Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473640
- Subject:
- XM_017001951.1
- Aligned Length:
- 1650
- Identities:
- 1582
- Gaps:
- 60
Alignment
Query 1 ATGGACGGAATCGTCAC-TGAGGTTGCAG-----TTGGCGTG-------------------------------- 36
||| .||| ||.|| |||..|| ||| ||||..||
Sbjct 1 ATG--TGGA---GTAACTTGACCTT-CAGTTTTTTTGGTCTGAGAACAAAGGCCAAAAAATATGTAACAGTTAA 68
Query 37 -AAGAGAGGATCTGACGAACTACTCTCAGGCAGTGTTCTCAGTAGTCCGAACTCTAATATGAGCAGCATGGTAG 109
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 69 TAACAGAGGATCTGACGAACTACTCTCAGGCAGTGTTCTCAGTAGTCCGAACTCTAATATGAGCAGCATGGTAG 142
Query 110 TTACAGCCAATGGTAATGATAGTAAAAAATTTAAAGGAGAAGATAAAATGGATGGTGCTCCTTCTCGTGTACTT 183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 143 TTACAGCCAATGGTAATGATAGTAAAAAATTTAAAGGAGAAGATAAAATGGATGGTGCTCCTTCTCGTGTACTT 216
Query 184 CATATTCGAAAATTACCTGGGGAAGTAACAGAAACTGAAGTTATTGCTTTAGGCTTACCTTTTGGTAAGGTGAC 257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217 CATATTCGAAAATTACCTGGGGAAGTAACAGAAACTGAAGTTATTGCTTTAGGCTTACCTTTTGGTAAGGTGAC 290
Query 258 CAACATCCTTATGCTGAAAGGAAAAAATCAGGCATTTTTGGAACTAGCAACCGAGGAAGCAGCTATTACTATGG 331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 291 CAACATCCTTATGCTGAAAGGAAAAAATCAGGCATTTTTGGAACTAGCAACCGAGGAAGCAGCTATTACTATGG 364
Query 332 TTAATTACTATTCTGCTGTGACACCTCATCTTCGTAACCAACCAATATATATCCAGTACTCGAATCACAAAGAA 405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365 TTAATTACTATTCTGCTGTGACACCTCATCTTCGTAACCAACCAATATATATCCAGTACTCGAATCACAAAGAA 438
Query 406 CTAAAGACAGATAATACATTAAACCAACGTGCTCAGGCAGTTCTTCAAGCTGTGACAGCTGTCCAGACAGCAAA 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 CTAAAGACAGATAATACATTAAACCAACGTGCTCAGGCAGTTCTTCAAGCTGTGACAGCTGTCCAGACAGCAAA 512
Query 480 TACTCCTCTTAGTGGCACCACAGTTAGCGAGAGTGCAGTGACTCCAGCCCAGAGTCCAGTACTTAGAATAATTA 553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 513 TACTCCTCTTAGTGGCACCACAGTTAGCGAGAGTGCAGTGACTCCAGCCCAGAGTCCAGTACTTAGAATAATTA 586
Query 554 TTGACAACATGTACTACCCTGTAACACTTGATGTTCTTCACCAAATATTTTCTAAGTTTGGTGCTGTATTGAAG 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 587 TTGACAACATGTACTACCCTGTAACACTTGATGTTCTTCACCAAATATTTTCTAAGTTTGGTGCTGTATTGAAG 660
Query 628 ATAATCACATTTACAAAAAATAACCAGTTTCAAGCTTTGCTCCAGTATGGTGATCCAGTAAATGCTCAACAAGC 701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 ATAATCACATTTACAAAAAATAACCAGTTTCAAGCTTTGCTCCAGTATGGTGATCCAGTAAATGCTCAACAAGC 734
Query 702 AAAACTAGCCCTAGATGGTCAGAATATTTATAATGCCTGCTGTACCCTAAGGATTGATTTTTCCAAACTTGTGA 775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 735 AAAACTAGCCCTAGATGGTCAGAATATTTATAATGCCTGCTGTACCCTAAGGATTGATTTTTCCAAACTTGTGA 808
