Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473728
• Subject: XM_005269893.3
• Aligned Length: 1689
• Identities: 1518
• Gaps: 168

Alignment

Query    1  ATGAGGCACTGCATTAATTGCTGCATACAGCTGTTACCCGACGGCGCACACAAGCAGCAGGTCAACTGCCAAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGCACTGCATTAATTGCTGCATACAGCTGTTACCCGACGGCGCACACAAGCAGCAGGTCAACTGCCAAGG  74

Query   75  GGGCCCCCATCACGGTCACCAGGCGTGCCCCACGTGCAAAGGAGAAAACAAAATTCTGTTTCGTGTGGACAGTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGCCCCCATCACGGTCACCAGGCGTGCCCCACGTGCAAAGGAGAAAACAAAATTCTGTTTCGTGTGGACAGTA  148

Query  149  AGCAGATGAACTTGCTTGCTGTTCTCGAAGTGAGGACTGAAGGGAACGAAAACTGGGGTGGGTTTTTGCGCTTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCAGATGAACTTGCTTGCTGTTCTCGAAGTGAGGACTGAAGGGAACGAAAACTGGGGTGGGTTTTTGCGCTTC  222

Query  223  AAAAAGGGGAAGCGATGTAGCCTCGTTTTTGGACTGATAATAATGACCTTGGTAATGGCTTCTTACATCCTTTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAAAGGGGAAGCGATGTAGCCTCGTTTTTGGACTGATAATAATGACCTTGGTAATGGCTTCTTACATCCTTTC  296

Query  297  TGGGGCCCACCAAGAGCTTCTGATCTCATCACCTTTCCATTACGGAGGCTTCCCCAGCAACCCCAGCTTGATGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGGGCCCACCAAGAGCTTCTGATCTCATCACCTTTCCATTACGGAGGCTTCCCCAGCAACCCCAGCTTGATGG  370

Query  371  ACAGCGAAAACCCAAGTGACACAAAGGAGCATCACCACCAATCCTCTGTAAATAATATTTCATACATGAAGGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAGCGAAAACCCAAGTGACACAAAGGAGCATCACCACCAATCCTCTGTAAATAATATTTCATACATGAAGGAC  444

Query  445  TATCCAAGCATTAAATTAATTATCAACAGCATCACAACTAGGATTGAGTTCACGACCAGACAGCTCCCAGACTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATCCAAGCATTAAATTAATTATCAACAGCATCACAACTAGGATTGAGTTCACGACCAGACAGCTCCCAGACTT  518

Query  519  AGAAGACCTTAAGAAGCAGGAGTTGCATATGTTTTCAGTCATCCCCAACAAATTCCTTCCAAACAGTAAGAGCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAAGACCTTAAGAAGCAGGAGTTGCATATGTTTTCAGTCATCCCCAACAAATTCCTTCCAAACAGTAAGAGCC  592

Query  593  CCTGTTGGTACGAGGAGTTCTCGGGGCAGAACACCACCGACCCCTACCTCACCAACTCCTACGTGCTCTACTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTGTTGGTACGAGGAGTTCTCGGGGCAGAACACCACCGACCCCTACCTCACCAACTCCTACGTGCTCTACTCC  666

Query  667  AAGCGCTTCCGCTCCACCTTCGACGCCCTGCGCAAGGCCTTCTGGGGCCACCTGGCGCACGCGCACGGGAAGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGCGCTTCCGCTCCACCTTCGACGCCCTGCGCAAGGCCTTCTGGGGCCACCTGGCGCACGCGCACGGGAAGCA  740

Query  741  CTTCCGCCTGCGCTGCCTGCCGCACTTCTACATCATAGGGCAGCCCAAGTGCGGGACCACAGACCTCTATGACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTCCGCCTGCGCTGCCTGCCGCACTTCTACATCATAGGGCAGCCCAAGTGCGGGACCACAGACCTCTATGACC  814

