Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473658
• Subject: NM_001161849.2
• Aligned Length: 1297
• Identities: 1110
• Gaps: 50

Alignment

Query    1  ATGACGGTGAAAACTGAGG----CTGCTAAGGGCACCCTCACTTACTCCAGGATGAGGGGCATGGTGGCAATTC  70
                  .|||||   ||||    ||  ||||..| ||||                          |||.||   
Sbjct    1  ------ATGAAA---GAGGAGACCT--TAAGATC-CCCT--------------------------TGGAAA---  33

Query   71  TCATCGCTTTCATGAAGCAGAGGAGGATGGGTCTGAACGACTTTATTCAGAAGATTGCCAATAACTCCTATGCA  144
                 |||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||..|||.||||||||
Sbjct   34  -----GCTTTTATGAAACAGAGAAGGATGGGCCTGAACGATTTTATTCAGAAGATTGCCAGCAACACCTATGCA  102

Query  145  TGCAAACACCCTGAAGTTCAGTCCATCTTGAAGATCTCCCAACCTCAGGAGCCTGAGCTTATGAATGCCAACCC  218
            |||||||||.||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct  103  TGCAAACACGCTGAAGTTCAGTCCATTTTGAAAATGTCCCATCCTCAGGAGCCGGAGCTTATGAACGCTAACCC  176

Query  219  TTCTCCTCCACCAAGTCCTTCTCAGCAAATCAACCTTGGCCCGTCGTCCAATCCTCATGCTAAACCATCTGACT  292
            .||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||
Sbjct  177  CTCTCCTCCGCCAAGTCCCTCTCAACAAATCAACCTGGGTCCGTCCTCCAACCCTCACGCCAAACCCTCCGACT  250

Query  293  TTCACTTCTTGAAAGTGATCGGAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTAGCAAGACACAAGGCAGAAGAAGTG  366
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  251  TTCACTTCTTGAAAGTGATCGGAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTGGCTAGGCACAAGGCAGAAGAAGTA  324

Query  367  TTCTATGCAGTCAAAGTTTTACAGAAGAAAGCAATCCTGAAAAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCGGAGCG  440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  325  TTCTATGCAGTCAAAGTTTTACAGAAGAAAGCCATCCTGAAGAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCAGAGCG  398

Query  441  GAATGTTCTGTTGAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCTTTCCAGACTGCTGACAAAT  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||..
Sbjct  399  GAATGTTCTGTTGAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCATTCCAGACCGCTGACAAGC  472

Query  515  TGTACTTTGTCCTAGACTACATTAATGGTGGAGAGTTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAACGCTGCTTCCTGGAA  588
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  473  TCTACTTTGTCCTGGACTACATTAATGGTGGAGAGCTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAGCGCTGCTTCCTGGAA  546

Query  589  CCACGGGCTCGTTTCTATGCTGCTGAAATAGCCAGTGCCTTGGGCTACCTGCATTCACTGAACATCGTTTATAG  662
            |||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct  547  CCACGGGCTCGATTCTACGCAGCTGAAATAGCCAGTGCCCTGGGCTATCTGCACTCCCTAAACATCGTTTATAG  620

Query  663  AGACTTAAAACCAGAGAATATTTTGCTAGATTCACAGGGACACATTGTCCTTACTGACTTCGGACTCTGCAAGG  736
            ||||||||||||.|||||||||.|.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  621  AGACTTAAAACCTGAGAATATTCTCCTAGACTCCCAGGGGCACATCGTCCTCACTGACTTTGGGCTCTGCAAAG  694

Query  737  AGAACATTGAACACAACAGCACAACATCCACCTTCTGTGGCACGCCGGAGTATCTCGCACCTGAGGTGCTTCAT  810
            ||||.|||||.||.|||.|.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||
Sbjct  695  AGAATATTGAGCATAACGGGACAACATCTACCTTCTGTGGCACGCCTGAGTATCTGGCTCCTGAGGTCCTCCAT  768

Query  811  AAGCAGCCTTATGACAGGACTGTGGACTGGTGGTGCCTGGGAGCTGTCTTGTATGAGATGCTGTATGGCCTGCC  884
            ||||||||.||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  769  AAGCAGCCGTATGACCGGACGGTGGACTGGTGGTGTCTTGGGGCTGTCCTGTATGAGATGCTCTACGGCCTGCC  842

Query  885  GCCTTTTTATAGCCGAAACACAGCTGAAATGTACGACAACATTCTGAACAAGCCTCTCCAGCTGAAACCAAATA  958
            .||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  843  CCCGTTTTATAGCCGGAACACGGCTGAGATGTACGACAATATTCTGAACAAGCCTCTCCAGTTGAAACCAAATA  916

Query  959  TTACAAATTCCGCAAGACACCTCCTGGAGGGCCTCCTGCAGAAGGACAGGACAAAGCGGCTCGGGGCCAAGGAT  1032
            |||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||.||||.||.|||||||||
Sbjct  917  TTACAAACTCGGCAAGGCACCTCCTGGAAGGCCTCCTGCAGAAGGACCGGACCAAGAGGCTGGGTGCCAAGGAT  990

Query 1033  GACTTCATGGAGATTAAGAGTCATGTCTTCTTCTCCTTAATTAACTGGGATGATCTCATTAATAAGAAGATTAC  1106
            |||||.||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  991  GACTTTATGGAGATTAAGAGTCATATTTTCTTCTCTTTAATTAACTGGGATGATCTCATCAATAAGAAGATTAC  1064

Query 1107  TCCCCCTTTTAACCCAAATGTGAGTGGGCCCAACGACCTACGGCACTTTGACCCCGAGTTTACCGAAGAGCCTG  1180
            .|||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1065  ACCCCCATTTAACCCAAATGTGAGTGGGCCCAGTGACCTTCGGCACTTCGATCCCGAGTTTACCGAGGAGCCGG  1138

Query 1181  TCCCCAACTCCATTGGCAAGTCCCCTGACAGCGTCCTCGTCACAGCCAGCGTCAAGGAAGCTGCCGAGGCTTTC  1254
            ||||||.||||||.||||.|||||||||||||.||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 1139  TCCCCAGCTCCATCGGCAGGTCCCCTGACAGCATCCTTGTCACGGCCAGTGTGAAGGAAGCAGCAGAAGCCTTC  1212

Query 1255  CTAGGCTTTTCCTATGCGCCTCCCACGGACTCTTTACTC  1293
            ||.|||||.||||||||.|||||...|||.||.||.|||
Sbjct 1213  CTCGGCTTCTCCTATGCACCTCCTGTGGATTCCTTCCTC  1251