Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473640
• Subject: NM_001300987.2
• Aligned Length: 1650
• Identities: 1582
• Gaps: 60

Alignment

Query    1  ATGGACGGAATCGTCAC-TGAGGTTGCAG-----TTGGCGTG--------------------------------  36
            |||  .|||   ||.|| |||..|| |||     ||||..||                                
Sbjct    1  ATG--TGGA---GTAACTTGACCTT-CAGTTTTTTTGGTCTGAGAACAAAGGCCAAAAAATATGTAACAGTTAA  68

Query   37  -AAGAGAGGATCTGACGAACTACTCTCAGGCAGTGTTCTCAGTAGTCCGAACTCTAATATGAGCAGCATGGTAG  109
             ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   69  TAACAGAGGATCTGACGAACTACTCTCAGGCAGTGTTCTCAGTAGTCCGAACTCTAATATGAGCAGCATGGTAG  142

Query  110  TTACAGCCAATGGTAATGATAGTAAAAAATTTAAAGGAGAAGATAAAATGGATGGTGCTCCTTCTCGTGTACTT  183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  143  TTACAGCCAATGGTAATGATAGTAAAAAATTTAAAGGAGAAGATAAAATGGATGGTGCTCCTTCTCGTGTACTT  216

Query  184  CATATTCGAAAATTACCTGGGGAAGTAACAGAAACTGAAGTTATTGCTTTAGGCTTACCTTTTGGTAAGGTGAC  257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  217  CATATTCGAAAATTACCTGGGGAAGTAACAGAAACTGAAGTTATTGCTTTAGGCTTACCTTTTGGTAAGGTGAC  290

Query  258  CAACATCCTTATGCTGAAAGGAAAAAATCAGGCATTTTTGGAACTAGCAACCGAGGAAGCAGCTATTACTATGG  331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  291  CAACATCCTTATGCTGAAAGGAAAAAATCAGGCATTTTTGGAACTAGCAACCGAGGAAGCAGCTATTACTATGG  364

Query  332  TTAATTACTATTCTGCTGTGACACCTCATCTTCGTAACCAACCAATATATATCCAGTACTCGAATCACAAAGAA  405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  365  TTAATTACTATTCTGCTGTGACACCTCATCTTCGTAACCAACCAATATATATCCAGTACTCGAATCACAAAGAA  438

Query  406  CTAAAGACAGATAATACATTAAACCAACGTGCTCAGGCAGTTCTTCAAGCTGTGACAGCTGTCCAGACAGCAAA  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  CTAAAGACAGATAATACATTAAACCAACGTGCTCAGGCAGTTCTTCAAGCTGTGACAGCTGTCCAGACAGCAAA  512

Query  480  TACTCCTCTTAGTGGCACCACAGTTAGCGAGAGTGCAGTGACTCCAGCCCAGAGTCCAGTACTTAGAATAATTA  553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  513  TACTCCTCTTAGTGGCACCACAGTTAGCGAGAGTGCAGTGACTCCAGCCCAGAGTCCAGTACTTAGAATAATTA  586

Query  554  TTGACAACATGTACTACCCTGTAACACTTGATGTTCTTCACCAAATATTTTCTAAGTTTGGTGCTGTATTGAAG  627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  TTGACAACATGTACTACCCTGTAACACTTGATGTTCTTCACCAAATATTTTCTAAGTTTGGTGCTGTATTGAAG  660

Query  628  ATAATCACATTTACAAAAAATAACCAGTTTCAAGCTTTGCTCCAGTATGGTGATCCAGTAAATGCTCAACAAGC  701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  ATAATCACATTTACAAAAAATAACCAGTTTCAAGCTTTGCTCCAGTATGGTGATCCAGTAAATGCTCAACAAGC  734

Query  702  AAAACTAGCCCTAGATGGTCAGAATATTTATAATGCCTGCTGTACCCTAAGGATTGATTTTTCCAAACTTGTGA  775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  735  AAAACTAGCCCTAGATGGTCAGAATATTTATAATGCCTGCTGTACCCTAAGGATTGATTTTTCCAAACTTGTGA  808

