Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473795
• Subject: NM_178681.4
• Aligned Length: 2394
• Identities: 2129
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGACAAACCAGGAAAAATGGGCCCACCTCAGCCCTTCGGAATTTTCCCAACTTCAGAAATATGCTGAGTATTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACAAACCAGGAAAAATGGGCCCATCTCAGCCCCTCAGAATTTTCCCAACTTCAGAAATATGCTGAGTATTC  74

Query   75  TACAAAGAAATTAAAGGATGTTCTTGAAGAATTCCATGGTAATGGTGTGCTTGCAAAGTATAATCCTGAAGGGA  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TACAAAGAAATTAAAGGATGTTCTTGAAGAATTCCATGGTAATGGCGTGCTTGCAAAGTATAATCCTGAAGGGA  148

Query  149  CAATAGATTTTGAAGGTTTCAAACTATTCATGAAGACATTCCTGGAAGCCGAGCTTCCTGATGATTTCACTGCA  222
            |.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.
Sbjct  149  CCATAGATTTTGAAGGCTTCAAGCTATTCATGAAGACCTTTCTGGAAGCTGAGCTGCCTGACGATTTCACCGCC  222

Query  223  CACCTTTTCATGTCATTTAGCAACAAGTTTCCTCATTCTAGTCCAATGGTAAAAAGTAAGCCTGCTCTCCTATC  296
            ||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||..|||||.||||||||.|||||.||.||
Sbjct  223  CACCTTTTTATGTCATTCAGCAACAAATTTCCCCATTCTAGCCCAAATGTAAAGAGTAAGCCCGCTCTTCTTTC  296

Query  297  AGGCGGTCTGAGAATGAATAAAGGTGCCATCACCCCTCCCCGAACTACTTCTCCTGCAAATACGTGTTCCCCAG  370
            |||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||   |.|.|||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  297  AGGTGGTCTCAGGATGAATAAGGGTGCCATCACCCCTCCACG---TTCCTCTCCAGCAAATACATGCTCCCCAG  367

Query  371  AAGTAATCCATCTGAAGGACATTGTCTGTTACCTGTCTCTGCTTGAAAGAGGAAGACCTGAGGATAAGCTTGAG  444
            ||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  368  AAGTGATCCACCTCAAGGATATCGTCTGCTACCTGTCTCTTCTCGAAAGAGGAAGACCCGAGGATAAGCTCGAG  441

Query  445  TTTATGTTTCGCCTTTATGACACGGATGGGAATGGCTTCCTGGACAGCTCGGAGCTAGAAAATATCATCAGTCA  518
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||..||||
Sbjct  442  TTTATGTTTCGCCTTTATGACACCGATGGGAATGGCTTCCTGGACAGCTCGGAATTAGAAAATATTATTGGTCA  515

Query  519  GATGATGCATGTTGCAGAATACCTTGAGTGGGATGTCACTGAACTTAATCCAATCCTCCATGAAATGATGGAAG  592
            |||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  516  GATGATGCACGTGGCAGAGTACCTCGAATGGGATGTTACCGAACTTAATCCGATCCTTCATGAAATGATGGAAG  589

Query  593  AAATTGACTATGATCATGATGGAACCGTGTCTCTGGAGGAATGGATTCAAGGAGGAATGACAACGATTCCACTT  666
            |||||||||||||.|..|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  590  AAATTGACTATGACCGGGATGGCACTGTGTCTCTGGAGGAGTGGATTCAAGGAGGAATGACAACTATCCCACTT  663

Query  667  CTTGTGCTCCTGGGCTTAGAAAATAACGTGAAAGGATGATGGACAGCACGTGTGGCGACT-GAGCACTTTAACA  739
            ||.||.||.||||||||.||.|||||.||| |||||||||||||||||.||||||||||| .||||||||||||
Sbjct  664  CTAGTCCTGCTGGGCTTGGAGAATAATGTG-AAGGATGATGGACAGCATGTGTGGCGACTCAAGCACTTTAACA  736

Query  740  AACCTG-CTA-TGCA--CTTTG-CTG-ACATGCTGATT-GCGTGGGGAAGCAGG--CTCTGCTGTTCCTTCTGC  804
            |.|||| ||| ||||  ||.|| ||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||.|||||||||
Sbjct  737  AGCCTGCCTACTGCAATCTCTGCCTGAACATGCTGATTGGCGTGGGGAAGCAGGGCCTCTGCTGCTCCTTCTGC  810

