Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473640
- Subject:
- NM_019550.2
- Aligned Length:
- 1596
- Identities:
- 1495
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGACGGAATCGTCACTGAGGTTGCAGTTGGCGTGAAGAGAGGATCTGACGAACTACTCTCAGGCAGTGTTCT 74
|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACGGAATTGTCACTGAGGTTGCTGTTGGTGTGAAGAGAGGATCTGACGAGCTACTCTCAGGCAGTGTTCT 74
Query 75 CAGTAGTCCGAACTCTAATATGAGCAGCATGGTAGTTACAGCCAATGGTAATGATAGTAAAAAATTTAAAGGAG 148
|||.||.||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 75 CAGCAGCCCCAACTCTAATATGAGTGGCATGGTAGTTACAGCCAACGGTAACGATAGTAAGAAATTTAAAGGAG 148
Query 149 AAGATAAAATGGATGGTGCTCCTTCTCGTGTACTTCATATTCGAAAATTACCTGGGGAAGTAACAGAAACTGAA 222
||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 149 AAGATAAAATGGATGGGGCTCCCTCTCGTGTACTTCACATTCGAAAGTTACCTGGTGAAGTGACTGAAACAGAA 222
Query 223 GTTATTGCTTTAGGCTTACCTTTTGGTAAGGTGACCAACATCCTTATGCTGAAAGGAAAAAATCAGGCATTTTT 296
||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 GTTATTGCTTTAGGTTTACCTTTTGGTAAGGTGACTAACATCCTTATGCTGAAAGGAAAAAACCAGGCATTTTT 296
Query 297 GGAACTAGCAACCGAGGAAGCAGCTATTACTATGGTTAATTACTATTCTGCTGTGACACCTCATCTTCGTAACC 370
||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAACTGGCAACAGAGGAAGCAGCTATTACTATGGTTAATTACTATTCTGCTGTGACACCTCATCTTCGTAACC 370
Query 371 AACCAATATATATCCAGTACTCGAATCACAAAGAACTAAAGACAGATAATACATTAAACCAACGTGCTCAGGCA 444
|||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.|
Sbjct 371 AACCAATTTACATCCAGTACTCCAATCACAAAGAACTAAAGACAGATAATACATTAAACCAACGTGCGCAAGTA 444
Query 445 GTTCTTCAAGCTGTGACAGCTGTCCAGACAGCAAATACTCCTCTTAGTGGCACCACAGTTAGCGAGAGTGCAGT 518
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 445 GTTCTTCAAGCTGTGACAGCGGTCCAGACAGCAAATACACCTCTTAGTGGCACCACAGTCAGTGAGAGTGCGGT 518
Query 519 GACTCCAGCCCAGAGTCCAGTACTTAGAATAATTATTGACAACATGTACTACCCTGTAACACTTGATGTTCTTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 519 GACTCCAGCCCAGAGTCCAGTACTTAGAATAATTATTGACAATATGTACTACCCTGTAACACTTGATGTCCTTC 592
Query 593 ACCAAATATTTTCTAAGTTTGGTGCTGTATTGAAGATAATCACATTTACAAAAAATAACCAGTTTCAAGCTTTG 666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 593 ACCAAATATTTTCTAAGTTTGGTGCTGTATTGAAGATAATCACATTTACAAAAAACAACCAGTTTCAGGCTTTG 666
Query 667 CTCCAGTATGGTGATCCAGTAAATGCTCAACAAGCAAAACTAGCCCTAGATGGTCAGAATATTTATAATGCCTG 740
|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 667 CTCCAGTATGGTGATCCGGTAAACGCTCAACAAGCCAAGCTAGCCCTAGATGGTCAAAATATTTATAATGCTTG 740
Query 741 CTGTACCCTAAGGATTGATTTTTCCAAACTTGTGAATTTGAATGTAAAATACAACAATGATAAAAGTAGGGATT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTGTACCCTAAGGATTGATTTTTCCAAACTTGTGAATTTGAATGTAAAATACAACAATGATAAAAGTAGGGATT 814
