Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473640
• Subject: XM_006501732.1
• Aligned Length: 1611
• Identities: 1494
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGGACGGAATCGTCACTGAGGTTGCAGTTGGCGTGAAGAGAGGATCTGACGAACTACTCTCAGGCAGTGTTCT  74
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGGAATTGTCACTGAGGTTGCTGTTGGTGTGAAGAGAGGATCTGACGAGCTACTCTCAGGCAGTGTTCT  74

Query   75  CAGTAGTCCGAACTCTAATATGAGCAGCATGGTAGTTACAGCCAATGGTAATGATAGTAAAAAATTTAAAGGAG  148
            |||.||.||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  CAGCAGCCCCAACTCTAATATGAGTGGCATGGTAGTTACAGCCAACGGTAACGATAGTAAGAAATTTAAAGGAG  148

Query  149  AAGATAAAATGGATGGTGCTCCTTCTCGTGTACTTCATATTCGAAAATTACCTGGGGAAGTAACAGAAACTGAA  222
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct  149  AAGATAAAATGGATGGGGCTCCCTCTCGTGTACTTCACATTCGAAAGTTACCTGGTGAAGTGACTGAAACAGAA  222

Query  223  GTTATTGCTTTAGGCTTACCTTTTGGTAAGGTGACCAACATCCTTATGCTGAAAGGAAAAAATCAGGCATTTTT  296
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  GTTATTGCTTTAGGTTTACCTTTTGGTAAGGTGACTAACATCCTTATGCTGAAAGGAAAAAACCAGGCATTTTT  296

Query  297  GGAACTAGCAACCGAGGAAGCAGCTATTACTATGGTTAATTACTATTCTGCTGTGACACCTCATCTTCGTAACC  370
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAACTGGCAACAGAGGAAGCAGCTATTACTATGGTTAATTACTATTCTGCTGTGACACCTCATCTTCGTAACC  370

Query  371  AACCAATATATATCCAGTACTCGAATCACAAAGAACTAAAGACAGATAATACATTAAACCAACGTGCTCAGGCA  444
            |||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.|
Sbjct  371  AACCAATTTACATCCAGTACTCCAATCACAAAGAACTAAAGACAGATAATACATTAAACCAACGTGCGCAAGTA  444

Query  445  GTTCTTCAAGCTGTGACAGCTGTCCAGACAGCAAATACTCCTCTTAGTGGCACCACAGTTAGCGAGAGTGCAGT  518
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  445  GTTCTTCAAGCTGTGACAGCGGTCCAGACAGCAAATACACCTCTTAGTGGCACCACAGTCAGTGAGAGTGCGGT  518

Query  519  GACTCCAGCCCAGAGTCCAGTACTTAGAATAATTATTGACAACATGTACTACCCTGTAACACTTGATGTTCTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  GACTCCAGCCCAGAGTCCAGTACTTAGAATAATTATTGACAATATGTACTACCCTGTAACACTTGATGTCCTTC  592

Query  593  ACCAAATATTTTCTAAGTTTGGTGCTGTATTGAAGATAATCACATTTACAAAAAATAACCAGTTTCAAGCTTTG  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  593  ACCAAATATTTTCTAAGTTTGGTGCTGTATTGAAGATAATCACATTTACAAAAAACAACCAGTTTCAGGCTTTG  666

Query  667  CTCCAGTATGGTGATCCAGTAAATGCTCAACAAGCAAAACTAGCCCTAGATGGTCAGAATATTTATAATGCCTG  740
            |||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  667  CTCCAGTATGGTGATCCGGTAAACGCTCAACAAGCCAAGCTAGCCCTAGATGGTCAAAATATTTATAATGCTTG  740

Query  741  CTGTACCCTAAGGATTGATTTTTCCAAACTTGTGAATTTGAATGTAAAATACAACAATGATAAAAGTAGGGATT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGTACCCTAAGGATTGATTTTTCCAAACTTGTGAATTTGAATGTAAAATACAACAATGATAAAAGTAGGGATT  814

