Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473540
- Subject:
- XM_006715553.3
- Aligned Length:
- 1818
- Identities:
- 1347
- Gaps:
- 471
Alignment
Query 1 ATGTCTACAGCCTCTGCCGCCTCCTCCTCCTCCTCGTCTTCGGCCGGTGAGATGATCGAAGCCCCTTCCCAGGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCTCAACTTTGAAGAGATCGACTACAAGGAGATCGAGGTGGAAGAGGTTGTTGGAAGAGGAGCCTTTGGAGTTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TTTGCAAAGCTAAGTGGAGAGCAAAAGATGTTGCTATTAAACAAATAGAAAGTGAATCTGAGAGGAAAGCGTTT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ATTGTAGAGCTTCGGCAGTTATCCCGTGTGAACCATCCTAATATTGTAAAGCTTTATGGAGCCTGCTTGAATCC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGTGTGTCTTGTGATGGAATATGCTGAAGGGGGCTCTTTATATAATGTGCTGCATGGTGCTGAACCATTGCCAT 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ATTATACTGCTGCCCACGCAATGAGTTGGTGTTTACAGTGTTCCCAAGGAGTGGCTTATCTTCACAGCATGCAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------ATGAGTTGGTGTTTACAGTGTTCCCAAGGAGTGGCTTATCTTCACAGCATGCAA 54
Query 445 CCCAAAGCGCTAATTCACAGGGACCTGAAACCACCAAACTTACTGCTGGTTGCAGGGGGGACAGTTCTAAAAAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 CCCAAAGCGCTAATTCACAGGGACCTGAAACCACCAAACTTACTGCTGGTTGCAGGGGGGACAGTTCTAAAAAT 128
Query 519 TTGTGATTTTGGTACAGCCTGTGACATTCAGACACACATGACCAATAACAAGGGGAGTGCTGCTTGGATGGCAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 129 TTGTGATTTTGGTACAGCCTGTGACATTCAGACACACATGACCAATAACAAGGGGAGTGCTGCTTGGATGGCAC 202
Query 593 CTGAAGTTTTTGAAGGTAGTAATTACAGTGAAAAATGTGACGTCTTCAGCTGGGGTATTATTCTTTGGGAAGTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 203 CTGAAGTTTTTGAAGGTAGTAATTACAGTGAAAAATGTGACGTCTTCAGCTGGGGTATTATTCTTTGGGAAGTG 276
Query 667 ATAACGCGTCGGAAACCCTTTGATGAGATTGGTGGCCCAGCTTTCCGAATCATGTGGGCTGTTCATAATGGTAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 277 ATAACGCGTCGGAAACCCTTTGATGAGATTGGTGGCCCAGCTTTCCGAATCATGTGGGCTGTTCATAATGGTAC 350
Query 741 TCGACCACCACTGATAAAAAATTTACCTAAGCCCATTGAGAGCCTGATGACTCGTTGTTGGTCTAAAGATCCTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 TCGACCACCACTGATAAAAAATTTACCTAAGCCCATTGAGAGCCTGATGACTCGTTGTTGGTCTAAAGATCCTT 424
Query 815 CCCAGCGCCCTTCAATGGAGGAAATTGTGAAAATAATGACTCACTTGATGCGGTACTTTCCAGGAGCAGATGAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 425 CCCAGCGCCCTTCAATGGAGGAAATTGTGAAAATAATGACTCACTTGATGCGGTACTTTCCAGGAGCAGATGAG 498
Query 889 CCATTACAGTATCCTTGTCAGTATTCAGATGAAGGACAGAGCAACTCTGCCACCAGTACAGGCTCATTCATGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 CCATTACAGTATCCTTGTCAGTATTCAGATGAAGGACAGAGCAACTCTGCCACCAGTACAGGCTCATTCATGGA 572
