Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473640
• Subject: XM_011541874.2
• Aligned Length: 1635
• Identities: 1592
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ATGGACG------------------------GAATCGTCACTGAGGTTGCAGTTGGCGTGAAGAGAGGATCTGA  50
            |||||||                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGGGTATGTAATCGGGCCGGCGAGAAGAATCGTCACTGAGGTTGCAGTTGGCGTGAAGAGAGGATCTGA  74

Query   51  CGAACTACTCTCAGGCAGTGTTCTCAGTAGTCCGAACTCTAATATGAGCAGCATGGTAGTTACAGCCAATGGTA  124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGAACTACTCTCAGGCAGTGTTCTCAGTAGTCCGAACTCTAATATGAGCAGCATGGTAGTTACAGCCAATGGTA  148

Query  125  ATGATAGTAAAAAATTTAAAGGAGAAGATAAAATGGATGGTGCTCCTTCTCGTGTACTTCATATTCGAAAATTA  198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGATAGTAAAAAATTTAAAGGAGAAGATAAAATGGATGGTGCTCCTTCTCGTGTACTTCATATTCGAAAATTA  222

Query  199  CCTGGGGAAGTAACAGAAACTGAAGTTATTGCTTTAGGCTTACCTTTTGGTAAGGTGACCAACATCCTTATGCT  272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTGGGGAAGTAACAGAAACTGAAGTTATTGCTTTAGGCTTACCTTTTGGTAAGGTGACCAACATCCTTATGCT  296

Query  273  GAAAGGAAAAAATCAGGCATTTTTGGAACTAGCAACCGAGGAAGCAGCTATTACTATGGTTAATTACTATTCTG  346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAAGGAAAAAATCAGGCATTTTTGGAACTAGCAACCGAGGAAGCAGCTATTACTATGGTTAATTACTATTCTG  370

Query  347  CTGTGACACCTCATCTTCGTAACCAACCAATATATATCCAGTACTCGAATCACAAAGAACTAAAGACAGATAAT  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGTGACACCTCATCTTCGTAACCAACCAATATATATCCAGTACTCGAATCACAAAGAACTAAAGACAGATAAT  444

Query  421  ACATTAAACCAACGTGCTCAGGCAGTTCTTCAAGCTGTGACAGCTGTCCAGACAGCAAATACTCCTCTTAGTGG  494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACATTAAACCAACGTGCTCAGGCAGTTCTTCAAGCTGTGACAGCTGTCCAGACAGCAAATACTCCTCTTAGTGG  518

Query  495  CACCACAGTTAGCGAGAGTGCAGTGACTCCAGCCCAGAGTCCAGTACTTAGAATAATTATTGACAACATGTACT  568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACCACAGTTAGCGAGAGTGCAGTGACTCCAGCCCAGAGTCCAGTACTTAGAATAATTATTGACAACATGTACT  592

Query  569  ACCCTGTAACACTTGATGTTCTTCACCAAATATTTTCTAAGTTTGGTGCTGTATTGAAGATAATCACATTTACA  642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCCTGTAACACTTGATGTTCTTCACCAAATATTTTCTAAGTTTGGTGCTGTATTGAAGATAATCACATTTACA  666

Query  643  AAAAATAACCAGTTTCAAGCTTTGCTCCAGTATGGTGATCCAGTAAATGCTCAACAAGCAAAACTAGCCCTAGA  716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAAATAACCAGTTTCAAGCTTTGCTCCAGTATGGTGATCCAGTAAATGCTCAACAAGCAAAACTAGCCCTAGA  740

Query  717  TGGTCAGAATATTTATAATGCCTGCTGTACCCTAAGGATTGATTTTTCCAAACTTGTGAATTTGAATGTAAAAT  790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGTCAGAATATTTATAATGCCTGCTGTACCCTAAGGATTGATTTTTCCAAACTTGTGAATTTGAATGTAAAAT  814

