Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473640
• Subject: NM_001300985.2
• Aligned Length: 1611
• Identities: 1595
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ATGGACGGAATCGTCACTGAGGTTGCAGTTGGCGTGAAGAGAGGATCTGACGAACTACTCTCAGGCAGTGTTCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGGAATCGTCACTGAGGTTGCAGTTGGCGTGAAGAGAGGATCTGACGAACTACTCTCAGGCAGTGTTCT  74

Query   75  CAGTAGTCCGAACTCTAATATGAGCAGCATGGTAGTTACAGCCAATGGTAATGATAGTAAAAAATTTAAAGGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGTAGTCCGAACTCTAATATGAGCAGCATGGTAGTTACAGCCAATGGTAATGATAGTAAAAAATTTAAAGGAG  148

Query  149  AAGATAAAATGGATGGTGCTCCTTCTCGTGTACTTCATATTCGAAAATTACCTGGGGAAGTAACAGAAACTGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGATAAAATGGATGGTGCTCCTTCTCGTGTACTTCATATTCGAAAATTACCTGGGGAAGTAACAGAAACTGAA  222

Query  223  GTTATTGCTTTAGGCTTACCTTTTGGTAAGGTGACCAACATCCTTATGCTGAAAGGAAAAAATCAGGCATTTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTTATTGCTTTAGGCTTACCTTTTGGTAAGGTGACCAACATCCTTATGCTGAAAGGAAAAAATCAGGCATTTTT  296

Query  297  GGAACTAGCAACCGAGGAAGCAGCTATTACTATGGTTAATTACTATTCTGCTGTGACACCTCATCTTCGTAACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAACTAGCAACCGAGGAAGCAGCTATTACTATGGTTAATTACTATTCTGCTGTGACACCTCATCTTCGTAACC  370

Query  371  AACCAATATATATCCAGTACTCGAATCACAAAGAACTAAAGACAGATAATACATTAAACCAACGTGCTCAGGCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AACCAATATATATCCAGTACTCGAATCACAAAGAACTAAAGACAGATAATACATTAAACCAACGTGCTCAGGCA  444

Query  445  GTTCTTCAAGCTGTGACAGCTGTCCAGACAGCAAATACTCCTCTTAGTGGCACCACAGTTAGCGAGAGTGCAGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTCTTCAAGCTGTGACAGCTGTCCAGACAGCAAATACTCCTCTTAGTGGCACCACAGTTAGCGAGAGTGCAGT  518

Query  519  GACTCCAGCCCAGAGTCCAGTACTTAGAATAATTATTGACAACATGTACTACCCTGTAACACTTGATGTTCTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACTCCAGCCCAGAGTCCAGTACTTAGAATAATTATTGACAACATGTACTACCCTGTAACACTTGATGTTCTTC  592

Query  593  ACCAAATATTTTCTAAGTTTGGTGCTGTATTGAAGATAATCACATTTACAAAAAATAACCAGTTTCAAGCTTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCAAATATTTTCTAAGTTTGGTGCTGTATTGAAGATAATCACATTTACAAAAAATAACCAGTTTCAAGCTTTG  666

Query  667  CTCCAGTATGGTGATCCAGTAAATGCTCAACAAGCAAAACTAGCCCTAGATGGTCAGAATATTTATAATGCCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCCAGTATGGTGATCCAGTAAATGCTCAACAAGCAAAACTAGCCCTAGATGGTCAGAATATTTATAATGCCTG  740

Query  741  CTGTACCCTAAGGATTGATTTTTCCAAACTTGTGAATTTGAATGTAAAATACAACAATGATAAAAGTAGGGATT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGTACCCTAAGGATTGATTTTTCCAAACTTGTGAATTTGAATGTAAAATACAACAATGATAAAAGTAGGGATT  814

Query  815  ATACTCGACCTGATCTTCCATCTGGGGATGGACAACCTGCATTGGACCCAGCTATTGCTGCAGCATTTGCCAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATACTCGACCTGATCTTCCATCTGGGGATGGACAACCTGCATTGGACCCAGCTATTGCTGCAGCATTTGCCAAG  888

Query  889  GAGACATCCCTCTT---------------AGCTGTTCCAGGAGCTCTGAGTCCTTTGGCCATTCCAAATGCTGC  947
            ||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGACATCCCTCTTAGGGCTTCCTGTTGCAGCTGTTCCAGGAGCTCTGAGTCCTTTGGCCATTCCAAATGCTGC  962

Query  948  TGCAGCAGCTGCTGCAGCTGCTGCTGGCCGAGTGGGTATGCCTGGAGTCTCAGCTGGTGGCAATACAGTCCTGT  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGCAGCAGCTGCTGCAGCTGCTGCTGGCCGAGTGGGTATGCCTGGAGTCTCAGCTGGTGGCAATACAGTCCTGT  1036

Query 1022  TGGTTAGCAATTTAAATGAAGAGATGGTTACGCCCCAAAGTCTGTTTACCCTCTTCGGTGTTTATGGAGATGTG  1095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGTTAGCAATTTAAATGAAGAGATGGTTACGCCCCAAAGTCTGTTTACCCTCTTCGGTGTTTATGGAGATGTG  1110

Query 1096  CAGCGTGTGAAGATTTTATACAATAAGAAAGACAGCGCTCTAATACAGATGGCTGATGGAAACCAATCACAACT  1169
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGCGTGTGAAGATTTTATACAATAAGAAAGACAGCGCTCTAATACAGATGGCTGATGGAAACCAATCACAACT  1184

Query 1170  TGCCATGAATCATCTTAATGGACAGAAAATGTATGGAAAAATTATTCGTGTTACTCTGTCTAAACATCAGACTG  1243
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCATGAATCATCTTAATGGACAGAAAATGTATGGAAAAATTATTCGTGTTACTCTGTCTAAACATCAGACTG  1258

Query 1244  TACAGCTACCTCGAGAGGGACTTGATGATCAAGGGCTAACAAAAGATTTTGGTAATTCCCCATTGCATCGTTTT  1317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TACAGCTACCTCGAGAGGGACTTGATGATCAAGGGCTAACAAAAGATTTTGGTAATTCCCCATTGCATCGTTTT  1332

Query 1318  AAGAAACCTGGATCCAAAAATTTTCAAAACATTTTTCCTCCTTCTGCCACCCTTCACCTATCTAATATCCCTCC  1391
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGAAACCTGGATCCAAAAATTTTCAAAACATTTTTCCTCCTTCTGCCACCCTTCACCTATCTAATATCCCTCC  1406

Query 1392  ATCAGTAGCAGAAGAGGATCTACGAACACTGTTCGCTAACACTGGGGGCACTGTGAAAGCATTTAAGTTTTTTC  1465
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ATCAGTAGCAGAAGAGGATCTACGAACACTGTTCGCTAACACTGGGGGCACTGTGAAAGCATTTAAGTTTTTTC  1480

Query 1466  AAAGAGATCACAAAATGGCTCTTCTTCAGATGGCAACAGTGGAAGAAGCTATTCAGGCCTTGATTGATCTTCAT  1539
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAAGAGATCACAAAATGGCTCTTCTTCAGATGGCAACAGTGGAAGAAGCTATTCAGGCCTTGATTGATCTTCAT  1554

Query 1540  AATTATAACCTTGGAGAAAACCATCATCTGAGAGTGTCTTTCTCAAAGTCAACAATT  1596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1555  AATTATAACCTTGGAGAAAACCATCATCTGAGAGTGTCTTTCTCCAAGTCAACAATT  1611