Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473640
• Subject: NM_001310711.1
• Aligned Length: 1596
• Identities: 1492
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGACGGAATCGTCACTGAGGTTGCAGTTGGCGTGAAGAGAGGATCTGACGAACTACTCTCAGGCAGTGTTCT  74
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGGAATTGTCACTGAGGTTGCTGTTGGTGTGAAGAGAGGATCTGACGAGCTACTCTCAGGCAGTGTTCT  74

Query   75  CAGTAGTCCGAACTCTAATATGAGCAGCATGGTAGTTACAGCCAATGGTAATGATAGTAAAAAATTTAAAGGAG  148
            |||.||.||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  CAGCAGCCCCAACTCTAATATGAGTGGCATGGTAGTTACAGCCAACGGTAACGATAGTAAGAAATTTAAAGGAG  148

Query  149  AAGATAAAATGGATGGTGCTCCTTCTCGTGTACTTCATATTCGAAAATTACCTGGGGAAGTAACAGAAACTGAA  222
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct  149  AAGATAAAATGGATGGGGCTCCCTCTCGTGTACTTCACATTCGAAAGTTACCTGGTGAAGTGACTGAAACAGAA  222

Query  223  GTTATTGCTTTAGGCTTACCTTTTGGTAAGGTGACCAACATCCTTATGCTGAAAGGAAAAAATCAGGCATTTTT  296
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  GTTATTGCTTTAGGTTTACCTTTTGGTAAGGTGACTAACATCCTTATGCTGAAAGGAAAAAACCAGGCATTTTT  296

Query  297  GGAACTAGCAACCGAGGAAGCAGCTATTACTATGGTTAATTACTATTCTGCTGTGACACCTCATCTTCGTAACC  370
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAACTGGCAACAGAGGAAGCAGCTATTACTATGGTTAATTACTATTCTGCTGTGACACCTCATCTTCGTAACC  370

Query  371  AACCAATATATATCCAGTACTCGAATCACAAAGAACTAAAGACAGATAATACATTAAACCAACGTGCTCAGGCA  444
            |||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.|
Sbjct  371  AACCAATTTACATCCAGTACTCCAATCACAAAGAACTAAAGACAGATAATACATTAAACCAACGTGCGCAAGTA  444

Query  445  GTTCTTCAAGCTGTGACAGCTGTCCAGACAGCAAATACTCCTCTTAGTGGCACCACAGTTAGCGAGAGTGCAGT  518
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  445  GTTCTTCAAGCTGTGACAGCGGTCCAGACAGCAAATACACCTCTTAGTGGCACCACAGTCAGTGAGAGTGCGGT  518

Query  519  GACTCCAGCCCAGAGTCCAGTACTTAGAATAATTATTGACAACATGTACTACCCTGTAACACTTGATGTTCTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  GACTCCAGCCCAGAGTCCAGTACTTAGAATAATTATTGACAATATGTACTACCCTGTAACACTTGATGTCCTTC  592

Query  593  ACCAAATATTTTCTAAGTTTGGTGCTGTATTGAAGATAATCACATTTACAAAAAATAACCAGTTTCAAGCTTTG  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  593  ACCAAATATTTTCTAAGTTTGGTGCTGTATTGAAGATAATCACATTTACAAAAAACAACCAGTTTCAGGCTTTG  666

Query  667  CTCCAGTATGGTGATCCAGTAAATGCTCAACAAGCAAAACTAGCCCTAGATGGTCAGAATATTTATAATGCCTG  740
            |||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  667  CTCCAGTATGGTGATCCGGTAAACGCTCAACAAGCCAAGCTAGCCCTAGATGGTCAAAATATTTATAATGCTTG  740

Query  741  CTGTACCCTAAGGATTGATTTTTCCAAACTTGTGAATTTGAATGTAAAATACAACAATGATAAAAGTAGGGATT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGTACCCTAAGGATTGATTTTTCCAAACTTGTGAATTTGAATGTAAAATACAACAATGATAAAAGTAGGGATT  814