Query  791  ACAACAATGATAAAAGTAGGGATTATACTCGACCTGATCTTCCATCTGGGGATGGACAACCTGCATTGGACCCA  864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACAACAATGATAAAAGTAGGGATTATACTCGACCTGATCTTCCATCTGGGGATGGACAACCTGCATTGGACCCA  888

Query  865  GCTATTGCTGCAGCATTTGCCAAGGAGACATCCCTCTT---------------AGCTGTTCCAGGAGCTCTGAG  923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCTATTGCTGCAGCATTTGCCAAGGAGACATCCCTCTTAGGGCTTCCTGTTGCAGCTGTTCCAGGAGCTCTGAG  962

Query  924  TCCTTTGGCCATTCCAAATGCTGCTGCAGCAGCTGCTGCAGCTGCTGCTGGCCGAGTGGGTATGCCTGGAGTCT  997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCCTTTGGCCATTCCAAATGCTGCTGCAGCAGCTGCTGCAGCTGCTGCTGGCCGAGTGGGTATGCCTGGAGTCT  1036

Query  998  CAGCTGGTGGCAATACAGTCCTGTTGGTTAGCAATTTAAATGAAGAGATGGTTACGCCCCAAAGTCTGTTTACC  1071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGCTGGTGGCAATACAGTCCTGTTGGTTAGCAATTTAAATGAAGAGATGGTTACGCCCCAAAGTCTGTTTACC  1110

Query 1072  CTCTTCGGTGTTTATGGAGATGTGCAGCGTGTGAAGATTTTATACAATAAGAAAGACAGCGCTCTAATACAGAT  1145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTCTTCGGTGTTTATGGAGATGTGCAGCGTGTGAAGATTTTATACAATAAGAAAGACAGCGCTCTAATACAGAT  1184

Query 1146  GGCTGATGGAAACCAATCACAACTTGCCATGAATCATCTTAATGGACAGAAAATGTATGGAAAAATTATTCGTG  1219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCTGATGGAAACCAATCACAACTTGCCATGAATCATCTTAATGGACAGAAAATGTATGGAAAAATTATTCGTG  1258

Query 1220  TTACTCTGTCTAAACATCAGACTGTACAGCTACCTCGAGAGGGACTTGATGATCAAGGGCTAACAAAAGATTTT  1293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTACTCTGTCTAAACATCAGACTGTACAGCTACCTCGAGAGGGACTTGATGATCAAGGGCTAACAAAAGATTTT  1332

Query 1294  GGTAATTCCCCATTGCATCGTTTTAAGAAACCTGGATCCAAAAATTTTCAAAACATTTTTCCTCCTTCTGCCAC  1367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGTAATTCCCCATTGCATCGTTTTAAGAAACCTGGATCCAAAAATTTTCAAAACATTTTTCCTCCTTCTGCCAC  1406

Query 1368  CCTTCACCTATCTAATATCCCTCCATCAGTAGCAGAAGAGGATCTACGAACACTGTTCGCTAACACTGGGGGCA  1441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCTTCACCTATCTAATATCCCTCCATCAGTAGCAGAAGAGGATCTACGAACACTGTTCGCTAACACTGGGGGCA  1480

Query 1442  CTGTGAAAGCATTTAAGTTTTTTCAAAGAGATCACAAAATGGCTCTTCTTCAGATGGCAACAGTGGAAGAAGCT  1515
            |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGTGAAAGCATTTAAGTTTTTTCA---AGATCACAAAATGGCTCTTCTTCAGATGGCAACAGTGGAAGAAGCT  1551

Query 1516  ATTCAGGCCTTGATTGATCTTCATAATTATAACCTTGGAGAAAACCATCATCTGAGAGTGTCTTTCTCAAAGTC  1589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1552  ATTCAGGCCTTGATTGATCTTCATAATTATAACCTTGGAGAAAACCATCATCTGAGAGTGTCTTTCTCCAAGTC  1625

Query 1590  AACAATT  1596
            |||||||
Sbjct 1626  AACAATT  1632