Query  805  -AGTACACAGTCCATGAGCGCTGTGTGGCTCGAGCACCTCCCTCTTGCATCAAGACCTATGTGAAGTCCAAAAG  877
             |||||||.||||||||||||||||||||..||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|.
Sbjct  811  AAGTACACGGTCCATGAGCGCTGTGTGGCCAGAGCCCCGCCCTCCTGCATCAAGACATATGTGAAGTCCAAGAA  884

Query  878  GAACACTGATGTCATGCACCATTACTGGGTTGAAGGTAACTGCCCAACCAAGTGTGATAAGTGCCACAAAACTG  951
            .|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  885  AAACACAGACGTCATGCACCACTATTGGGTCGAAGGCAATTGCCCAACCAAGTGCGATAAGTGCCACAAAACAG  958

Query  952  TTAAATGTTACCAGGGCCTGACAGGACTGCATTGTGTTTGGTGTCAGATCACACTGCATAATAAATGTGCTTCT  1025
            |.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  959  TGAAATGTTACCAGGGCCTGACGGGCCTGCATTGTGTTTGGTGCCAGACCACACTGCACAATAAATGTGCTTCT  1032

Query 1026  CATCTAAAACCTGAATGTGACTGTGGACCTTTGAAGGACCATATTTTACCACCCACAACAATCTGTCCAGTGGT  1099
            |||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1033  CATCTGAAGCCCGAGTGTGACTGTGGACCCTTGAAGGACCATATTTTGCCACCTACCACAATCTGTCCAGTTGT  1106

Query 1100  ACTGCAGACTCTGCCCACTTCAGGAGTTTCAGTTCCTGAGGAAAGACAATCAACAGTGAAAAAGGAAAAGAGTG  1173
            |.|   ||||.||||||.|.|.||||..||||||||||||||||||||.||.||||..||||||||||||||..
Sbjct 1107  ATT---GACTATGCCCAGTGCTGGAGCCTCAGTTCCTGAGGAAAGACAGTCCACAGCTAAAAAGGAAAAGAGCA  1177

Query 1174  GTTCCCAGCAGCCAAACAAAGTGATTGACAAGAATAAAATGCAAAGAGCCAACTCTGTTACTGTAGATGGACAA  1247
            |.||||||||||||||.||||..|..|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||||||
Sbjct 1178  GCTCCCAGCAGCCAAATAAAGCAACAGACAAAAATAAAATGCAAAGAGCTAACTCAGTTACTATGGATGGACAA  1251

Query 1248  GGCCTGCAGGTCACTCCTGTGCCTGGTACTCACCCACTTTTAGTTTTTGTGAACCCCAAAAGTGGTGGAAAACA  1321
            ||..|||||.||||||||||.|||||.||.||.||.|||.||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1252  GGTTTGCAGATCACTCCTGTTCCTGGCACACATCCGCTTCTAGTTTTTGTCAACCCTAAAAGTGGTGGGAAGCA  1325

Query 1322  AGGAGAACGAATTTACAGAAAATTCCAGTATCTATTAAATCCTCGTCAGGTTTACAGTCTTTCTGGAAATGGAC  1395
            |||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326  AGGAGAACGAATTTACAGAAAATTCCAGTATCTCCTAAATCCTCGTCAGGTTTACAGTCTTTCTGGAAATGGAC  1399

Query 1396  CAATGCCAGGGTTAAACTTTTTCCGTGATGTTCCTGACTTCAGAGTGTTAGCCTGTGGTGGAGATGGAACCGTG  1469
            ||||||||||||||.|||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1400  CAATGCCAGGGTTACACTTTTTTCGCGATGTCCCTGACTTCAGAGTGTTAGCATGCGGTGGAGATGGGACTGTG  1473

Query 1470  GGCTGGGTTTTGGATTGCATAGAAAAGGCCAATGTAGGCAAGCATCCTCCAGTTGCGATTCTGCCTCTTGGGAC  1543
            ||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1474  GGCTGGATTTTGGATTGCATAGAGAAGGCCAATGTAGTCAAGCACCCTCCAGTTGCCATCCTGCCTCTTGGGAC  1547