Query  815  GCCTGCGGCTGCACCCTGAGGTCAAGTTCTCCGCCATCAAGGAGCCACACTGGTGGACCCGGAAGCGCTTTGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCTGCGGCTGCACCCTGAGGTCAAGTTCTCCGCCATCAAGGAGCCACACTGGTGGACCCGGAAGCGCTTTGGA  888

Query  889  ATCGTCCGCCTAAGAGATGGGCTGCGAGACCGCTATCCCGTGGAAGATTATCTGGACCTCTTTGACCTGGCCGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATCGTCCGCCTAAGAGATGGGCTGCGAGACCGCTATCCCGTGGAAGATTATCTGGACCTCTTTGACCTGGCCGC  962

Query  963  ACACCAGATCCATCAAGGACTGCAGGCCAGCTCTGCAAAGGAGCAGAGCAAGATGAATACAATCATTATCGGGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACACCAGATCCATCAAGGACTGCAGGCCAGCTCTGCAAAGGAGCAGAGCAAGATGAATACAATCATTATCGGGG  1036

Query 1037  AGGCCAGTGCCTCCACGATGTGGGATAATAATGCCTGGACGTTCTTCTACGACAACAGCACGGATGGCGAGCCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGCCAGTGCCTCCACGATGTGGGATAATAATGCCTGGACGTTCTTCTACGACAACAGCACGGATGGCGAGCCA  1110

Query 1111  CCGTTTCTGACGCAGGACTTCATCCACGCCTTTCAGCCAAATGCCAGACTGATTGTCATGCTCAGGGACCCTGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCGTTTCTGACGCAGGACTTCATCCACGCCTTTCAGCCAAATGCCAGACTGATTGTCATGCTCAGGGACCCTGT  1184

Query 1185  GGAGAGGTTGTACTCAGACTATCTCTACTTTGCAAGTTCGAATAAATCCGCGGACGACTTCCATGAGAAAGTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGAGGTTGTACTCAGACTATCTCTACTTTGCAAGTTCGAATAAATCCGCGGACGACTTCCATGAGAAAGTGA  1258

Query 1259  CAGAAGCACTGCAGCTGTTTGAAAATTGCATGCTTGATTATTCACTGCGCGCCTGCGTCTACAACAACACCCTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGAAGCACTGCAGCTGTTTGAAAATTGCATGCTTGATTATTCACTGCGCGCCTGCGTCTACAACAACACCCTC  1332

Query 1333  AACAACGCCATGCCTGTGAGGCTCCAGGTTGGGCTCTATGCTGTGTACCTTCTGGACTGGCTCAGCGTTTTTGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AACAACGCCATGCCTGTGAGGCTCCAGGTTGGGCTCTATGCTGTGTACCTTCTGGACTGGCTCAGCGTTTTTGA  1406

Query 1407  CAAGCAACAGTTTCTCATTCTTCGCCTGGAAGATCATGCATCCAACGTCAAGTACACCATGCACAAGGTCTTCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAGCAACAGTTTCTCATTCTTCGCCTGGAAGATCATGCATCCAACGTCAAGTACACCATGCACAAGGTCTTCC  1480

Query 1481  AGTTTCTGAACCTAGGGCCCTTAAGTGAGAAGCAG-GAGGC-----TTTGATGACCAAGAGCCCCGCATCCAAT  1548
            ||||||||||||||||       |||.|| |||.| |.|||     ||||          ||           |
Sbjct 1481  AGTTTCTGAACCTAGG-------AGTCAG-AGCCGTGTGGCTGAGTTTTG----------GC-----------T  1525

Query 1549  GCACGGCGTCCCGAGGACCGGAACCTGGGGCCCATGTGGCCCATCACACAGAAGATTCTGCGGGATTTCTACAG  1622
            ||                                                                        
Sbjct 1526  GC------------------------------------------------------------------------  1527

Query 1623  GCCCTTCAACGCTAGGCTGGCGCAGGTCCTCGCGGATGAGGCGTTTGCGTGGAAGACGACG  1683
                                                                         
Sbjct 1528  -------------------------------------------------------------  1527