Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000473644
Subject:
NM_010878.3
Aligned Length:
1131
Identities:
1050
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGCAGAAGAAGTGGTGGTAGTAGCCAAATTTGATTATGTGGCCCAACAAGAACAAGAGTTGGACATCAAGAA  74
            |||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGAAGAAGTGGTGGTGGTGGCCAAATTTGATTATGTGGCACAGCAGGAACAAGAGCTGGATATCAAGAA  74

Query   75  GAATGAGAGATTATGGCTTCTGGATGATTCTAAGTCCTGGTGGCGAGTTCGAAATTCCATGAATAAAACAGGTT  148
            |||||||.||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAATGAGCGATTATGGCTCCTGGATGACTCTAAATCCTGGTGGCGAGTTCGAAATTCCATGAATAAAACAGGTT  148

Query  149  TTGTGCCTTCTAACTATGTGGAAAGGAAAAACAGTGCTCGGAAAGCATCTATTGTGAAAAACCTAAAGGATACC  222
            ||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  149  TTGTCCCTTCTAACTATGTGGAAAGAAAAAACAGTGCTCGGAAAGCATCTATTGTTAAAAACCTGAAGGACACC  222

Query  223  TTAGGCATTGGAAAAGTGAAAAGAAAACCTAGTGTGCCAGATTCTGCATCTCCTGCTGATGATAGTTTTGTTGA  296
            |||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  223  TTAGGTATTGGAAAAGTGAAAAGAAAACCCAGTGTTCCAGATACTGCATCTCCTGCTGATGATAGCTTTGTTGA  296

Query  297  CCCAGGGGAACGTCTCTATGACCTCAACATGCCCGCTTATGTGAAATTTAACTACATGGCTGAGAGAGAGGATG  370
            .|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCAGGAGAACGTCTCTATGACCTTAACATGCCTGCTTTTGTGAAATTTAACTACATGGCTGAGAGAGAGGATG  370

Query  371  AATTATCATTGATAAAGGGGACAAAGGTGATCGTCATGGAGAAATGCAGTGATGGGTGGTGGCGTGGTAGCTAC  444
            |.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  371  AGTTGTCATTGATAAAAGGGACCAAGGTGATCGTCATGGAGAAATGCAGTGATGGATGGTGGCGTGGCAGCTAC  444

Query  445  AATGGACAAGTTGGATGGTTCCCTTCAAACTATGTAACTGAAGAAGGTGACAGTCCTTTGGGTGACCATGTGGG  518
            ||.||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  445  AACGGACAAATTGGATGGTTTCCTTCAAACTATGTAACTGAAGAAGGTGACAGTCCTTTGGGTGATCATGTAGG  518

Query  519  TTCTCTGTCAGAGAAATTAGCAGCAGTCGTCAATAACCTAAATACTGGGCAAGTGTTGCATGTGGTACAGGCTC  592
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  519  TTCTCTGTCAGAGAAATTAGCAGCAGTTGTCAATAACCTAAATACGGGTCAAGTATTGCATGTTGTACAGGCTC  592

Query  593  TTTACCCATTCAGCTCATCTAATGATGAAGAACTTAATTTCGAGAAAGGAGATGTAATGGATGTTATTGAAAAA  666
            |||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  TTTACCCGTTTAGCTCATCCAATGATGAAGAACTCAATTTTGAGAAAGGCGATGTAATGGATGTTATTGAAAAG  666

Query  667  CCTGAAAATGACCCAGAGTGGTGGAAATGCAGGAAGATCAATGGTATGGTTGGTCTAGTACCAAAAAACTATGT  740
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct  667  CCGGAAAATGACCCAGAGTGGTGGAAATGCAGGAAAATCAATGGCATGGTTGGCCTGGTGCCAAAAAACTACGT  740

Query  741  TACCGTTATGCAGAATAATCCATTAACTTCAGGTTTGGAACCATCACCTCCACAGTGTGATTACATTAGGCCTT  814
            ||||.|||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  TACCATTATGCAAAACAATCCATTAACCTCAGGTTTGGAACCATCTCCTCCACAATGTGATTACATTAGGCCTT  814

Query  815  CACTCACTGGAAAGTTTGCTGGCAATCCTTGGTATTATGGCAAAGTCACCAGGCATCAAGCAGAAATGGCATTA  888
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  815  CACTCACTGGGAAGTTTGCTGGCAATCCTTGGTATTATGGCAAAGTCACCAGGCACCAGGCAGAAATGGCATTA  888

Query  889  AATGAAAGAGGACATGAAGGGGATTTCCTCATTCGTGATAGTGAATCTTCGCCAAATGATTTCTCAGTATCACT  962
            |||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATGAAAGAGGGCATGAAGGAGACTTCCTCATTCGTGACAGTGAATCTTCGCCAAATGATTTCTCAGTATCACT  962

Query  963  AAAAGCACAAGGGAAAAACAAGCATTTTAAAGTCCAACTAAAAGAGACTGTCTACTGCATTGGGCAGCGTAAAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  AAAAGCACAAGGGAAAAACAAGCATTTTAAAGTCCAGCTGAAAGAGACTGTTTACTGCATTGGGCAGCGGAAAT  1036

Query 1037  TCAGCACCATGGAAGAACTTGTAGAACATTACAAAAAGGCACCAATTTTTACAAGTGAACAAGGAGAAAAATTA  1110
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  TCAGCACCATGGAGGAACTTGTAGAACATTACAAAAAGGCACCGATCTTTACAAGTGAGCAAGGAGAAAAATTA  1110

Query 1111  TATCTTGTCAAGCATTTATCA  1131
            |||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1111  TATCTCGTCAAGCATTTGTCT  1131