Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473640
- Subject:
- XM_011541876.2
- Aligned Length:
- 1635
- Identities:
- 1595
- Gaps:
- 39
Alignment
Query 1 ATGGACG------------------------GAATCGTCACTGAGGTTGCAGTTGGCGTGAAGAGAGGATCTGA 50
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACGGGTATGTAATCGGGCCGGCGAGAAGAATCGTCACTGAGGTTGCAGTTGGCGTGAAGAGAGGATCTGA 74
Query 51 CGAACTACTCTCAGGCAGTGTTCTCAGTAGTCCGAACTCTAATATGAGCAGCATGGTAGTTACAGCCAATGGTA 124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGAACTACTCTCAGGCAGTGTTCTCAGTAGTCCGAACTCTAATATGAGCAGCATGGTAGTTACAGCCAATGGTA 148
Query 125 ATGATAGTAAAAAATTTAAAGGAGAAGATAAAATGGATGGTGCTCCTTCTCGTGTACTTCATATTCGAAAATTA 198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGATAGTAAAAAATTTAAAGGAGAAGATAAAATGGATGGTGCTCCTTCTCGTGTACTTCATATTCGAAAATTA 222
Query 199 CCTGGGGAAGTAACAGAAACTGAAGTTATTGCTTTAGGCTTACCTTTTGGTAAGGTGACCAACATCCTTATGCT 272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCTGGGGAAGTAACAGAAACTGAAGTTATTGCTTTAGGCTTACCTTTTGGTAAGGTGACCAACATCCTTATGCT 296
Query 273 GAAAGGAAAAAATCAGGCATTTTTGGAACTAGCAACCGAGGAAGCAGCTATTACTATGGTTAATTACTATTCTG 346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAAAGGAAAAAATCAGGCATTTTTGGAACTAGCAACCGAGGAAGCAGCTATTACTATGGTTAATTACTATTCTG 370
Query 347 CTGTGACACCTCATCTTCGTAACCAACCAATATATATCCAGTACTCGAATCACAAAGAACTAAAGACAGATAAT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGTGACACCTCATCTTCGTAACCAACCAATATATATCCAGTACTCGAATCACAAAGAACTAAAGACAGATAAT 444
Query 421 ACATTAAACCAACGTGCTCAGGCAGTTCTTCAAGCTGTGACAGCTGTCCAGACAGCAAATACTCCTCTTAGTGG 494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACATTAAACCAACGTGCTCAGGCAGTTCTTCAAGCTGTGACAGCTGTCCAGACAGCAAATACTCCTCTTAGTGG 518
Query 495 CACCACAGTTAGCGAGAGTGCAGTGACTCCAGCCCAGAGTCCAGTACTTAGAATAATTATTGACAACATGTACT 568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CACCACAGTTAGCGAGAGTGCAGTGACTCCAGCCCAGAGTCCAGTACTTAGAATAATTATTGACAACATGTACT 592
Query 569 ACCCTGTAACACTTGATGTTCTTCACCAAATATTTTCTAAGTTTGGTGCTGTATTGAAGATAATCACATTTACA 642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACCCTGTAACACTTGATGTTCTTCACCAAATATTTTCTAAGTTTGGTGCTGTATTGAAGATAATCACATTTACA 666
Query 643 AAAAATAACCAGTTTCAAGCTTTGCTCCAGTATGGTGATCCAGTAAATGCTCAACAAGCAAAACTAGCCCTAGA 716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAAAATAACCAGTTTCAAGCTTTGCTCCAGTATGGTGATCCAGTAAATGCTCAACAAGCAAAACTAGCCCTAGA 740
Query 717 TGGTCAGAATATTTATAATGCCTGCTGTACCCTAAGGATTGATTTTTCCAAACTTGTGAATTTGAATGTAAAAT 790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGGTCAGAATATTTATAATGCCTGCTGTACCCTAAGGATTGATTTTTCCAAACTTGTGAATTTGAATGTAAAAT 814
