Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473658
• Subject: NM_001161845.2
• Aligned Length: 1581
• Identities: 1137
• Gaps: 297

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGTAAACAAAGACATGAATGGATTCCCGGTCAAGAAATGCTCAGCGTTCCAATTTTTTAAGAAACGGGTACG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AAGATGGATCAAGAGCCCCATGGTCAGCGTGGACAAGCATCAGAGCCCCAACTTGAAGTACACTGGCCCTGCTG  148

Query    1  -------------------------------------------------ATGAC--GGTGAAAACTGAGGCTGC  23
                                                             |||.|  |||||..|       |||
Sbjct  149  GGGTGCATCTTCCCCCTGGGGAGTCAGACTTTGAGGCCATGTGTCAATCATGCCTGGGTGACCA-------TGC  215

Query   24  T-----AAGG-----GCACCCTC--------ACTTACTCCAGGATGAG---------GGGCATG--GTG-----  63
            |     ||||     ||.|||||        .|.|..|||.||  |||         |||..||  |||     
Sbjct  216  TTTCCAAAGGGGGATGCTCCCTCCAGAGGAGTCCTGTTCCTGG--GAGATCCAACCTGGGTGTGAAGTGAAAGA  287

Query   64  -----GCAATTCT-----CATC---------------------------------------------GCTTTCA  82
                 |.|||..|     ||||                                             |||||.|
Sbjct  288  ACAATGTAATCATGCCAACATCCTGACCAAGCCGGACCCAAGAACCTTCTGGACTAATGATGATGCAGCTTTTA  361

Query   83  TGAAGCAGAGGAGGATGGGTCTGAACGACTTTATTCAGAAGATTGCCAATAACTCCTATGCATGCAAACACCCT  156
            ||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||..|||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  362  TGAAACAGAGAAGGATGGGCCTGAACGATTTTATTCAGAAGATTGCCAGCAACACCTATGCATGCAAACACGCT  435

Query  157  GAAGTTCAGTCCATCTTGAAGATCTCCCAACCTCAGGAGCCTGAGCTTATGAATGCCAACCCTTCTCCTCCACC  230
            ||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||
Sbjct  436  GAAGTTCAGTCCATTTTGAAAATGTCCCATCCTCAGGAGCCGGAGCTTATGAACGCTAACCCCTCTCCTCCGCC  509

Query  231  AAGTCCTTCTCAGCAAATCAACCTTGGCCCGTCGTCCAATCCTCATGCTAAACCATCTGACTTTCACTTCTTGA  304
            ||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  510  AAGTCCCTCTCAACAAATCAACCTGGGTCCGTCCTCCAACCCTCACGCCAAACCCTCCGACTTTCACTTCTTGA  583

Query  305  AAGTGATCGGAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTAGCAAGACACAAGGCAGAAGAAGTGTTCTATGCAGTC  378
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  584  AAGTGATCGGAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTGGCTAGGCACAAGGCAGAAGAAGTATTCTATGCAGTC  657

Query  379  AAAGTTTTACAGAAGAAAGCAATCCTGAAAAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCGGAGCGGAATGTTCTGTT  452
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  658  AAAGTTTTACAGAAGAAAGCCATCCTGAAGAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCAGAGCGGAATGTTCTGTT  731

Query  453  GAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCTTTCCAGACTGCTGACAAATTGTACTTTGTCC  526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||..|.||||||||||
Sbjct  732  GAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCATTCCAGACCGCTGACAAGCTCTACTTTGTCC  805

Query  527  TAGACTACATTAATGGTGGAGAGTTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAACGCTGCTTCCTGGAACCACGGGCTCGT  600
            |.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  806  TGGACTACATTAATGGTGGAGAGCTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAGCGCTGCTTCCTGGAACCACGGGCTCGA  879

Query  601  TTCTATGCTGCTGAAATAGCCAGTGCCTTGGGCTACCTGCATTCACTGAACATCGTTTATAGAGACTTAAAACC  674
            |||||.||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  880  TTCTACGCAGCTGAAATAGCCAGTGCCCTGGGCTATCTGCACTCCCTAAACATCGTTTATAGAGACTTAAAACC  953

Query  675  AGAGAATATTTTGCTAGATTCACAGGGACACATTGTCCTTACTGACTTCGGACTCTGCAAGGAGAACATTGAAC  748
            .|||||||||.|.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct  954  TGAGAATATTCTCCTAGACTCCCAGGGGCACATCGTCCTCACTGACTTTGGGCTCTGCAAAGAGAATATTGAGC  1027

Query  749  ACAACAGCACAACATCCACCTTCTGTGGCACGCCGGAGTATCTCGCACCTGAGGTGCTTCATAAGCAGCCTTAT  822
            |.|||.|.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 1028  ATAACGGGACAACATCTACCTTCTGTGGCACGCCTGAGTATCTGGCTCCTGAGGTCCTCCATAAGCAGCCGTAT  1101

Query  823  GACAGGACTGTGGACTGGTGGTGCCTGGGAGCTGTCTTGTATGAGATGCTGTATGGCCTGCCGCCTTTTTATAG  896
            |||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 1102  GACCGGACGGTGGACTGGTGGTGTCTTGGGGCTGTCCTGTATGAGATGCTCTACGGCCTGCCCCCGTTTTATAG  1175

Query  897  CCGAAACACAGCTGAAATGTACGACAACATTCTGAACAAGCCTCTCCAGCTGAAACCAAATATTACAAATTCCG  970
            |||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1176  CCGGAACACGGCTGAGATGTACGACAATATTCTGAACAAGCCTCTCCAGTTGAAACCAAATATTACAAACTCGG  1249

Query  971  CAAGACACCTCCTGGAGGGCCTCCTGCAGAAGGACAGGACAAAGCGGCTCGGGGCCAAGGATGACTTCATGGAG  1044
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||.||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1250  CAAGGCACCTCCTGGAAGGCCTCCTGCAGAAGGACCGGACCAAGAGGCTGGGTGCCAAGGATGACTTTATGGAG  1323

Query 1045  ATTAAGAGTCATGTCTTCTTCTCCTTAATTAACTGGGATGATCTCATTAATAAGAAGATTACTCCCCCTTTTAA  1118
            ||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1324  ATTAAGAGTCATATTTTCTTCTCTTTAATTAACTGGGATGATCTCATCAATAAGAAGATTACACCCCCATTTAA  1397

Query 1119  CCCAAATGTGAGTGGGCCCAACGACCTACGGCACTTTGACCCCGAGTTTACCGAAGAGCCTGTCCCCAACTCCA  1192
            ||||||||||||||||||||..|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||.|||||
Sbjct 1398  CCCAAATGTGAGTGGGCCCAGTGACCTTCGGCACTTCGATCCCGAGTTTACCGAGGAGCCGGTCCCCAGCTCCA  1471

Query 1193  TTGGCAAGTCCCCTGACAGCGTCCTCGTCACAGCCAGCGTCAAGGAAGCTGCCGAGGCTTTCCTAGGCTTTTCC  1266
            |.||||.|||||||||||||.||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1472  TCGGCAGGTCCCCTGACAGCATCCTTGTCACGGCCAGTGTGAAGGAAGCAGCAGAAGCCTTCCTCGGCTTCTCC  1545

Query 1267  TATGCGCCTCCCACGGACTCTTTACTC  1293
            |||||.|||||...|||.||.||.|||
Sbjct 1546  TATGCACCTCCTGTGGATTCCTTCCTC  1572