Query 776 ATTTGAATGTAAAATACAACAATGATAAAAGTAGGGATTATACTCGACCTGATCTTCCATCTGGGGATGGACAA 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809 ATTTGAATGTAAAATACAACAATGATAAAAGTAGGGATTATACTCGACCTGATCTTCCATCTGGGGATGGACAA 882
Query 850 CCTGCATTGGACCCAGCTATTGCTGCAGCATTTGCCAAGGAGACATCCCTCTT---------------AGCTGT 908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 883 CCTGCATTGGACCCAGCTATTGCTGCAGCATTTGCCAAGGAGACATCCCTCTTAGGGCTTCCTGTTGCAGCTGT 956
Query 909 TCCAGGAGCTCTGAGTCCTTTGGCCATTCCAAATGCTGCTGCAGCAGCTGCTGCAGCTGCTGCTGGCCGAGTGG 982
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 TCCAGGAGCTCTGAGTCCTTTGGCCATTCCAAATGCTGCTGCAGCAGCTGCTGCAGCTGCTGCTGGCCGAGTGG 1030
Query 983 GTATGCCTGGAGTCTCAGCTGGTGGCAATACAGTCCTGTTGGTTAGCAATTTAAATGAAGAGATGGTTACGCCC 1056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031 GTATGCCTGGAGTCTCAGCTGGTGGCAATACAGTCCTGTTGGTTAGCAATTTAAATGAAGAGATGGTTACGCCC 1104
Query 1057 CAAAGTCTGTTTACCCTCTTCGGTGTTTATGGAGATGTGCAGCGTGTGAAGATTTTATACAATAAGAAAGACAG 1130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105 CAAAGTCTGTTTACCCTCTTCGGTGTTTATGGAGATGTGCAGCGTGTGAAGATTTTATACAATAAGAAAGACAG 1178
Query 1131 CGCTCTAATACAGATGGCTGATGGAAACCAATCACAACTTGCCATGAATCATCTTAATGGACAGAAAATGTATG 1204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179 CGCTCTAATACAGATGGCTGATGGAAACCAATCACAACTTGCCATGAATCATCTTAATGGACAGAAAATGTATG 1252
Query 1205 GAAAAATTATTCGTGTTACTCTGTCTAAACATCAGACTGTACAGCTACCTCGAGAGGGACTTGATGATCAAGGG 1278
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 GAAAAATTATTCGTGTTACTCTGTCTAAACATCAGACTGTACAGCTACCTCGAGAGGGACTTGATGATCAAGGG 1326
Query 1279 CTAACAAAAGATTTTGGTAATTCCCCATTGCATCGTTTTAAGAAACCTGGATCCAAAAATTTTCAAAACATTTT 1352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327 CTAACAAAAGATTTTGGTAATTCCCCATTGCATCGTTTTAAGAAACCTGGATCCAAAAATTTTCAAAACATTTT 1400
Query 1353 TCCTCCTTCTGCCACCCTTCACCTATCTAATATCCCTCCATCAGTAGCAGAAGAGGATCTACGAACACTGTTCG 1426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401 TCCTCCTTCTGCCACCCTTCACCTATCTAATATCCCTCCATCAGTAGCAGAAGAGGATCTACGAACACTGTTCG 1474
Query 1427 CTAACACTGGGGGCACTGTGAAAGCATTTAAGTTTTTTCAAAGAGATCACAAAATGGCTCTTCTTCAGATGGCA 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1475 CTAACACTGGGGGCACTGTGAAAGCATTTAAGTTTTTTCAAAGAGATCACAAAATGGCTCTTCTTCAGATGGCA 1548
Query 1501 ACAGTGGAAGAAGCTATTCAGGCCTTGATTGATCTTCATAATTATAACCTTGGAGAAAACCATCATCTGAGAGT 1574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549 ACAGTGGAAGAAGCTATTCAGGCCTTGATTGATCTTCATAATTATAACCTTGGAGAAAACCATCATCTGAGAGT 1622
Query 1575 GTCTTTCTCAAAGTCAACAATT 1596
|||||||||.||||||||||||
Sbjct 1623 GTCTTTCTCCAAGTCAACAATT 1644