Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473658
• Subject: NM_011361.3
• Aligned Length: 1295
• Identities: 1148
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGACGGTGAAAACTGAGGCTGCT--AAGGGCACCCTCACTTACTCCAGGATGAGGGGCATGGTGGCAATTCTC  72
            |||||.||.|||.|.|||||||||  ||  |||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct    1  ATGACCGTCAAAGCCGAGGCTGCTCGAA--GCACCCTTACCTACTCCAGAATGAGGGGAATGGTAGCGATTCTC  72

Query   73  ATCGCTTTCATGAAGCAGAGGAGGATGGGTCTGAACGACTTTATTCAGAAGATTGCCAATAACTCCTATGCATG  146
            ||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||..|||.||||||||||
Sbjct   73  ATCGCTTTTATGAAACAGAGAAGGATGGGCCTGAACGATTTTATTCAGAAGATTGCCAGCAACACCTATGCATG  146

Query  147  CAAACACCCTGAAGTTCAGTCCATCTTGAAGATCTCCCAACCTCAGGAGCCTGAGCTTATGAATGCCAACCCTT  220
            |||||||.||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|
Sbjct  147  CAAACACGCTGAAGTTCAGTCCATTTTGAAAATGTCCCATCCTCAGGAGCCGGAGCTTATGAACGCTAACCCCT  220

Query  221  CTCCTCCACCAAGTCCTTCTCAGCAAATCAACCTTGGCCCGTCGTCCAATCCTCATGCTAAACCATCTGACTTT  294
            |||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||
Sbjct  221  CTCCTCCGCCAAGTCCCTCTCAACAAATCAACCTGGGTCCGTCCTCCAACCCTCACGCCAAACCCTCCGACTTT  294

Query  295  CACTTCTTGAAAGTGATCGGAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTAGCAAGACACAAGGCAGAAGAAGTGTT  368
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  295  CACTTCTTGAAAGTGATCGGAAAGGGCAGTTTTGGAAAGGTTCTTCTGGCTAGGCACAAGGCAGAAGAAGTATT  368

Query  369  CTATGCAGTCAAAGTTTTACAGAAGAAAGCAATCCTGAAAAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCGGAGCGGA  442
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  369  CTATGCAGTCAAAGTTTTACAGAAGAAAGCCATCCTGAAGAAGAAAGAGGAGAAGCATATTATGTCAGAGCGGA  442

Query  443  ATGTTCTGTTGAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCTTTCCAGACTGCTGACAAATTG  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||..|.
Sbjct  443  ATGTTCTGTTGAAGAATGTGAAGCACCCTTTCCTGGTGGGCCTTCACTTCTCATTCCAGACCGCTGACAAGCTC  516

Query  517  TACTTTGTCCTAGACTACATTAATGGTGGAGAGTTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAACGCTGCTTCCTGGAACC  590
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  517  TACTTTGTCCTGGACTACATTAATGGTGGAGAGCTGTTCTACCATCTCCAGAGGGAGCGCTGCTTCCTGGAACC  590

Query  591  ACGGGCTCGTTTCTATGCTGCTGAAATAGCCAGTGCCTTGGGCTACCTGCATTCACTGAACATCGTTTATAGAG  664
            |||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  591  ACGGGCTCGATTCTACGCAGCTGAAATAGCCAGTGCCCTGGGCTATCTGCACTCCCTAAACATCGTTTATAGAG  664

Query  665  ACTTAAAACCAGAGAATATTTTGCTAGATTCACAGGGACACATTGTCCTTACTGACTTCGGACTCTGCAAGGAG  738
            ||||||||||.|||||||||.|.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct  665  ACTTAAAACCTGAGAATATTCTCCTAGACTCCCAGGGGCACATCGTCCTCACTGACTTTGGGCTCTGCAAAGAG  738

Query  739  AACATTGAACACAACAGCACAACATCCACCTTCTGTGGCACGCCGGAGTATCTCGCACCTGAGGTGCTTCATAA  812
            ||.|||||.||.|||.|.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct  739  AATATTGAGCATAACGGGACAACATCTACCTTCTGTGGCACGCCTGAGTATCTGGCTCCTGAGGTCCTCCATAA  812

Query  813  GCAGCCTTATGACAGGACTGTGGACTGGTGGTGCCTGGGAGCTGTCTTGTATGAGATGCTGTATGGCCTGCCGC  886
            ||||||.||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  813  GCAGCCGTATGACCGGACGGTGGACTGGTGGTGTCTTGGGGCTGTCCTGTATGAGATGCTCTACGGCCTGCCCC  886

Query  887  CTTTTTATAGCCGAAACACAGCTGAAATGTACGACAACATTCTGAACAAGCCTCTCCAGCTGAAACCAAATATT  960
            |.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  887  CGTTTTATAGCCGGAACACGGCTGAGATGTACGACAATATTCTGAACAAGCCTCTCCAGTTGAAACCAAATATT  960

Query  961  ACAAATTCCGCAAGACACCTCCTGGAGGGCCTCCTGCAGAAGGACAGGACAAAGCGGCTCGGGGCCAAGGATGA  1034
            |||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||.||||.||.|||||||||||
Sbjct  961  ACAAACTCGGCAAGGCACCTCCTGGAAGGCCTCCTGCAGAAGGACCGGACCAAGAGGCTGGGTGCCAAGGATGA  1034

Query 1035  CTTCATGGAGATTAAGAGTCATGTCTTCTTCTCCTTAATTAACTGGGATGATCTCATTAATAAGAAGATTACTC  1108
            |||.||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1035  CTTTATGGAGATTAAGAGTCATATTTTCTTCTCTTTAATTAACTGGGATGATCTCATCAATAAGAAGATTACAC  1108

Query 1109  CCCCTTTTAACCCAAATGTGAGTGGGCCCAACGACCTACGGCACTTTGACCCCGAGTTTACCGAAGAGCCTGTC  1182
            ||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1109  CCCCATTTAACCCAAATGTGAGTGGGCCCAGTGACCTTCGGCACTTCGATCCCGAGTTTACCGAGGAGCCGGTC  1182

Query 1183  CCCAACTCCATTGGCAAGTCCCCTGACAGCGTCCTCGTCACAGCCAGCGTCAAGGAAGCTGCCGAGGCTTTCCT  1256
            ||||.||||||.||||.|||||||||||||.||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1183  CCCAGCTCCATCGGCAGGTCCCCTGACAGCATCCTTGTCACGGCCAGTGTGAAGGAAGCAGCAGAAGCCTTCCT  1256

Query 1257  AGGCTTTTCCTATGCGCCTCCCACGGACTCTTTACTC  1293
            .|||||.||||||||.|||||...|||.||.||.|||
Sbjct 1257  CGGCTTCTCCTATGCACCTCCTGTGGATTCCTTCCTC  1293