Query  815  ATACTCGACCTGATCTTCCATCTGGGGATGGACAACCTGCATTGGACCCAGCTATTGCTGCAGCATTTGCCAAG  888
            ||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATACTCGACCTGATCTGCCATCTGGAGACGGCCAGCCTGCGTTAGACCCAGCCATTGCTGCAGCATTTGCCAAG  888

Query  889  GAGACATCCCT-------CTT--------AGCTGTTCCAGGAGCTCTGAGTCCTTTGGCCATTCCAAATGCTGC  947
            |||||||||||       |||        ||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  889  GAGACATCCCTACTAGGGCTTCCTGTTGCAGCTGTTCCAGGGGCTCTCAGTCCTTTGGCTATTCCAAATGCTGC  962

Query  948  TGCAGCAGCTGCTGCAGCTGCTGCTGGCCGAGTGGGTATGCCTGGAGTCTCAGCTGGTGGCAATACAGTCCTGT  1021
            |||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGCAGCAGCTGCTGCCGCTGCCGCTGGCCGAGTGGGCATGCCTGGAGTCTCAGCTGGTGGCAATACAGTCCTGT  1036

Query 1022  TGGTTAGCAATTTAAATGAAGAGATGGTTACGCCCCAAAGTCTGTTTACCCTCTTCGGTGTTTATGGAGATGTG  1095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGTTAGCAATTTAAATGAAGAGATGGTTACGCCCCAAAGTCTGTTTACCCTCTTCGGTGTTTATGGAGATGTG  1110

Query 1096  CAGCGTGTGAAGATTTTATACAATAAGAAAGACAGCGCTCTAATACAGATGGCTGATGGAAACCAATCACAACT  1169
            |||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 1111  CAGCGCGTGAAGATTCTGTACAATAAGAAAGACAGTGCTCTGATACAGATGGCTGATGGGAACCAGTCCCAGCT  1184

Query 1170  TGCCATGAATCATCTTAATGGACAGAAAATGTATGGAAAAATTATTCGTGTTACTCTGTCTAAACATCAGACTG  1243
            .||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGCCATGAATCATCTTAATGGGCAGAAGATGTATGGAAAAATTATTCGTGTTACTCTCTCTAAACATCAGACTG  1258

Query 1244  TACAGCTACCTCGAGAGGGACTTGATGATCAAGGGCTAACAAAAGATTTTGGTAATTCCCCATTGCATCGTTTT  1317
            |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||.||||||
Sbjct 1259  TGCAACTACCTCGAGAGGGACTTGATGATCAAGGGCTAACAAAAGATTTTGGGAATTCACCACTGCACCGTTTT  1332

Query 1318  AAGAAACCTGGATCCAAAAATTTTCAAAACATTTTTCCTCCTTCTGCCACCCTTCACCTATCTAATATCCCTCC  1391
            ||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 1333  AAAAAACCGGGATCCAAAAACTTTCAGAACATTTTCCCTCCTTCTGCTACCCTTCACCTGTCTAACATCCCCCC  1406

Query 1392  ATCAGTAGCAGAAGAGGATCTACGAACACTGTTCGCTAACACTGGGGGCACTGTGAAAGCATTTAAGTTTTTTC  1465
            .||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTCTGTAGCAGAAGAGGATCTGCGAACTCTGTTTGCCAACACCGGGGGCACTGTGAAAGCATTTAAGTTTTTTC  1480

Query 1466  AAAGAGATCACAAAATGGCTCTTCTTCAGATGGCAACAGTGGAAGAAGCTATTCAGGCCTTGATTGATCTTCAT  1539
            |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1481  A---AGATCACAAAATGGCTCTTCTTCAGATGGCAACAGTGGAGGAAGCTATTCAGGCTTTGATTGATCTTCAT  1551

Query 1540  AATTATAACCTTGGAGAAAACCATCATCTGAGAGTGTCTTTCTCAAAGTCAACAATT  1596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1552  AATTATAACCTTGGAGAAAACCATCATCTGAGAGTGTCTTTCTCCAAGTCAACAATC  1608