Query  776  ATTTGAATGTAAAATACAACAATGATAAAAGTAGGGATTATACTCGACCTGATCTTCCATCTGGGGATGGACAA  849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  ATTTGAATGTAAAATACAACAATGATAAAAGTAGGGATTATACTCGACCTGATCTTCCATCTGGGGATGGACAA  882

Query  850  CCTGCATTGGACCCAGCTATTGCTGCAGCATTTGCCAAGGAGACATCCCTCTT---------------AGCTGT  908
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||
Sbjct  883  CCTGCATTGGACCCAGCTATTGCTGCAGCATTTGCCAAGGAGACATCCCTCTTAGGGCTTCCTGTTGCAGCTGT  956

Query  909  TCCAGGAGCTCTGAGTCCTTTGGCCATTCCAAATGCTGCTGCAGCAGCTGCTGCAGCTGCTGCTGGCCGAGTGG  982
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  TCCAGGAGCTCTGAGTCCTTTGGCCATTCCAAATGCTGCTGCAGCAGCTGCTGCAGCTGCTGCTGGCCGAGTGG  1030

Query  983  GTATGCCTGGAGTCTCAGCTGGTGGCAATACAGTCCTGTTGGTTAGCAATTTAAATGAAGAGATGGTTACGCCC  1056
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  GTATGCCTGGAGTCTCAGCTGGTGGCAATACAGTCCTGTTGGTTAGCAATTTAAATGAAGAGATGGTTACGCCC  1104

Query 1057  CAAAGTCTGTTTACCCTCTTCGGTGTTTATGGAGATGTGCAGCGTGTGAAGATTTTATACAATAAGAAAGACAG  1130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105  CAAAGTCTGTTTACCCTCTTCGGTGTTTATGGAGATGTGCAGCGTGTGAAGATTTTATACAATAAGAAAGACAG  1178

Query 1131  CGCTCTAATACAGATGGCTGATGGAAACCAATCACAACTTGCCATGAATCATCTTAATGGACAGAAAATGTATG  1204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179  CGCTCTAATACAGATGGCTGATGGAAACCAATCACAACTTGCCATGAATCATCTTAATGGACAGAAAATGTATG  1252

Query 1205  GAAAAATTATTCGTGTTACTCTGTCTAAACATCAGACTGTACAGCTACCTCGAGAGGGACTTGATGATCAAGGG  1278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253  GAAAAATTATTCGTGTTACTCTGTCTAAACATCAGACTGTACAGCTACCTCGAGAGGGACTTGATGATCAAGGG  1326

Query 1279  CTAACAAAAGATTTTGGTAATTCCCCATTGCATCGTTTTAAGAAACCTGGATCCAAAAATTTTCAAAACATTTT  1352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327  CTAACAAAAGATTTTGGTAATTCCCCATTGCATCGTTTTAAGAAACCTGGATCCAAAAATTTTCAAAACATTTT  1400

Query 1353  TCCTCCTTCTGCCACCCTTCACCTATCTAATATCCCTCCATCAGTAGCAGAAGAGGATCTACGAACACTGTTCG  1426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401  TCCTCCTTCTGCCACCCTTCACCTATCTAATATCCCTCCATCAGTAGCAGAAGAGGATCTACGAACACTGTTCG  1474

Query 1427  CTAACACTGGGGGCACTGTGAAAGCATTTAAGTTTTTTCAAAGAGATCACAAAATGGCTCTTCTTCAGATGGCA  1500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1475  CTAACACTGGGGGCACTGTGAAAGCATTTAAGTTTTTTCAAAGAGATCACAAAATGGCTCTTCTTCAGATGGCA  1548

Query 1501  ACAGTGGAAGAAGCTATTCAGGCCTTGATTGATCTTCATAATTATAACCTTGGAGAAAACCATCATCTGAGAGT  1574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549  ACAGTGGAAGAAGCTATTCAGGCCTTGATTGATCTTCATAATTATAACCTTGGAGAAAACCATCATCTGAGAGT  1622

Query 1575  GTCTTTCTCAAAGTCAACAATT  1596
            |||||||||.||||||||||||
Sbjct 1623  GTCTTTCTCCAAGTCAACAATT  1644