Query 963 CATTGCTTCTACAAATACGAGTAACAAAAGTGACACTAATATGGAGCAAGTTCCTGCCACAAATGATACTATTA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 573 CATTGCTTCTACAAATACGAGTAACAAAAGTGACACTAATATGGAGCAAGTTCCTGCCACAAATGATACTATTA 646
Query 1037 AGCGCTTAGAATCAAAATTGTTGAAAAATCAGGCAAAGCAACAGAGTGAATCTGGACGTTTAAGCTTGGGAGCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 647 AGCGCTTAGAATCAAAATTGTTGAAAAATCAGGCAAAGCAACAGAGTGAATCTGGACGTTTAAGCTTGGGAGCC 720
Query 1111 TCCCGTGGGAGCAGTGTGGAGAGCTTGCCCCCAACCTCTGAGGGCAAGAGGATGAGTGCTGACATGTCTGAAAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TCCCGTGGGAGCAGTGTGGAGAGCTTGCCCCCAACCTCTGAGGGCAAGAGGATGAGTGCTGACATGTCTGAAAT 794
Query 1185 AGAAGCTAGGATCGCCGCAACCA--------------------------------------------------- 1207
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 795 AGAAGCTAGGATCGCCGCAACCACAGCCTATTCCAAGCCTAAACGGGGCCACCGTAAAACTGCTTCATTTGGCA 868
Query 1208 ------------------------------CAGGCAACGGACAGCCAAGACGTAGATCCATCCAAGACTTGACT 1251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 869 ACATTCTGGATGTCCCTGAGATCGTCATATCAGGCAACGGACAGCCAAGACGTAGATCCATCCAAGACTTGACT 942
Query 1252 GTAACTGGAACAGAACCTGGTCAGGTGAGCAGTAGGTCATCCAGTCCCAGTGTCAGAATGATTACTACCTCAGG 1325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 943 GTAACTGGAACAGAACCTGGTCAGGTGAGCAGTAGGTCATCCAGTCCCAGTGTCAGAATGATTACTACCTCAGG 1016
Query 1326 ACCAACCTCAGAAAAGCCAACTCGAAGTCATCCATGGACCCCTGATGATTCCACAGATACCAATGGATCAGATA 1399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 ACCAACCTCAGAAAAGCCAACTCGAAGTCATCCATGGACCCCTGATGATTCCACAGATACCAATGGATCAGATA 1090
Query 1400 ACTCCATCCCAATGGCTTATCTTACACTGGATCACCAACTACAGCCTCTAGCACCGTGCCCAAACTCCAAAGAA 1473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091 ACTCCATCCCAATGGCTTATCTTACACTGGATCACCAACTACAGCCTCTAGCACCGTGCCCAAACTCCAAAGAA 1164
Query 1474 TCTATGGCAGTGTTTGAACAGCATTGTAAAATGGCACAAGAATATATGAAAGTTCAAACAGAAATTGCATTGTT 1547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1165 TCTATGGCAGTGTTTGAACAGCATTGTAAAATGGCACAAGAATATATGAAAGTTCAAACAGAAATTGCATTGTT 1238
Query 1548 ATTACAGAGAAAGCAAGAACTAGTTGCAGAACTGGACCAGGATGAAAAGGACCAGCAAAATACATCTCGCCTGG 1621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1239 ATTACAGAGAAAGCAAGAACTAGTTGCAGAACTGGACCAGGATGAAAAGGACCAGCAAAATACATCTCGCCTGG 1312
Query 1622 TACAGGAACATAAAAAGCTTTTAGATGAAAACAAAAGCCTTTCTACTTACTACCAGCAATGCAAAAAACAACTA 1695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 TACAGGAACATAAAAAGCTTTTAGATGAAAACAAAAGCCTTTCTACTTACTACCAGCAATGCAAAAAACAACTA 1386
Query 1696 GAGGTCATCAGAAGTCAGCAGCAGAAACGACAAGGCACTTCA 1737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1387 GAGGTCATCAGAAGTCAGCAGCAGAAACGACAAGGCACTTCA 1428
