Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473640
• Subject: NM_001300990.2
• Aligned Length: 1596
• Identities: 1439
• Gaps: 156

Alignment

Query    1  ATGGACGGAATCGTCACTGAGGTTGCAGTTGGCGTGAAGAGAGGATCTGACGAACTACTCTCAGGCAGTGTTCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAGTAGTCCGAACTCTAATATGAGCAGCATGGTAGTTACAGCCAATGGTAATGATAGTAAAAAATTTAAAGGAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AAGATAAAATGGATGGTGCTCCTTCTCGTGTACTTCATATTCGAAAATTACCTGGGGAAGTAACAGAAACTGAA  222
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------ATGGATGGTGCTCCTTCTCGTGTACTTCATATTCGAAAATTACCTGGGGAAGTAACAGAAACTGAA  66

Query  223  GTTATTGCTTTAGGCTTACCTTTTGGTAAGGTGACCAACATCCTTATGCTGAAAGGAAAAAATCAGGCATTTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   67  GTTATTGCTTTAGGCTTACCTTTTGGTAAGGTGACCAACATCCTTATGCTGAAAGGAAAAAATCAGGCATTTTT  140

Query  297  GGAACTAGCAACCGAGGAAGCAGCTATTACTATGGTTAATTACTATTCTGCTGTGACACCTCATCTTCGTAACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  141  GGAACTAGCAACCGAGGAAGCAGCTATTACTATGGTTAATTACTATTCTGCTGTGACACCTCATCTTCGTAACC  214

Query  371  AACCAATATATATCCAGTACTCGAATCACAAAGAACTAAAGACAGATAATACATTAAACCAACGTGCTCAGGCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  215  AACCAATATATATCCAGTACTCGAATCACAAAGAACTAAAGACAGATAATACATTAAACCAACGTGCTCAGGCA  288

Query  445  GTTCTTCAAGCTGTGACAGCTGTCCAGACAGCAAATACTCCTCTTAGTGGCACCACAGTTAGCGAGAGTGCAGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  289  GTTCTTCAAGCTGTGACAGCTGTCCAGACAGCAAATACTCCTCTTAGTGGCACCACAGTTAGCGAGAGTGCAGT  362

Query  519  GACTCCAGCCCAGAGTCCAGTACTTAGAATAATTATTGACAACATGTACTACCCTGTAACACTTGATGTTCTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  363  GACTCCAGCCCAGAGTCCAGTACTTAGAATAATTATTGACAACATGTACTACCCTGTAACACTTGATGTTCTTC  436

Query  593  ACCAAATATTTTCTAAGTTTGGTGCTGTATTGAAGATAATCACATTTACAAAAAATAACCAGTTTCAAGCTTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  437  ACCAAATATTTTCTAAGTTTGGTGCTGTATTGAAGATAATCACATTTACAAAAAATAACCAGTTTCAAGCTTTG  510

Query  667  CTCCAGTATGGTGATCCAGTAAATGCTCAACAAGCAAAACTAGCCCTAGATGGTCAGAATATTTATAATGCCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  511  CTCCAGTATGGTGATCCAGTAAATGCTCAACAAGCAAAACTAGCCCTAGATGGTCAGAATATTTATAATGCCTG  584

Query  741  CTGTACCCTAAGGATTGATTTTTCCAAACTTGTGAATTTGAATGTAAAATACAACAATGATAAAAGTAGGGATT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  585  CTGTACCCTAAGGATTGATTTTTCCAAACTTGTGAATTTGAATGTAAAATACAACAATGATAAAAGTAGGGATT  658

Query  815  ATACTCGACCTGATCTTCCATCTGGGGATGGACAACCTGCATTGGACCCAGCTATTGCTGCAGCATTTGCCAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659  ATACTCGACCTGATCTTCCATCTGGGGATGGACAACCTGCATTGGACCCAGCTATTGCTGCAGCATTTGCCAAG  732

Query  889  GAGACATCCCTCTTAGCTGTTCCAGGAGCTCTGAGTCCTTTGGCCATTCCAAATGCTGCTGCAGCAGCTGCTGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  733  GAGACATCCCTCTTAGCTGTTCCAGGAGCTCTGAGTCCTTTGGCCATTCCAAATGCTGCTGCAGCAGCTGCTGC  806

Query  963  AGCTGCTGCTGGCCGAGTGGGTATGCCTGGAGTCTCAGCTGGTGGCAATACAGTCCTGTTGGTTAGCAATTTAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  807  AGCTGCTGCTGGCCGAGTGGGTATGCCTGGAGTCTCAGCTGGTGGCAATACAGTCCTGTTGGTTAGCAATTTAA  880

Query 1037  ATGAAGAGATGGTTACGCCCCAAAGTCTGTTTACCCTCTTCGGTGTTTATGGAGATGTGCAGCGTGTGAAGATT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  881  ATGAAGAGATGGTTACGCCCCAAAGTCTGTTTACCCTCTTCGGTGTTTATGGAGATGTGCAGCGTGTGAAGATT  954

Query 1111  TTATACAATAAGAAAGACAGCGCTCTAATACAGATGGCTGATGGAAACCAATCACAACTTGCCATGAATCATCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  TTATACAATAAGAAAGACAGCGCTCTAATACAGATGGCTGATGGAAACCAATCACAACTTGCCATGAATCATCT  1028

Query 1185  TAATGGACAGAAAATGTATGGAAAAATTATTCGTGTTACTCTGTCTAAACATCAGACTGTACAGCTACCTCGAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029  TAATGGACAGAAAATGTATGGAAAAATTATTCGTGTTACTCTGTCTAAACATCAGACTGTACAGCTACCTCGAG  1102

Query 1259  AGGGACTTGATGATCAAGGGCTAACAAAAGATTTTGGTAATTCCCCATTGCATCGTTTTAAGAAACCTGGATCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103  AGGGACTTGATGATCAAGGGCTAACAAAAGATTTTGGTAATTCCCCATTGCATCGTTTTAAGAAACCTGGATCC  1176

Query 1333  AAAAATTTTCAAAACATTTTTCCTCCTTCTGCCACCCTTCACCTATCTAATATCCCTCCATCAGTAGCAGAAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177  AAAAATTTTCAAAACATTTTTCCTCCTTCTGCCACCCTTCACCTATCTAATATCCCTCCATCAGTAGCAGAAGA  1250

Query 1407  GGATCTACGAACACTGTTCGCTAACACTGGGGGCACTGTGAAAGCATTTAAGTTTTTTCAAAGAGATCACAAAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251  GGATCTACGAACACTGTTCGCTAACACTGGGGGCACTGTGAAAGCATTTAAGTTTTTTCAAAGAGATCACAAAA  1324

Query 1481  TGGCTCTTCTTCAGATGGCAACAGTGGAAGAAGCTATTCAGGCCTTGATTGATCTTCATAATTATAACCTTGGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325  TGGCTCTTCTTCAGATGGCAACAGTGGAAGAAGCTATTCAGGCCTTGATTGATCTTCATAATTATAACCTTGGA  1398

Query 1555  GAAAACCATCATCTGAGAGTGTCTTTCTCAAAGTCAACAATT  1596
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1399  GAAAACCATCATCTGAGAGTGTCTTTCTCCAAGTCAACAATT  1440