Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473658
• Subject: NM_001161847.2
• Aligned Length: 1293
• Identities: 1080
• Gaps: 81

Alignment

Query    1  ATGACGGTGAAAACTGAGGCTGCTAAGGGCACCCTCACTTACTCCAGGATGAGGGGCATGGTGGCAATTCTCAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGCTTTCATGAAGCAGAGGAGGATGGGTCTGAACGACTTTATTCAGAAGATTGCCAATAACTCCTATGCATGCA  148
                   |||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||..|||.||||||||||||
Sbjct    1  -------ATGAAACAGAGAAGGATGGGCCTGAACGATTTTATTCAGAAGATTGCCAGCAACACCTATGCATGCA  67

Query  149  AACACCCTGAAGTTCAGTCCATCTTGAAGATCTCCCAACCTCAGGAGCCTGAGCTTATGAATGCCAACCCTTCT  222
            |||||.||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct   68  AACACGCTGAAGTTCAGTCCATTTTGAAAATGTCCCATCCTCAGGAGCCGGAGCTTATGAACGCTAACCCCTCT  141

Query  223  CCTCCACCAAGTCCTTCTCAGCAAATCAACCTTGGCCCGTCGTCCAATCCTCATGCTAAACCATCTGACTTTCA  296
            |||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||
Sbjct  142  CCTCCGCCAAGTCCCTCTCAACAAATCAACCTGGGTCCGTCCTCCAACCCTCACGCCAAACCCTCCGACTTTCA  215

Query  297  CTTCTTGAAAGTGATCGGAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTAGCAAGACACAAGGCAGAAGAAGTGTTCT  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  216  CTTCTTGAAAGTGATCGGAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTGGCTAGGCACAAGGCAGAAGAAGTATTCT  289

Query  371  ATGCAGTCAAAGTTTTACAGAAGAAAGCAATCCTGAAAAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCGGAGCGGAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  290  ATGCAGTCAAAGTTTTACAGAAGAAAGCCATCCTGAAGAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCAGAGCGGAAT  363

Query  445  GTTCTGTTGAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCTTTCCAGACTGCTGACAAATTGTA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||..|.||
Sbjct  364  GTTCTGTTGAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCATTCCAGACCGCTGACAAGCTCTA  437

Query  519  CTTTGTCCTAGACTACATTAATGGTGGAGAGTTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAACGCTGCTTCCTGGAACCAC  592
            |||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  438  CTTTGTCCTGGACTACATTAATGGTGGAGAGCTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAGCGCTGCTTCCTGGAACCAC  511

Query  593  GGGCTCGTTTCTATGCTGCTGAAATAGCCAGTGCCTTGGGCTACCTGCATTCACTGAACATCGTTTATAGAGAC  666
            |||||||.|||||.||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  512  GGGCTCGATTCTACGCAGCTGAAATAGCCAGTGCCCTGGGCTATCTGCACTCCCTAAACATCGTTTATAGAGAC  585

Query  667  TTAAAACCAGAGAATATTTTGCTAGATTCACAGGGACACATTGTCCTTACTGACTTCGGACTCTGCAAGGAGAA  740
            ||||||||.|||||||||.|.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct  586  TTAAAACCTGAGAATATTCTCCTAGACTCCCAGGGGCACATCGTCCTCACTGACTTTGGGCTCTGCAAAGAGAA  659

Query  741  CATTGAACACAACAGCACAACATCCACCTTCTGTGGCACGCCGGAGTATCTCGCACCTGAGGTGCTTCATAAGC  814
            .|||||.||.|||.|.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  660  TATTGAGCATAACGGGACAACATCTACCTTCTGTGGCACGCCTGAGTATCTGGCTCCTGAGGTCCTCCATAAGC  733

Query  815  AGCCTTATGACAGGACTGTGGACTGGTGGTGCCTGGGAGCTGTCTTGTATGAGATGCTGTATGGCCTGCCGCCT  888
            ||||.||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct  734  AGCCGTATGACCGGACGGTGGACTGGTGGTGTCTTGGGGCTGTCCTGTATGAGATGCTCTACGGCCTGCCCCCG  807

Query  889  TTTTATAGCCGAAACACAGCTGAAATGTACGACAACATTCTGAACAAGCCTCTCCAGCTGAAACCAAATATTAC  962
            |||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  808  TTTTATAGCCGGAACACGGCTGAGATGTACGACAATATTCTGAACAAGCCTCTCCAGTTGAAACCAAATATTAC  881

Query  963  AAATTCCGCAAGACACCTCCTGGAGGGCCTCCTGCAGAAGGACAGGACAAAGCGGCTCGGGGCCAAGGATGACT  1036
            |||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||.||||.||.|||||||||||||
Sbjct  882  AAACTCGGCAAGGCACCTCCTGGAAGGCCTCCTGCAGAAGGACCGGACCAAGAGGCTGGGTGCCAAGGATGACT  955

Query 1037  TCATGGAGATTAAGAGTCATGTCTTCTTCTCCTTAATTAACTGGGATGATCTCATTAATAAGAAGATTACTCCC  1110
            |.||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  956  TTATGGAGATTAAGAGTCATATTTTCTTCTCTTTAATTAACTGGGATGATCTCATCAATAAGAAGATTACACCC  1029

Query 1111  CCTTTTAACCCAAATGTGAGTGGGCCCAACGACCTACGGCACTTTGACCCCGAGTTTACCGAAGAGCCTGTCCC  1184
            ||.|||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1030  CCATTTAACCCAAATGTGAGTGGGCCCAGTGACCTTCGGCACTTCGATCCCGAGTTTACCGAGGAGCCGGTCCC  1103

Query 1185  CAACTCCATTGGCAAGTCCCCTGACAGCGTCCTCGTCACAGCCAGCGTCAAGGAAGCTGCCGAGGCTTTCCTAG  1258
            ||.||||||.||||.|||||||||||||.||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.||.|||||.|
Sbjct 1104  CAGCTCCATCGGCAGGTCCCCTGACAGCATCCTTGTCACGGCCAGTGTGAAGGAAGCAGCAGAAGCCTTCCTCG  1177

Query 1259  GCTTTTCCTATGCGCCTCCCACGGACTCTTTACTC  1293
            ||||.||||||||.|||||...|||.||.||.|||
Sbjct 1178  GCTTCTCCTATGCACCTCCTGTGGATTCCTTCCTC  1212