCATCCTAACATTGTCAAGTTGTATGGAGCCTGCCTGAATCC  296

Query  297  AGTGTGTCTTGTGATGGAATATGCTGAAGGGGGCTCTTTATATAATGTGCTGCATGGTGCTGAACCATTGCCAT  370
            |||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  AGTATGTCTTGTGATGGAATATGCAGAGGGGGGCTCATTGTATAATGTGCTGCATGGTGCTGAACCATTGCCTT  370

Query  371  ATTATACTGCTGCCCACGCAATGAGTTGGTGTTTACAGTGTTCCCAAGGAGTGGCTTATCTTCACAGCATGCAA  444
            |.||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct  371  ACTACACTGCTGCTCATGCCATGAGCTGGTGTTTACAGTGTTCCCAAGGAGTGGCTTACCTGCACAGCATGCAG  444

Query  445  CCCAAAGCGCTAATTCACAGGGACCTGAAACCACCAAACTTACTGCTGGTTGCAGGGGGGACAGTTCTAAAAAT  518
            |||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCAAAGCGCTGATTCACAGGGACCTCAAGCCTCCAAACTTGCTGCTGGTTGCAGGAGGGACAGTTCTAAAAAT  518

Query  519  TTGTGATTTTGGTACAGCCTGTGACATTCAGACACACATGACCAATAACAAGGGGAGTGCTGCTTGGATGGCAC  592
            .||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  CTGCGATTTTGGTACAGCTTGTGACATCCAAACACACATGACCAATAATAAAGGGAGTGCTGCTTGGATGGCGC  592

Query  593  CTGAAGTTTTTGAAGGTAGTAATTACAGTGAAAAATGTGACGTCTTCAGCTGGGGTATTATTCTTTGGGAAGTG  666
            |||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  593  CTGAAGTATTTGAAGGTAGCAATTACAGTGAAAAGTGTGATGTCTTCAGCTGGGGTATTATCCTCTGGGAAGTG  666

Query  667  ATAACGCGTCGGAAACCCTTTGATGAGATTGGTGGCCCAGCTTTCCGAATCATGTGGGCTGTTCATAATGGTAC  740
            |||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  ATAACACGCCGGAAACCCTTCGATGAGATCGGTGGCCCAGCTTTCAGAATCATGTGGGCTGTTCATAATGGCAC  740

Query  741  TCGACCACCACTGATAAAAAATTTACCTAAGCCCATTGAGAGCCTGATGACTCGTTGTTGGTCTAAAGATCCTT  814
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||.||.||.|
Sbjct  741  TCGACCACCACTGATCAAAAATTTACCTAAGCCCATTGAGAGCTTGATGACACGCTGTTGGTCTAAGGACCCAT  814

Query  815  CCCAGCGCCCTTCAATGGAGGAAATTGTGAAAATAATGACTCACTTGATGCGGTACTTTCCAGGAGCAGATGAG  888
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  815  CTCAGCGCCCTTCAATGGAGGAAATTGTGAAAATAATGACTCACTTGATGCGGTACTTCCCAGGAGCGGATGAG  888

Query  889  CCATTACAGTATCCTTGTCAGTATTCAGATGAAGGACAGAGCAACTCTGCCACCAGTACAGGCTCATTCATGGA  962
            ||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  889  CCGTTACAGTATCCTTGTCAGTACTCTGATGAAGGGCAGAGCAACTCAGCCACCAGCACAGGCTCATTCATGGA  962

Query  963  CATTGCTTCTACAAATACGAGTAACAAAAGTGACACTAATATGGAGCAAGTTCCTGCCACAAATGATACTATTA  1036
            ||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  963  CATTGCTTCTACAAATACCAGTAATAAAAGTGACACAAATATGGAACAGGTTCCTGCCACAAACGACACTATTA  1036