Query 1544  TGGCAATGATCTAGCAAGATGCCTGCGATGGGGAGGAGGTTACGAAGGTGAGGATCTGATGAAAATTTTAAAAG  1617
            |||||||||..|||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||..||||.|||||.||..||||||
Sbjct 1548  TGGCAATGACTTAGCAAGGTGCCTGCGGTGGGGTGGAGGTTATGAAGGGGAAAATCTTATGAAGATCCTAAAAG  1621

Query 1618  ACATTGNAAACAGCACAGAAATCATG-TGGACAGGTGGAAGTTTGAAAGTCATACNTAATGACAAGNATGAGAA  1690
            ||||||.||.|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||.||..||.|||||..|||||||
Sbjct 1622  ACATTGAAAGCAGCACAGAAATCATGCTGGACAGGTGGAAGTTTG-AAGTCACACCCAACGACAAAGATGAGAA  1694

Query 1691  AGGAGACCCAGTGCCTANCAGTATCATCAATAATTACTTTTCCATTGGCGTGGATGCCTCCATGNCACACAGAT  1764
            |||||||||.||||||..|||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 1695  AGGAGACCCTGTGCCTTACAGCATCATCAATAACTACTTTTCCATTGGCGTGGATGCCTCCATTGCACACAGAT  1768

Query 1765  TCCACATCATGAGAGAAAAACACCCNAGAGAAATTCAACAGTAGAATGAAGAACAAATTTTGGTATTTTGAGTT  1838
            |||||||||||||||||||.||||| |||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1769  TCCACATCATGAGAGAAAAGCACCC-AGAGAAATTCAACAGCCGAATGAAGAACAAATTTTGGTACTTTGAGTT  1841

Query 1839  TGGCACATCTGAAACTTTCTCAGCCACCTGCAAGAAGCTACATGAATCTGTAGAAATAGAATGTGATGGAGTAC  1912
            |||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842  TGGCACATCTGAAACCTTCTCAGCGACCTGCAAGAAGCTGCATGAATCTGTAGAAATAGAATGTGATGGAGTAC  1915

Query 1913  AGATAGATTTAATAAACATCTCTCTGGAAGGAATTGCTATTTTGAATATACCAAGCATGCATGGAGGATCCAAT  1986
            |.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1916  AAATAGATTTGATAAACATCTCTCTGGAAGGAATTGCAATTTTGAATATACCAAGCATGCATGGAGGATCTAAT  1989

Query 1987  CTTTGGGGAGAGTCTAAGAAAAGACGAAGCCATCGACGAATAGAGAAAAAAGGGTCTGACAAAAGGACCACCGT  2060
            |||||||||||||||||.||.|.|.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||..|
Sbjct 1990  CTTTGGGGAGAGTCTAAAAAGAAAAGAAGCCATCGACGAATAGAGAAAAAAGGCTCTGACAAAAGACCCACTCT  2063

Query 2061  CACAGATGCCAAAGAGTTGAAGTTTGCAAGTCAAGATCTCAGTGACCAGCTGCTGGAGGTGGTCGGCTTGGAAG  2134
            |||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 2064  CACAGATGCAAAAGAGCTGAAGTTTGCAAGTCAAGATCTGAGTGACCAGCTGCTGGAGGTCGTTGGCTTGGAAG  2137

Query 2135  GAGCCATGGAGATGGGGCAAATATACACAGGCCTGAAAAGTGCTGGCCGGCGGCTGGCTCAGTGCTCCTGCGTG  2208
            ||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 2138  GAGCAATGGAAATGGGCCAAATTTACACGGGCCTGAAAAGTGCGGGCCGGCGGCTGGCTCAGTGCTCCTCTGTG  2211

Query 2209  GTCATCAGGACGAGCAAGTCTCTGCCAATGCAAATTGATGGGGAGCCATGGATGCAGACCCCATGCACAATAAA  2282
            ||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212  GTTATCAGAACAAGCAAGTCACTGCCAATGCAGATTGATGGAGAGCCCTGGATGCAGACCCCATGCACAATAAA  2285

Query 2283  AATTACACACAAGAACCAAGCCCCAATGCTGATGGGCCCGCCTCCAAAAACCGGTTTATTCTGCTCCCTCGTCA  2356
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||..|||
Sbjct 2286  AATTACACACAAGAACCAAGCCCCAATGCTGATGGGCCCTCCACCCAAAACTGGATTATTCTGCTCACTTATCA  2359

Query 2357  AAAGGACAAGAAACCGAAGCAAGGAA  2382
            ||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 2360  AAAGAACAAGAAACCGAAGCAAGGAG  2385