Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473765
• Subject: XM_006520806.2
• Aligned Length: 1242
• Identities: 1112
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGACAGTGAGGGGGGATGTGCTGGCCCCGGATCCAGCGTCGCCCACGACCGCAGCAGCCTCGCCCAGCGTCTC  74
            ||||||||||||||||..|.|||||||||.||.||||||||.|||||.|||.||.||||.||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGACAGTGAGGGGGGCCGCGCTGGCCCCAGACCCAGCGTCACCCACAACCACAACAGCTTCACCTAGCGTCTC  74

Query   75  CGTGATCCCCGAGGGCAGCCCCACTGCCATGGAGCAGCCTGTGTTCCTGATGACAACTGCCGCTCAGGCCATCT  148
            .|..|.||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct   75  TGCCACCCCCGAGGGCAGCCCCACAGCCATGGAGCACCCTGTGTTCCTGATGACCACTGCCGCCCAGGCCATCT  148

Query  149  CTGGCTTCTTCGTGTGGACGGCCCTGCTCATCACATGCCACCAGATCTACATGCACCTGCGCTGCTACAGCTGC  222
            |.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.
Sbjct  149  CCGGCTTCTTTGTGTGGACAGCTCTGCTCATCACTTGCCACCAGATCTACATGCATCTGCGCTGCTACAGCCGT  222

Query  223  CCCAACGAGCAGCGCTACATCGTGCGCATCCTCTTCATCGTGCCCATCTACGCCTTTGACTCCTGGCTCAGCCT  296
            |||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCAATGAGCAGCGCCACATCGTGCGCATCCTCTTCATCGTGCCCATCTACGCCTTCGACTCCTGGCTCAGCCT  296

Query  297  CCTCTTCTTCACCAACGACCAGTACTACGTGTACTTCGGCACCGTCCGCGACTGCTATGAGGCCTTGGTCATCT  370
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  CCTCTTCTTCACCAATGACCAGTACTACGTGTACTTCGGCACCGTCCGAGACTGCTATGAGGCCTTTGTCATCT  370

Query  371  ATAATTTCCTGAGCCTGTGCTATGAGTACCTAGGAGGAGAAAGTTCCATCATGTCGGAGATCAGAGGAAAACCC  444
            ||||.|||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||..||
Sbjct  371  ATAACTTCCTGAGCTTGTGCTATGAGTACCTCGGGGGAGAGAGTGCCATCATGTCTGAGATCAGAGGGAAGGCC  444

Query  445  ATTGAGTCCAGCTGTATGTATGGCACCTGCTGCCTCTGGGGAAAGACTTATTCCATCGGATTTCTGAGGTTCTG  518
            ||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.|||||||
Sbjct  445  ATTGAGTCCAGCTGTATGTACGGCACGTGCTGCCTCTGGGGAAAGACCTACTCCATCGGATTCCTGCGGTTCTG  518

Query  519  CAAACAGGCCACCCTGCAGTTCTGTGTGGTGAAGCCACTCATGGCGGTCAGCACTGTGGTCCTCCAGGCCTTCG  592
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||..|.|||||||||||.|
Sbjct  519  TAAACAGGCCACCCTGCAGTTCTGTGTGGTGAAGCCACTCATGGCCGTCAGCACCGTTATACTCCAGGCCTTTG  592

Query  593  GCAAGTACCGGGATGGGGACTTTGACGTCACCAGTGGCTACCTCTACGTGACCATCATCTACAACATCTCCGTC  666
            |||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAAGTACCGGGACGGAGACTTTGATGTCACCAGTGGGTACCTCTACGTGACCATCATCTACAACATCTCCGTC  666

Query  667  AGCCTGGCCCTCTACGCCCTCTTCCTCTTCTACTTCGCCACCCGGGAGCTGCTCAGCCCCTACAGCCCCGTCCT  740
            |||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  AGCCTGGCCCTATATGCGCTCTTCCTCTTCTACTTTGCCACAAGGGAGCTGCTCAGCCCCTACAGCCCTGTCCT  740

Query  741  CAAGTTCTTCATGGTCAAGTCCGTCATCTTTCTTTCCTTCTGGCAAGGCATGCTCCTGGCCATCCTGGAGAAGT  814
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||
Sbjct  741  CAAGTTCTTCATGGTCAAGTCCGTCATATTCCTCTCCTTCTGGCAAGGCATGCTGCTGGCCATCTTAGAGAAGT  814

Query  815  GTGGGGCCATCCCCAAAATCCACTCGGCCCGCGTGTCGGTGGGCGAGGGCACCGTGGCTGCCGGCTACCAGGAC  888
            |.||||||||||||||.|||.||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCGGGGCCATCCCCAAGATCAACTCAGCGCGAGTGTCAGTGGGTGAGGGCACCGTGGCTGCCGGCTACCAGGAC  888

Query  889  TTCATCATCTGTGTGGAGATGTTCTTTGCAGCCCTGGCCCTGCGGCACGCCTTCACCTACAAGGTCTATGCTGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  TTCATCATCTGTGTGGAGATGTTCTTCGCGGCCTTGGCCCTGCGGCATGCCTTCACCTACAAGGTCTACGCTGA  962

Query  963  CAAGAGGCTGGACGCACAA---------------------GGCCGCTGTGCCCCCATGAAGAGCATCTCCAGCA  1015
            ||||||.||||||||.|||                     ||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGAGACTGGACGCTCAAGTGCTGACGTACGGCCCATACGGCCGCTGCGCCCCCATGAAGAGCATCTCCAGCA  1036

Query 1016  GCCTCAAGGAGACCATGAACCCGCACGACATCGTGCAGGACGCCATCCACAACTTCTCACCTGCCTACCAGCAG  1089
            |||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1037  GCCTCAAAGAGACCATGAACCCACACGATATTGTGCAGGACGCCATCCACAACTTCTCGCCAGCCTACCAGCAG  1110

Query 1090  TACACGCAGCAGTCCACCCTGGAGCCTGGGCCCACCTGGCGTGGTGGCGCCCACGGCCTCTCCCGCTCCCACAG  1163
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.|.|||.||||.||||||||||||||
Sbjct 1111  TACACGCAGCAGTCCACTCTGGAGCCCGGGCCCACCTGGCGTGGCGGCACGCACAGCCTTTCCCGCTCCCACAG  1184

Query 1164  CCTCAGTGGCGCCCGCGACAACGAGAAGACTCTCCTGCTCAGCTCTGATGATGAATTC  1221
            |||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1185  CCTTAGTGGTGCACGCGACAATGAGAAGACTCTGCTGCTCAGCTCTGATGATGAGTTC  1242