Query 815 ATACTCGACCTGATCTTCCATCTGGGGATGGACAACCTGCATTGGACCCAGCTATTGCTGCAGCATTTGCCAAG 888
||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATACTCGACCTGATCTGCCATCTGGAGACGGCCAGCCTGCGTTAGACCCAGCCATTGCTGCAGCATTTGCCAAG 888
Query 889 GAGACATCCCTCTTAGCTGTTCCAGGAGCTCTGAGTCCTTTGGCCATTCCAAATGCTGCTGCAGCAGCTGCTGC 962
|||||||||||..|||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAGACATCCCTACTAGCTGTTCCAGGGGCTCTCAGTCCTTTGGCTATTCCAAATGCTGCTGCAGCAGCTGCTGC 962
Query 963 AGCTGCTGCTGGCCGAGTGGGTATGCCTGGAGTCTCAGCTGGTGGCAATACAGTCCTGTTGGTTAGCAATTTAA 1036
.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CGCTGCCGCTGGCCGAGTGGGCATGCCTGGAGTCTCAGCTGGTGGCAATACAGTCCTGTTGGTTAGCAATTTAA 1036
Query 1037 ATGAAGAGATGGTTACGCCCCAAAGTCTGTTTACCCTCTTCGGTGTTTATGGAGATGTGCAGCGTGTGAAGATT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037 ATGAAGAGATGGTTACGCCCCAAAGTCTGTTTACCCTCTTCGGTGTTTATGGAGATGTGCAGCGCGTGAAGATT 1110
Query 1111 TTATACAATAAGAAAGACAGCGCTCTAATACAGATGGCTGATGGAAACCAATCACAACTTGCCATGAATCATCT 1184
.|.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGTACAATAAGAAAGACAGTGCTCTGATACAGATGGCTGATGGGAACCAGTCCCAGCTCGCCATGAATCATCT 1184
Query 1185 TAATGGACAGAAAATGTATGGAAAAATTATTCGTGTTACTCTGTCTAAACATCAGACTGTACAGCTACCTCGAG 1258
||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1185 TAATGGGCAGAAGATGTATGGAAAAATTATTCGTGTTACTCTCTCTAAACATCAGACTGTGCAACTACCTCGAG 1258
Query 1259 AGGGACTTGATGATCAAGGGCTAACAAAAGATTTTGGTAATTCCCCATTGCATCGTTTTAAGAAACCTGGATCC 1332
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1259 AGGGACTTGATGATCAAGGGCTAACAAAAGATTTTGGGAATTCACCACTGCACCGTTTTAAAAAACCGGGATCC 1332
Query 1333 AAAAATTTTCAAAACATTTTTCCTCCTTCTGCCACCCTTCACCTATCTAATATCCCTCCATCAGTAGCAGAAGA 1406
|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1333 AAAAACTTTCAGAACATTTTCCCTCCTTCTGCTACCCTTCACCTGTCTAACATCCCCCCTTCTGTAGCAGAAGA 1406
Query 1407 GGATCTACGAACACTGTTCGCTAACACTGGGGGCACTGTGAAAGCATTTAAGTTTTTTCAAAGAGATCACAAAA 1480
||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGATCTGCGAACTCTGTTTGCCAACACCGGGGGCACTGTGAAAGCATTTAAGTTTTTTCAAAGAGATCACAAAA 1480
Query 1481 TGGCTCTTCTTCAGATGGCAACAGTGGAAGAAGCTATTCAGGCCTTGATTGATCTTCATAATTATAACCTTGGA 1554
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGGCTCTTCTTCAGATGGCAACAGTGGAGGAAGCTATTCAGGCTTTGATTGATCTTCATAATTATAACCTTGGA 1554
Query 1555 GAAAACCATCATCTGAGAGTGTCTTTCTCAAAGTCAACAATT 1596
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1555 GAAAACCATCATCTGAGAGTGTCTTTCTCCAAGTCAACAATC 1596