Query 1037  AGCGCTTAGAATCAAAATTGTTGAAAAATCAGGCAAAGCAACAGAGTGAATCTGGACGTTTAAGCTTGGGAGCC  1110
            |.|||||.||.||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||
Sbjct 1037  AACGCTTGGAGTCAAAACTTTTGAAAAACCAGGCAAAGCAACAGAGTGAATCTGGACGCCTGAGCTTGGGAGCC  1110

Query 1111  TCCCGTGGGAGCAGTGTGGAGAGCTTGCCCCCAACCTCTGAGGGCAAGAGGATGAGTGCTGACATGTCTGAAAT  1184
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTCGTGGGAGCAGTGTGGAGAGCTTGCCCCCCACTTCCGAGGGCAAGAGGATGAGTGCTGACATGTCTGAAAT  1184

Query 1185  AGAAGCTAGGATC------------GCC-------------------------------------------GCA  1203
            ||||||.||||||            |||                                           |||
Sbjct 1185  AGAAGCCAGGATCGTGGCGACTGCAGCCTATTCCAAGCCTAAACGGGGCCACCGTAAAACCGCTTCATTTGGCA  1258

Query 1204  AC-----------------------CA---CAGGCAACGGACAGCCAAGACGTAGATCCATCCAAGACTTGACT  1251
            ||                       ||   ||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACATTCTGGATGTCCCTGAGATCGTCATATCAGGTAACGGGCAACCAAGGCGTAGATCCATCCAAGACTTGACT  1332

Query 1252  GTAACTGGAACAGAACCTGGTCAGGTGAGCAGTAGGTCATCCAGTCCCAGTGTCAGAATGATTACTACCTCAGG  1325
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  GTTACTGGGACAGAACCTGGTCAGGTGAGCAGCCGGTCATCCAGCCCTAGTGTCAGAATGATCACTACCTCAGG  1406

Query 1326  ACCAACCTCAGAAAAGCCAACTCGAAGTCATCCATGGACCCCTGATGATTCCACAGATACCAATGGATCAGATA  1399
            ||||||||||||.||||||.||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1407  ACCAACCTCAGAGAAGCCAGCTCGCAGTCACCCGTGGACCCCTGATGATTCCACAGATACCAATGGCTCAGATA  1480

Query 1400  ACTCCATCCCAATGGCTTATCTTACACTGGATCACCAACTACAGCCTCTAGCACCGTGCCCAAACTCCAAAGAA  1473
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACTCCATCCCAATGGCGTATCTTACACTGGATCACCAGCTACAGCCTCTAGCGCCGTGCCCAAACTCCAAAGAA  1554

Query 1474  TCTATGGCAGTGTTTGAACAGCATTGTAAAATGGCACAAGAATATATGAAAGTTCAAACAGAAATTGCATTGTT  1547
            ||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1555  TCCATGGCAGTGTTCGAACAACATTGTAAAATGGCACAGGAGTATATGAAAGTTCAAACCGAAATCGCATTGTT  1628

Query 1548  ATTACAGAGAAAGCAAGAACTAGTTGCAGAACTGGACCAGGATGAAAAGGACCAGCAAAATACATCTCGCCTGG  1621
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1629  ACTACAGAGAAAGCAAGAACTAGTTGCAGAATTGGACCAGGATGAAAAGGACCAGCAAAATACATCTCGTCTGG  1702

Query 1622  TACAGGAACATAAAAAGCTTTTAGATGAAAACAAAAGCCTTTCTACTTACTACCAGCAATGCAAAAAACAACTA  1695
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TACAGGAACATAAAAAGCTTTTAGATGAAAACAAAAGCCTTTCTACTTATTACCAGCAATGCAAAAAACAACTA  1776

Query 1696  GAGGTCATCAGAAGTCAGCAGCAGAAACGACAAGGCACTTCA  1737
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAGGTCATCAGAAGCCAACAGCAGAAACGACAAGGCACTTCA  1818