Query  815  ATACTCGACCTGATCTTCCATCTGGGGATGGACAACCTGCATTGGACCCAGCTATTGCTGCAGCATTTGCCAAG  888
            ||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATACTCGACCTGATCTGCCATCTGGAGACGGCCAGCCTGCGTTAGACCCAGCCATTGCTGCAGCATTTGCCAAG  888

Query  889  GAGACATCCCTCTTAGCTGTTCCAGGAGCTCTGAGTCCTTTGGCCATTCCAAATGCTGCTGCAGCAGCTGCTGC  962
            |||||||||||..|||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGACATCCCTACTAGCTGTTCCAGGGGCTCTCAGTCCTTTGGCTATTCCAAATGCTGCTGCAGCAGCTGCTGC  962

Query  963  AGCTGCTGCTGGCCGAGTGGGTATGCCTGGAGTCTCAGCTGGTGGCAATACAGTCCTGTTGGTTAGCAATTTAA  1036
            .|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGCTGCCGCTGGCCGAGTGGGCATGCCTGGAGTCTCAGCTGGTGGCAATACAGTCCTGTTGGTTAGCAATTTAA  1036

Query 1037  ATGAAGAGATGGTTACGCCCCAAAGTCTGTTTACCCTCTTCGGTGTTTATGGAGATGTGCAGCGTGTGAAGATT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  ATGAAGAGATGGTTACGCCCCAAAGTCTGTTTACCCTCTTCGGTGTTTATGGAGATGTGCAGCGCGTGAAGATT  1110

Query 1111  TTATACAATAAGAAAGACAGCGCTCTAATACAGATGGCTGATGGAAACCAATCACAACTTGCCATGAATCATCT  1184
            .|.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGTACAATAAGAAAGACAGTGCTCTGATACAGATGGCTGATGGGAACCAGTCCCAGCTCGCCATGAATCATCT  1184

Query 1185  TAATGGACAGAAAATGTATGGAAAAATTATTCGTGTTACTCTGTCTAAACATCAGACTGTACAGCTACCTCGAG  1258
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1185  TAATGGGCAGAAGATGTATGGAAAAATTATTCGTGTTACTCTCTCTAAACATCAGACTGTGCAACTACCTCGAG  1258

Query 1259  AGGGACTTGATGATCAAGGGCTAACAAAAGATTTTGGTAATTCCCCATTGCATCGTTTTAAGAAACCTGGATCC  1332
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1259  AGGGACTTGATGATCAAGGGCTAACAAAAGATTTTGGGAATTCACCACTGCACCGTTTTAAAAAACCGGGATCC  1332

Query 1333  AAAAATTTTCAAAACATTTTTCCTCCTTCTGCCACCCTTCACCTATCTAATATCCCTCCATCAGTAGCAGAAGA  1406
            |||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1333  AAAAACTTTCAGAACATTTTCCCTCCTTCTGCTACCCTTCACCTGTCTAACATCCCCCCTTCTGTAGCAGAAGA  1406

Query 1407  GGATCTACGAACACTGTTCGCTAACACTGGGGGCACTGTGAAAGCATTTAAGTTTTTTCAAAGAGATCACAAAA  1480
            ||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||
Sbjct 1407  GGATCTGCGAACTCTGTTTGCCAACACCGGGGGCACTGTGAAAGCATTTAAGTTTTTTCA---AGATCACAAAA  1477

Query 1481  TGGCTCTTCTTCAGATGGCAACAGTGGAAGAAGCTATTCAGGCCTTGATTGATCTTCATAATTATAACCTTGGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  TGGCTCTTCTTCAGATGGCAACAGTGGAGGAAGCTATTCAGGCTTTGATTGATCTTCATAATTATAACCTTGGA  1551

Query 1555  GAAAACCATCATCTGAGAGTGTCTTTCTCAAAGTCAACAATT  1596
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1552  GAAAACCATCATCTGAGAGTGTCTTTCTCCAAGTCAACAATC  1593