Query 791 ACAACAATGATAAAAGTAGGGATTATACTCGACCTGATCTTCCATCTGGGGATGGACAACCTGCATTGGACCCA 864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACAACAATGATAAAAGTAGGGATTATACTCGACCTGATCTTCCATCTGGGGATGGACAACCTGCATTGGACCCA 888
Query 865 GCTATTGCTGCAGCATTTGCCAAGGAGACATCCCTCTT---------------AGCTGTTCCAGGAGCTCTGAG 923
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCTATTGCTGCAGCATTTGCCAAGGAGACATCCCTCTTAGGGCTTCCTGTTGCAGCTGTTCCAGGAGCTCTGAG 962
Query 924 TCCTTTGGCCATTCCAAATGCTGCTGCAGCAGCTGCTGCAGCTGCTGCTGGCCGAGTGGGTATGCCTGGAGTCT 997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCCTTTGGCCATTCCAAATGCTGCTGCAGCAGCTGCTGCAGCTGCTGCTGGCCGAGTGGGTATGCCTGGAGTCT 1036
Query 998 CAGCTGGTGGCAATACAGTCCTGTTGGTTAGCAATTTAAATGAAGAGATGGTTACGCCCCAAAGTCTGTTTACC 1071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGCTGGTGGCAATACAGTCCTGTTGGTTAGCAATTTAAATGAAGAGATGGTTACGCCCCAAAGTCTGTTTACC 1110
Query 1072 CTCTTCGGTGTTTATGGAGATGTGCAGCGTGTGAAGATTTTATACAATAAGAAAGACAGCGCTCTAATACAGAT 1145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTCTTCGGTGTTTATGGAGATGTGCAGCGTGTGAAGATTTTATACAATAAGAAAGACAGCGCTCTAATACAGAT 1184
Query 1146 GGCTGATGGAAACCAATCACAACTTGCCATGAATCATCTTAATGGACAGAAAATGTATGGAAAAATTATTCGTG 1219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGCTGATGGAAACCAATCACAACTTGCCATGAATCATCTTAATGGACAGAAAATGTATGGAAAAATTATTCGTG 1258
Query 1220 TTACTCTGTCTAAACATCAGACTGTACAGCTACCTCGAGAGGGACTTGATGATCAAGGGCTAACAAAAGATTTT 1293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTACTCTGTCTAAACATCAGACTGTACAGCTACCTCGAGAGGGACTTGATGATCAAGGGCTAACAAAAGATTTT 1332
Query 1294 GGTAATTCCCCATTGCATCGTTTTAAGAAACCTGGATCCAAAAATTTTCAAAACATTTTTCCTCCTTCTGCCAC 1367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GGTAATTCCCCATTGCATCGTTTTAAGAAACCTGGATCCAAAAATTTTCAAAACATTTTTCCTCCTTCTGCCAC 1406
Query 1368 CCTTCACCTATCTAATATCCCTCCATCAGTAGCAGAAGAGGATCTACGAACACTGTTCGCTAACACTGGGGGCA 1441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CCTTCACCTATCTAATATCCCTCCATCAGTAGCAGAAGAGGATCTACGAACACTGTTCGCTAACACTGGGGGCA 1480
Query 1442 CTGTGAAAGCATTTAAGTTTTTTCAAAGAGATCACAAAATGGCTCTTCTTCAGATGGCAACAGTGGAAGAAGCT 1515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTGTGAAAGCATTTAAGTTTTTTCAAAGAGATCACAAAATGGCTCTTCTTCAGATGGCAACAGTGGAAGAAGCT 1554
Query 1516 ATTCAGGCCTTGATTGATCTTCATAATTATAACCTTGGAGAAAACCATCATCTGAGAGTGTCTTTCTCAAAGTC 1589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1555 ATTCAGGCCTTGATTGATCTTCATAATTATAACCTTGGAGAAAACCATCATCTGAGAGTGTCTTTCTCCAAGTC 1628
Query 1590 AACAATT 1596
|||||||
Sbjct 1629 AACAATT 1635